MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016831	GCG	2	6	915957	915962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954598
16002	NC_016831	TTG	2	6	916043	916048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954598
16003	NC_016831	CTA	2	6	916065	916070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954598
16004	NC_016831	GCA	2	6	916088	916093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954598
16005	NC_016831	T	8	8	916117	916124	0 %	100 %	0 %	0 %	378954598
16006	NC_016831	GATGG	2	10	916129	916138	20 %	20 %	60 %	0 %	378954598
16007	NC_016831	TCG	2	6	916223	916228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954598
16008	NC_016831	GAAT	2	8	916291	916298	50 %	25 %	25 %	0 %	378954599
16009	NC_016831	GGAGGG	2	12	916452	916463	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	378954599
16010	NC_016831	CCA	2	6	916514	916519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954599
16011	NC_016831	GGT	2	6	916551	916556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954599
16012	NC_016831	GCC	2	6	916561	916566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954599
16013	NC_016831	AGC	2	6	916636	916641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954599
16014	NC_016831	ACG	2	6	916831	916836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954600
16015	NC_016831	GCC	2	6	916840	916845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954600
16016	NC_016831	GCT	2	6	916864	916869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954600
16017	NC_016831	CGC	2	6	916886	916891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954600
16018	NC_016831	T	6	6	916922	916927	0 %	100 %	0 %	0 %	378954600
16019	NC_016831	CCA	2	6	916934	916939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954600
16020	NC_016831	CGG	2	6	916970	916975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954600
16021	NC_016831	TTA	2	6	917098	917103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954601
16022	NC_016831	TGA	2	6	917131	917136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954601
16023	NC_016831	GCG	2	6	917153	917158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954601
16024	NC_016831	CAG	2	6	917220	917225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954601
16025	NC_016831	GC	3	6	917235	917240	0 %	0 %	50 %	50 %	378954601
16026	NC_016831	CAG	2	6	917319	917324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954601
16027	NC_016831	GA	3	6	917420	917425	50 %	0 %	50 %	0 %	378954602
16028	NC_016831	CGA	2	6	917545	917550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954602
16029	NC_016831	GCC	2	6	917551	917556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954602
16030	NC_016831	CAC	2	6	917563	917568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954602
16031	NC_016831	GC	4	8	917613	917620	0 %	0 %	50 %	50 %	378954602
16032	NC_016831	GCG	2	6	917656	917661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16033	NC_016831	GC	3	6	917666	917671	0 %	0 %	50 %	50 %	378954602
16034	NC_016831	CAC	2	6	917722	917727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954602
16035	NC_016831	CGG	2	6	917745	917750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16036	NC_016831	GCG	2	6	917757	917762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16037	NC_016831	GAA	2	6	917767	917772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954602
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16039	NC_016831	AAT	2	6	917884	917889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954602
16040	NC_016831	GAT	2	6	917929	917934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954602
16041	NC_016831	TGA	2	6	917949	917954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954602
16042	NC_016831	GGT	2	6	918004	918009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954602
16043	NC_016831	GC	3	6	918024	918029	0 %	0 %	50 %	50 %	378954602
16044	NC_016831	GGC	2	6	918037	918042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16045	NC_016831	GCC	2	6	918055	918060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954602
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16047	NC_016831	CCG	2	6	918185	918190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954602
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16049	NC_016831	TGAA	2	8	918233	918240	50 %	25 %	25 %	0 %	378954602
16050	NC_016831	GCT	2	6	918247	918252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954602
16051	NC_016831	GCC	2	6	918301	918306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954602
16052	NC_016831	CGG	2	6	918384	918389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16053	NC_016831	GTACG	2	10	918402	918411	20 %	20 %	40 %	20 %	378954602
16054	NC_016831	CGG	2	6	918438	918443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16055	NC_016831	GC	4	8	918449	918456	0 %	0 %	50 %	50 %	378954602
16056	NC_016831	ACC	2	6	918482	918487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954602
16057	NC_016831	CGG	2	6	918489	918494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954602
16058	NC_016831	GC	5	10	918510	918519	0 %	0 %	50 %	50 %	378954602
16059	NC_016831	CGC	2	6	918628	918633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954602
16060	NC_016831	TCG	2	6	918722	918727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954602
16061	NC_016831	GC	3	6	918761	918766	0 %	0 %	50 %	50 %	378954602
16062	NC_016831	ACC	2	6	918818	918823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954602
16063	NC_016831	CTC	2	6	918859	918864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954602
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16066	NC_016831	ACGA	2	8	919290	919297	50 %	0 %	25 %	25 %	378954603
16067	NC_016831	TCG	2	6	919336	919341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954603
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16087	NC_016831	GCA	2	6	920425	920430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954604
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16090	NC_016831	CGA	2	6	920597	920602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954605
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16092	NC_016831	CGA	2	6	920762	920767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954605
16093	NC_016831	CTT	2	6	920819	920824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954605
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16101	NC_016831	GC	3	6	921081	921086	0 %	0 %	50 %	50 %	378954605
16102	NC_016831	ACG	2	6	921090	921095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954605
16103	NC_016831	GCACG	2	10	921176	921185	20 %	0 %	40 %	40 %	378954605
16104	NC_016831	ACGGC	2	10	921194	921203	20 %	0 %	40 %	40 %	378954605
16105	NC_016831	GC	3	6	921279	921284	0 %	0 %	50 %	50 %	378954605
16106	NC_016831	AAG	2	6	921385	921390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954605
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16109	NC_016831	AACC	2	8	921551	921558	50 %	0 %	0 %	50 %	378954605
16110	NC_016831	AGC	2	6	921559	921564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954605
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16112	NC_016831	CGT	2	6	921603	921608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954605
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16116	NC_016831	GC	3	6	921718	921723	0 %	0 %	50 %	50 %	378954605
16117	NC_016831	CAT	3	9	921738	921746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954605
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16481	NC_016831	CAT	2	6	940341	940346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954625
16482	NC_016831	ATG	2	6	940368	940373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954625
16483	NC_016831	CGGG	2	8	940384	940391	0 %	0 %	75 %	25 %	378954626
16484	NC_016831	TGA	2	6	940475	940480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954626
16485	NC_016831	GGC	2	6	940487	940492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954626
16486	NC_016831	CAT	2	6	940503	940508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954626
16487	NC_016831	GGC	2	6	940549	940554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954626
16488	NC_016831	GAC	2	6	940590	940595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954626
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16490	NC_016831	CTG	2	6	940635	940640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954626
16491	NC_016831	GC	3	6	940694	940699	0 %	0 %	50 %	50 %	378954626
16492	NC_016831	GC	3	6	940809	940814	0 %	0 %	50 %	50 %	378954626
16493	NC_016831	CAAC	2	8	940841	940848	50 %	0 %	0 %	50 %	378954626
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