MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_016831	GATCTG	2	12	838193	838204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378954528
14503	NC_016831	CGG	2	6	838378	838383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954528
14504	NC_016831	GC	3	6	838389	838394	0 %	0 %	50 %	50 %	378954528
14505	NC_016831	GCCA	2	8	838407	838414	25 %	0 %	25 %	50 %	378954528
14506	NC_016831	TAA	2	6	838510	838515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954528
14507	NC_016831	AAC	2	6	838698	838703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954528
14508	NC_016831	TCGAT	2	10	838806	838815	20 %	40 %	20 %	20 %	378954528
14509	NC_016831	CTG	2	6	838907	838912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14510	NC_016831	CGGG	2	8	838954	838961	0 %	0 %	75 %	25 %	378954528
14511	NC_016831	CAG	2	6	838982	838987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14512	NC_016831	CAG	2	6	839024	839029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14513	NC_016831	TAA	2	6	839047	839052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954528
14514	NC_016831	CAG	2	6	839054	839059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14515	NC_016831	ATT	2	6	839156	839161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954528
14516	NC_016831	GCA	2	6	839166	839171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14517	NC_016831	TGC	3	9	839205	839213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14518	NC_016831	GGA	2	6	839254	839259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954528
14519	NC_016831	GC	3	6	839309	839314	0 %	0 %	50 %	50 %	378954528
14520	NC_016831	CTG	2	6	839363	839368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14521	NC_016831	CCGA	2	8	839381	839388	25 %	0 %	25 %	50 %	378954528
14522	NC_016831	ATG	2	6	839438	839443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954528
14523	NC_016831	AAT	2	6	839453	839458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954528
14524	NC_016831	TTTG	2	8	839501	839508	0 %	75 %	25 %	0 %	378954528
14525	NC_016831	GGC	2	6	839518	839523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954528
14526	NC_016831	TCA	2	6	839526	839531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954528
14527	NC_016831	CCT	2	6	839655	839660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954528
14528	NC_016831	CG	3	6	839700	839705	0 %	0 %	50 %	50 %	378954528
14529	NC_016831	GCC	2	6	839713	839718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954528
14530	NC_016831	CTG	2	6	839732	839737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14531	NC_016831	GAGC	2	8	839740	839747	25 %	0 %	50 %	25 %	378954528
14532	NC_016831	AGC	2	6	839774	839779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14533	NC_016831	CGC	2	6	839805	839810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954528
14534	NC_016831	GACG	2	8	839824	839831	25 %	0 %	50 %	25 %	378954528
14535	NC_016831	GAC	2	6	839857	839862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954528
14536	NC_016831	TGG	2	6	839868	839873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954528
14537	NC_016831	TTA	2	6	840004	840009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954528
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14539	NC_016831	ACA	2	6	840130	840135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954529
14540	NC_016831	GCA	2	6	840177	840182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954529
14541	NC_016831	TAC	2	6	840209	840214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954529
14542	NC_016831	GAT	2	6	840237	840242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954529
14543	NC_016831	GAT	2	6	840250	840255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954529
14544	NC_016831	CTC	2	6	840258	840263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954529
14545	NC_016831	CAG	2	6	840271	840276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954529
14546	NC_016831	ACA	2	6	840279	840284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954529
14547	NC_016831	GAG	2	6	840292	840297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954529
14548	NC_016831	CG	3	6	840308	840313	0 %	0 %	50 %	50 %	378954529
14549	NC_016831	TGA	3	9	840405	840413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954529
14550	NC_016831	ACGC	2	8	840472	840479	25 %	0 %	25 %	50 %	378954529
14551	NC_016831	TG	3	6	840501	840506	0 %	50 %	50 %	0 %	378954529
14552	NC_016831	CGC	2	6	840568	840573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954529
14553	NC_016831	ATT	2	6	840592	840597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954529
14554	NC_016831	GGC	2	6	840660	840665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954529
14555	NC_016831	TGG	3	9	840692	840700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954529
14556	NC_016831	A	6	6	840847	840852	100 %	0 %	0 %	0 %	378954529
14557	NC_016831	GGC	2	6	840945	840950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954529
14558	NC_016831	CG	3	6	840987	840992	0 %	0 %	50 %	50 %	378954530
14559	NC_016831	AAT	2	6	841080	841085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954530
14560	NC_016831	GGTGCT	2	12	841100	841111	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378954530
14561	NC_016831	GCC	2	6	841155	841160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954530
14562	NC_016831	CGG	2	6	841173	841178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954530
14563	NC_016831	CAT	2	6	841188	841193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954530
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14565	NC_016831	GTC	2	6	841221	841226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954530
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14568	NC_016831	TCACG	2	10	841364	841373	20 %	20 %	20 %	40 %	378954530
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14571	NC_016831	GCG	2	6	841499	841504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954531
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14579	NC_016831	GGCTG	2	10	842022	842031	0 %	20 %	60 %	20 %	378954531
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14584	NC_016831	GTT	2	6	842318	842323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954531
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14587	NC_016831	TG	3	6	842424	842429	0 %	50 %	50 %	0 %	378954531
14588	NC_016831	GGC	2	6	842473	842478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954531
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14591	NC_016831	GCG	2	6	842545	842550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954531
14592	NC_016831	CGCGT	2	10	842612	842621	0 %	20 %	40 %	40 %	378954531
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14599	NC_016831	ATG	2	6	844089	844094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954532
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14602	NC_016831	GCT	2	6	844234	844239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954532
14603	NC_016831	CGG	3	9	844246	844254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954532
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14606	NC_016831	A	6	6	844348	844353	100 %	0 %	0 %	0 %	378954532
14607	NC_016831	TTC	2	6	844381	844386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954532
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14621	NC_016831	CGC	2	6	845002	845007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954533
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