MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016831	GCA	2	6	723850	723855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954423
12502	NC_016831	CTTT	2	8	723925	723932	0 %	75 %	0 %	25 %	378954423
12503	NC_016831	CCTGGG	2	12	723938	723949	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954423
12504	NC_016831	CG	3	6	723986	723991	0 %	0 %	50 %	50 %	378954423
12505	NC_016831	ATC	2	6	723994	723999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954423
12506	NC_016831	GAC	2	6	724164	724169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12507	NC_016831	CGAT	2	8	724343	724350	25 %	25 %	25 %	25 %	378954424
12508	NC_016831	ATC	2	6	724411	724416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954424
12509	NC_016831	CGG	2	6	724434	724439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954424
12510	NC_016831	CTG	2	6	724474	724479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12511	NC_016831	TGC	2	6	724673	724678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12512	NC_016831	TGC	2	6	724697	724702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12513	NC_016831	CGG	2	6	724729	724734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954424
12514	NC_016831	TC	3	6	724737	724742	0 %	50 %	0 %	50 %	378954424
12515	NC_016831	CGA	2	6	724806	724811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12516	NC_016831	CAG	2	6	725056	725061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12517	NC_016831	GAA	2	6	725066	725071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954424
12518	NC_016831	ATC	2	6	725119	725124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954424
12519	NC_016831	AGTA	2	8	725141	725148	50 %	25 %	25 %	0 %	378954424
12520	NC_016831	CGC	2	6	725181	725186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954424
12521	NC_016831	TAA	2	6	725194	725199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954424
12522	NC_016831	CAT	2	6	725239	725244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954424
12523	NC_016831	T	6	6	725353	725358	0 %	100 %	0 %	0 %	378954424
12524	NC_016831	AAG	2	6	725372	725377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954424
12525	NC_016831	CTG	2	6	725428	725433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12526	NC_016831	GAA	2	6	725457	725462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954424
12527	NC_016831	GGT	2	6	725467	725472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954424
12528	NC_016831	TGT	2	6	725507	725512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954424
12529	NC_016831	GTATT	2	10	725528	725537	20 %	60 %	20 %	0 %	378954424
12530	NC_016831	TGC	2	6	725590	725595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954424
12531	NC_016831	T	6	6	726026	726031	0 %	100 %	0 %	0 %	378954425
12532	NC_016831	GTTC	2	8	726040	726047	0 %	50 %	25 %	25 %	378954425
12533	NC_016831	CGC	2	6	726064	726069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954425
12534	NC_016831	GAC	2	6	726121	726126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954425
12535	NC_016831	CTG	2	6	726200	726205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954425
12536	NC_016831	GCC	2	6	726296	726301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954425
12537	NC_016831	ACGC	2	8	726311	726318	25 %	0 %	25 %	50 %	378954425
12538	NC_016831	CAA	2	6	727691	727696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954426
12539	NC_016831	CGG	2	6	727757	727762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954426
12540	NC_016831	GAG	2	6	727880	727885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954426
12541	NC_016831	TGA	2	6	727935	727940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954426
12542	NC_016831	GCT	2	6	727972	727977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954426
12543	NC_016831	GGGC	2	8	727978	727985	0 %	0 %	75 %	25 %	378954426
12544	NC_016831	GCG	2	6	727995	728000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954426
12545	NC_016831	T	6	6	728006	728011	0 %	100 %	0 %	0 %	378954426
12546	NC_016831	GCG	2	6	728034	728039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954426
12547	NC_016831	CGC	2	6	728128	728133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954426
12548	NC_016831	CCA	2	6	728144	728149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954426
12549	NC_016831	GAT	2	6	728201	728206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954426
12550	NC_016831	AATC	2	8	728305	728312	50 %	25 %	0 %	25 %	378954426
12551	NC_016831	TAA	2	6	728336	728341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954426
12552	NC_016831	GGTT	2	8	728372	728379	0 %	50 %	50 %	0 %	378954426
12553	NC_016831	GCA	2	6	728410	728415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954426
12554	NC_016831	GCA	2	6	728453	728458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954426
12555	NC_016831	GCC	2	6	728465	728470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954426
12556	NC_016831	AGC	2	6	728505	728510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954426
12557	NC_016831	GC	3	6	728509	728514	0 %	0 %	50 %	50 %	378954426
12558	NC_016831	TAA	2	6	728582	728587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954426
12559	NC_016831	GGT	2	6	728600	728605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954426
