MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016831	GCG	2	6	638482	638487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954348
11002	NC_016831	GTATT	2	10	638570	638579	20 %	60 %	20 %	0 %	378954348
11003	NC_016831	CGA	2	6	638633	638638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954348
11004	NC_016831	CAT	2	6	638662	638667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954348
11005	NC_016831	AAC	2	6	638761	638766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954349
11006	NC_016831	CAG	2	6	638802	638807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954349
11007	NC_016831	GT	3	6	638833	638838	0 %	50 %	50 %	0 %	378954349
11008	NC_016831	CAG	2	6	638851	638856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954349
11009	NC_016831	CAT	2	6	638967	638972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954349
11010	NC_016831	GAGG	2	8	638997	639004	25 %	0 %	75 %	0 %	378954349
11011	NC_016831	TAAT	2	8	639076	639083	50 %	50 %	0 %	0 %	378954350
11012	NC_016831	GGCGG	2	10	639100	639109	0 %	0 %	80 %	20 %	378954350
11013	NC_016831	GCC	2	6	639135	639140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954350
11014	NC_016831	CAG	2	6	639209	639214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954350
11015	NC_016831	CGG	2	6	639276	639281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954350
11016	NC_016831	GCTT	2	8	639309	639316	0 %	50 %	25 %	25 %	378954350
11017	NC_016831	GGGAA	2	10	639433	639442	40 %	0 %	60 %	0 %	378954351
11018	NC_016831	TAA	2	6	639486	639491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954351
11019	NC_016831	CCT	2	6	639495	639500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954351
11020	NC_016831	TCG	2	6	639530	639535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954351
11021	NC_016831	ATA	2	6	639608	639613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954351
11022	NC_016831	CGG	2	6	639642	639647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954351
11023	NC_016831	A	6	6	639712	639717	100 %	0 %	0 %	0 %	378954351
11024	NC_016831	CAG	2	6	639766	639771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954351
11025	NC_016831	TTG	2	6	639808	639813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954351
11026	NC_016831	GAG	2	6	639929	639934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954351
11027	NC_016831	CGC	2	6	639943	639948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954351
11028	NC_016831	CCG	2	6	639983	639988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954351
11029	NC_016831	GCG	2	6	640001	640006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954351
11030	NC_016831	CTT	2	6	640011	640016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954351
11031	NC_016831	GC	3	6	640036	640041	0 %	0 %	50 %	50 %	378954351
11032	NC_016831	TCGC	2	8	640159	640166	0 %	25 %	25 %	50 %	378954351
11033	NC_016831	GC	3	6	640182	640187	0 %	0 %	50 %	50 %	378954351
11034	NC_016831	TCGCG	2	10	640328	640337	0 %	20 %	40 %	40 %	378954351
11035	NC_016831	AGC	2	6	640371	640376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954351
11036	NC_016831	GCCA	2	8	640385	640392	25 %	0 %	25 %	50 %	378954351
11037	NC_016831	GCA	2	6	640440	640445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954351
11038	NC_016831	CAC	2	6	640450	640455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954351
11039	NC_016831	ACA	2	6	640573	640578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954351
11040	NC_016831	ATC	2	6	640604	640609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954351
11041	NC_016831	GA	3	6	640655	640660	50 %	0 %	50 %	0 %	378954351
11042	NC_016831	GCCAC	2	10	640716	640725	20 %	0 %	20 %	60 %	378954351
11043	NC_016831	GGC	2	6	640941	640946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954351
11044	NC_016831	TAG	2	6	640964	640969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954351
11045	NC_016831	GCG	2	6	640982	640987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954351
11046	NC_016831	ATA	2	6	640996	641001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954351
11047	NC_016831	TCA	2	6	641013	641018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954351
11048	NC_016831	GCA	2	6	641117	641122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954352
11049	NC_016831	ACGA	2	8	641163	641170	50 %	0 %	25 %	25 %	378954352
11050	NC_016831	ATGG	2	8	641217	641224	25 %	25 %	50 %	0 %	378954352
11051	NC_016831	TA	3	6	641225	641230	50 %	50 %	0 %	0 %	378954352
11052	NC_016831	CGG	2	6	641294	641299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954352
11053	NC_016831	CGGA	2	8	641373	641380	25 %	0 %	50 %	25 %	378954352
11054	NC_016831	GGT	2	6	641385	641390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954352
11055	NC_016831	AAC	2	6	641439	641444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954352
11056	NC_016831	GCCG	2	8	641463	641470	0 %	0 %	50 %	50 %	378954352
11057	NC_016831	TGC	2	6	641519	641524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954352
11058	NC_016831	GC	3	6	641523	641528	0 %	0 %	50 %	50 %	378954352
11059	NC_016831	TCT	2	6	641533	641538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954352
