MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016831	CT	3	6	864300	864305	0 %	50 %	0 %	50 %	378954550
15002	NC_016831	T	6	6	864364	864369	0 %	100 %	0 %	0 %	378954550
15003	NC_016831	GTC	2	6	864464	864469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954550
15004	NC_016831	ATCTAC	2	12	864475	864486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954550
15005	NC_016831	GCA	2	6	864528	864533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954550
15006	NC_016831	TGT	2	6	864570	864575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954550
15007	NC_016831	TGA	2	6	864582	864587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954550
15008	NC_016831	G	7	7	864596	864602	0 %	0 %	100 %	0 %	378954550
15009	NC_016831	CAT	2	6	864619	864624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954550
15010	NC_016831	GATG	2	8	864630	864637	25 %	25 %	50 %	0 %	378954550
15011	NC_016831	TTC	2	6	864655	864660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954550
15012	NC_016831	AT	4	8	864662	864669	50 %	50 %	0 %	0 %	378954550
15013	NC_016831	TGA	2	6	864686	864691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954550
15014	NC_016831	ATG	2	6	864715	864720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954550
15015	NC_016831	TC	3	6	864726	864731	0 %	50 %	0 %	50 %	378954550
15016	NC_016831	ATA	2	6	864771	864776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954550
15017	NC_016831	CTGG	2	8	864805	864812	0 %	25 %	50 %	25 %	378954551
15018	NC_016831	GAA	2	6	864835	864840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954551
15019	NC_016831	AAAACC	2	12	864849	864860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954551
15020	NC_016831	TGG	2	6	864873	864878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954551
15021	NC_016831	TAT	2	6	864936	864941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954551
15022	NC_016831	CTG	2	6	864942	864947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954551
15023	NC_016831	ACT	2	6	864986	864991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954551
15024	NC_016831	TTC	2	6	865095	865100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954551
15025	NC_016831	TGG	2	6	865107	865112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954551
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15029	NC_016831	AGTA	2	8	865559	865566	50 %	25 %	25 %	0 %	378954551
15030	NC_016831	GAT	2	6	865567	865572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954552
15031	NC_016831	CTGA	2	8	865652	865659	25 %	25 %	25 %	25 %	378954552
15032	NC_016831	CAGCC	2	10	865830	865839	20 %	0 %	20 %	60 %	378954552
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15035	NC_016831	TTC	2	6	866090	866095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954552
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15038	NC_016831	GCA	2	6	866263	866268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954552
15039	NC_016831	TGG	2	6	866298	866303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954552
15040	NC_016831	TA	3	6	866313	866318	50 %	50 %	0 %	0 %	378954552
15041	NC_016831	TGA	2	6	866362	866367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954552
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15043	NC_016831	TGA	2	6	866419	866424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954552
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15047	NC_016831	TTG	2	6	866753	866758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954553
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15049	NC_016831	GATG	2	8	866836	866843	25 %	25 %	50 %	0 %	378954553
15050	NC_016831	ACT	2	6	866848	866853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954553
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15052	NC_016831	A	6	6	866878	866883	100 %	0 %	0 %	0 %	378954553
15053	NC_016831	ACTG	2	8	866952	866959	25 %	25 %	25 %	25 %	378954553
15054	NC_016831	TGA	2	6	867003	867008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954553
15055	NC_016831	TTA	2	6	867011	867016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954553
15056	NC_016831	GCT	2	6	867022	867027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954553
15057	NC_016831	ATA	2	6	867104	867109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954553
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15059	NC_016831	TCG	2	6	867204	867209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954553
15060	NC_016831	TTGA	2	8	867235	867242	25 %	50 %	25 %	0 %	378954553
15061	NC_016831	CTG	2	6	867246	867251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954553
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15089	NC_016831	TA	3	6	868566	868571	50 %	50 %	0 %	0 %	378954554
15090	NC_016831	CTA	2	6	868578	868583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954554
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15094	NC_016831	A	6	6	868789	868794	100 %	0 %	0 %	0 %	378954554
15095	NC_016831	AG	3	6	868806	868811	50 %	0 %	50 %	0 %	378954554
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15482	NC_016831	GTGG	2	8	886492	886499	0 %	25 %	75 %	0 %	378954570
15483	NC_016831	AAG	2	6	886523	886528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954570
15484	NC_016831	CCAG	2	8	886566	886573	25 %	0 %	25 %	50 %	378954570
15485	NC_016831	ATC	2	6	886652	886657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954570
15486	NC_016831	CCA	2	6	886791	886796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954570
15487	NC_016831	GCAGTC	2	12	886816	886827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378954570
15488	NC_016831	TCA	2	6	886859	886864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954570
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15490	NC_016831	ATC	2	6	886967	886972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954570
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15497	NC_016831	CGCAG	2	10	887522	887531	20 %	0 %	40 %	40 %	378954571
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