12560	NC_016831	TAA	2	6	728629	728634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954426
12561	NC_016831	CG	3	6	728869	728874	0 %	0 %	50 %	50 %	378954427
12562	NC_016831	TC	3	6	728913	728918	0 %	50 %	0 %	50 %	378954427
12563	NC_016831	CGA	2	6	729021	729026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954427
12564	NC_016831	CAG	2	6	729061	729066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954427
12565	NC_016831	CTT	2	6	729129	729134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954427
12566	NC_016831	TCT	2	6	729170	729175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954427
12567	NC_016831	CGC	2	6	729222	729227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954427
12568	NC_016831	TTC	2	6	729274	729279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954427
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12570	NC_016831	T	6	6	729409	729414	0 %	100 %	0 %	0 %	378954427
12571	NC_016831	TTCG	2	8	729418	729425	0 %	50 %	25 %	25 %	378954427
12572	NC_016831	ATT	2	6	729973	729978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954428
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12574	NC_016831	GAA	2	6	730423	730428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954429
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12580	NC_016831	ATT	2	6	730875	730880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954430
12581	NC_016831	GGC	2	6	730910	730915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954430
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12583	NC_016831	TTG	2	6	730998	731003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954430
12584	NC_016831	AAT	2	6	731019	731024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954430
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12586	NC_016831	AATG	2	8	731174	731181	50 %	25 %	25 %	0 %	378954430
12587	NC_016831	TGG	2	6	731288	731293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954431
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12590	NC_016831	TGGTAT	2	12	731393	731404	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378954431
12591	NC_016831	GTG	2	6	731410	731415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954431
12592	NC_016831	GCCTG	2	10	731425	731434	0 %	20 %	40 %	40 %	378954431
12593	NC_016831	CGG	3	9	731651	731659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954431
12594	NC_016831	CAT	2	6	731664	731669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954431
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12601	NC_016831	GCG	2	6	731954	731959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954431
12602	NC_016831	GGA	2	6	731993	731998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954431
12603	NC_016831	AGT	2	6	732122	732127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954431
12604	NC_016831	T	6	6	732189	732194	0 %	100 %	0 %	0 %	378954431
12605	NC_016831	T	6	6	732204	732209	0 %	100 %	0 %	0 %	378954431
12606	NC_016831	A	6	6	732267	732272	100 %	0 %	0 %	0 %	378954431
12607	NC_016831	CCA	2	6	732278	732283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954431
12608	NC_016831	GGGC	2	8	732289	732296	0 %	0 %	75 %	25 %	378954431
12609	NC_016831	CGA	2	6	732368	732373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954431
12610	NC_016831	GCG	3	9	732415	732423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954431
12611	NC_016831	TGT	2	6	732428	732433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954431
12612	NC_016831	CTT	2	6	732702	732707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954432
12613	NC_016831	T	7	7	732730	732736	0 %	100 %	0 %	0 %	378954432
12614	NC_016831	T	7	7	732755	732761	0 %	100 %	0 %	0 %	378954432
12615	NC_016831	AGA	2	6	732859	732864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954433
12616	NC_016831	CGC	3	9	732880	732888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954433
12617	NC_016831	GGCG	2	8	732910	732917	0 %	0 %	75 %	25 %	378954433
12618	NC_016831	GC	3	6	732938	732943	0 %	0 %	50 %	50 %	378954433
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12620	NC_016831	GCC	2	6	733103	733108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954433
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12979	NC_016831	ATA	2	6	753288	753293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954452
12980	NC_016831	ATC	2	6	753295	753300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954452
12981	NC_016831	CGGTA	2	10	753367	753376	20 %	20 %	40 %	20 %	378954452
12982	NC_016831	CAA	2	6	753388	753393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954452
12983	NC_016831	CGT	2	6	755268	755273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954453
12984	NC_016831	ATT	3	9	755293	755301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954453
12985	NC_016831	T	6	6	755316	755321	0 %	100 %	0 %	0 %	378954453
12986	NC_016831	TAT	3	9	755367	755375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954453
12987	NC_016831	CGG	2	6	755423	755428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954453
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12990	NC_016831	CAAT	2	8	755473	755480	50 %	25 %	0 %	25 %	378954453
12991	NC_016831	CAA	2	6	755490	755495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954453
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