11060	NC_016831	AAT	2	6	641634	641639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954352
11061	NC_016831	T	6	6	641662	641667	0 %	100 %	0 %	0 %	378954352
11062	NC_016831	CAG	2	6	641688	641693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954352
11063	NC_016831	AGC	2	6	641715	641720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954352
11064	NC_016831	GAA	2	6	641802	641807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954352
11065	NC_016831	CAG	2	6	641844	641849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954352
11066	NC_016831	ATG	2	6	641914	641919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954352
11067	NC_016831	GAA	2	6	641948	641953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954353
11068	NC_016831	TTC	2	6	641963	641968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954353
11069	NC_016831	CCCAG	2	10	641998	642007	20 %	0 %	20 %	60 %	378954353
11070	NC_016831	TAA	2	6	642069	642074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954353
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11072	NC_016831	GCAGC	2	10	642119	642128	20 %	0 %	40 %	40 %	378954353
11073	NC_016831	CAT	2	6	642232	642237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954353
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11079	NC_016831	CGC	2	6	642383	642388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954353
11080	NC_016831	CGA	2	6	642535	642540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954353
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11088	NC_016831	CCA	2	6	642997	643002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954353
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11091	NC_016831	GA	3	6	643105	643110	50 %	0 %	50 %	0 %	378954353
11092	NC_016831	GC	3	6	643132	643137	0 %	0 %	50 %	50 %	378954353
11093	NC_016831	CCGC	2	8	643225	643232	0 %	0 %	25 %	75 %	378954353
11094	NC_016831	GCG	2	6	643292	643297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954353
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11099	NC_016831	ATG	2	6	643406	643411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954353
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11101	NC_016831	TTTCGC	2	12	643513	643524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378954353
11102	NC_016831	GCG	2	6	643546	643551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954353
11103	NC_016831	AGGC	2	8	643564	643571	25 %	0 %	50 %	25 %	378954353
11104	NC_016831	TTC	2	6	643622	643627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954353
11105	NC_016831	A	6	6	643654	643659	100 %	0 %	0 %	0 %	378954353
11106	NC_016831	GCC	2	6	643746	643751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954353
11107	NC_016831	A	6	6	643769	643774	100 %	0 %	0 %	0 %	378954353
11108	NC_016831	TGG	2	6	643895	643900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954354
11109	NC_016831	TTG	2	6	643939	643944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954354
11110	NC_016831	GGGC	2	8	643958	643965	0 %	0 %	75 %	25 %	378954354
11111	NC_016831	CAG	2	6	644002	644007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954354
11112	NC_016831	GC	3	6	644025	644030	0 %	0 %	50 %	50 %	378954354
11113	NC_016831	CCG	2	6	644073	644078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954354
11114	NC_016831	CCG	2	6	644135	644140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954354
11115	NC_016831	CAG	2	6	644158	644163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954354
11116	NC_016831	GCG	2	6	644178	644183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954354
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11118	NC_016831	CAGG	2	8	644191	644198	25 %	0 %	50 %	25 %	378954354
11119	NC_016831	CGA	2	6	644294	644299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954354
11120	NC_016831	TGC	2	6	644331	644336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954354
11121	NC_016831	ATA	2	6	644363	644368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954354
11122	NC_016831	GCG	2	6	644371	644376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954354
11123	NC_016831	CTGTC	2	10	644474	644483	0 %	40 %	20 %	40 %	378954354
11124	NC_016831	CCA	2	6	644532	644537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954354
11125	NC_016831	CGG	2	6	644554	644559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954354
11126	NC_016831	ATG	2	6	644585	644590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954354
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11128	NC_016831	GAT	2	6	644665	644670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954354
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11130	NC_016831	GCT	2	6	644722	644727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954354
11131	NC_016831	CAT	2	6	644730	644735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954354
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11144	NC_016831	GGC	2	6	645231	645236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954355
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11153	NC_016831	TCG	2	6	645793	645798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954355
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