MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016831	GCG	2	6	1253639	1253644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954942
21502	NC_016831	TGCT	2	8	1253665	1253672	0 %	50 %	25 %	25 %	378954942
21503	NC_016831	GC	3	6	1253754	1253759	0 %	0 %	50 %	50 %	378954942
21504	NC_016831	TCTT	2	8	1253812	1253819	0 %	75 %	0 %	25 %	378954942
21505	NC_016831	ATT	2	6	1253964	1253969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954942
21506	NC_016831	GCCC	2	8	1253975	1253982	0 %	0 %	25 %	75 %	378954942
21507	NC_016831	CGA	2	6	1253989	1253994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954942
21508	NC_016831	TGA	2	6	1254010	1254015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954942
21509	NC_016831	AGG	2	6	1254156	1254161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954943
21510	NC_016831	CAA	2	6	1254253	1254258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954943
21511	NC_016831	GTG	2	6	1254395	1254400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954943
21512	NC_016831	GC	3	6	1254404	1254409	0 %	0 %	50 %	50 %	378954943
21513	NC_016831	CAT	2	6	1254475	1254480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954943
21514	NC_016831	CAT	2	6	1254484	1254489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954943
21515	NC_016831	T	6	6	1254524	1254529	0 %	100 %	0 %	0 %	378954943
21516	NC_016831	TTA	2	6	1254667	1254672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954943
21517	NC_016831	ATGG	2	8	1254724	1254731	25 %	25 %	50 %	0 %	378954943
21518	NC_016831	CAG	2	6	1254756	1254761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954943
21519	NC_016831	AAC	2	6	1254797	1254802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954943
21520	NC_016831	CAGG	2	8	1254955	1254962	25 %	0 %	50 %	25 %	378954944
21521	NC_016831	AATG	2	8	1254981	1254988	50 %	25 %	25 %	0 %	378954944
21522	NC_016831	GAT	2	6	1255014	1255019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954944
21523	NC_016831	CAG	2	6	1255039	1255044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954944
21524	NC_016831	ATTA	2	8	1255057	1255064	50 %	50 %	0 %	0 %	378954944
21525	NC_016831	TTA	2	6	1255128	1255133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954945
21526	NC_016831	CGA	2	6	1255135	1255140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954945
21527	NC_016831	TGC	2	6	1255152	1255157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954945
21528	NC_016831	A	6	6	1255244	1255249	100 %	0 %	0 %	0 %	378954945
21529	NC_016831	ATT	2	6	1255270	1255275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954945
21530	NC_016831	T	7	7	1255476	1255482	0 %	100 %	0 %	0 %	378954946
21531	NC_016831	CCA	2	6	1255508	1255513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954946
21532	NC_016831	TTA	2	6	1255528	1255533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954946
21533	NC_016831	GCA	2	6	1255612	1255617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954946
21534	NC_016831	TAA	2	6	1255629	1255634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954946
21535	NC_016831	ATGTG	2	10	1255703	1255712	20 %	40 %	40 %	0 %	378954947
21536	NC_016831	GCA	2	6	1255769	1255774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954947
21537	NC_016831	A	8	8	1255789	1255796	100 %	0 %	0 %	0 %	378954947
21538	NC_016831	TTA	2	6	1255840	1255845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954947
21539	NC_016831	CGG	2	6	1255897	1255902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954947
21540	NC_016831	GAA	2	6	1255944	1255949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954947
21541	NC_016831	CAG	2	6	1255950	1255955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954947
21542	NC_016831	T	6	6	1255964	1255969	0 %	100 %	0 %	0 %	378954947
21543	NC_016831	CAC	2	6	1256104	1256109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954947
21544	NC_016831	CTG	2	6	1256206	1256211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954947
21545	NC_016831	GGT	2	6	1256288	1256293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954947
21546	NC_016831	TGA	2	6	1256302	1256307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954947
21547	NC_016831	TTA	2	6	1256346	1256351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954947
21548	NC_016831	CTG	2	6	1256503	1256508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954948
21549	NC_016831	TCT	2	6	1256539	1256544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954948
21550	NC_016831	ATT	2	6	1256662	1256667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954948
21551	NC_016831	TGGT	2	8	1256758	1256765	0 %	50 %	50 %	0 %	378954948
21552	NC_016831	TCC	2	6	1256791	1256796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954948
21553	NC_016831	CAA	2	6	1256807	1256812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954948
21554	NC_016831	TAT	2	6	1256886	1256891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954948
21555	NC_016831	ACTTC	2	10	1256971	1256980	20 %	40 %	0 %	40 %	378954949
21556	NC_016831	ATT	2	6	1257019	1257024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954949
21557	NC_016831	ATA	2	6	1257037	1257042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954949
21558	NC_016831	CAA	2	6	1257070	1257075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954949
21559	NC_016831	AG	3	6	1257080	1257085	50 %	0 %	50 %	0 %	378954949
21560	NC_016831	A	6	6	1257125	1257130	100 %	0 %	0 %	0 %	378954949
21561	NC_016831	AGC	2	6	1257173	1257178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954949
21562	NC_016831	A	6	6	1257215	1257220	100 %	0 %	0 %	0 %	378954949
21563	NC_016831	AAG	2	6	1257260	1257265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954949
21564	NC_016831	CAT	2	6	1257304	1257309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954949
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21566	NC_016831	ACG	2	6	1257746	1257751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954950
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21570	NC_016831	TGC	2	6	1257864	1257869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954950
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21574	NC_016831	A	6	6	1258010	1258015	100 %	0 %	0 %	0 %	378954950
21575	NC_016831	GGA	2	6	1258051	1258056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954950
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21583	NC_016831	CAA	2	6	1258502	1258507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954950
21584	NC_016831	ACG	2	6	1258548	1258553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954950
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21601	NC_016831	CAT	2	6	1259412	1259417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954952
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21613	NC_016831	GTT	2	6	1259979	1259984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954952
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