MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016831	TAC	2	6	613323	613328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954326
10502	NC_016831	GCA	2	6	613342	613347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954326
10503	NC_016831	GCA	2	6	613394	613399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954326
10504	NC_016831	GTA	2	6	613453	613458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954326
10505	NC_016831	CAA	2	6	613505	613510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954327
10506	NC_016831	CAC	2	6	613571	613576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954327
10507	NC_016831	GCG	2	6	613592	613597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954327
10508	NC_016831	AGC	2	6	613626	613631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954327
10509	NC_016831	GCGA	2	8	613688	613695	25 %	0 %	50 %	25 %	378954327
10510	NC_016831	CGGT	2	8	613740	613747	0 %	25 %	50 %	25 %	378954327
10511	NC_016831	GTG	2	6	613775	613780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954327
10512	NC_016831	A	7	7	613821	613827	100 %	0 %	0 %	0 %	378954327
10513	NC_016831	GAC	2	6	613849	613854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954327
10514	NC_016831	GCT	2	6	613873	613878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954327
10515	NC_016831	CTG	2	6	613885	613890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954327
10516	NC_016831	ATG	2	6	613919	613924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954327
10517	NC_016831	TGA	2	6	613927	613932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954327
10518	NC_016831	ACT	2	6	613972	613977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954327
10519	NC_016831	CTGG	2	8	614061	614068	0 %	25 %	50 %	25 %	378954328
10520	NC_016831	GC	3	6	614099	614104	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
10521	NC_016831	GCG	3	9	614174	614182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954328
10522	NC_016831	CTG	2	6	614248	614253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
10523	NC_016831	CTG	2	6	614296	614301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
10524	NC_016831	AAC	2	6	614306	614311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954328
10525	NC_016831	CTG	2	6	614320	614325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
10526	NC_016831	GCG	2	6	614387	614392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954328
10527	NC_016831	AT	3	6	614394	614399	50 %	50 %	0 %	0 %	378954328
10528	NC_016831	GCT	2	6	614451	614456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954328
10529	NC_016831	GAA	2	6	614533	614538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954328
10530	NC_016831	GCC	2	6	614564	614569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954328
10531	NC_016831	GCC	2	6	614589	614594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954328
10532	NC_016831	TG	3	6	614632	614637	0 %	50 %	50 %	0 %	378954328
10533	NC_016831	GAA	2	6	614757	614762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954328
10534	NC_016831	CAC	2	6	614790	614795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954328
10535	NC_016831	CG	4	8	614796	614803	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
10536	NC_016831	GGCGG	2	10	614866	614875	0 %	0 %	80 %	20 %	378954328
10537	NC_016831	GCAG	2	8	614938	614945	25 %	0 %	50 %	25 %	378954328
10538	NC_016831	GC	4	8	615093	615100	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
10539	NC_016831	GC	3	6	615182	615187	0 %	0 %	50 %	50 %	378954328
10540	NC_016831	GAA	2	6	615238	615243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954328
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10542	NC_016831	TGTC	2	8	615424	615431	0 %	50 %	25 %	25 %	378954329
10543	NC_016831	GCC	2	6	615491	615496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954329
10544	NC_016831	GCCA	2	8	615564	615571	25 %	0 %	25 %	50 %	378954329
10545	NC_016831	GAC	2	6	615595	615600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954329
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10547	NC_016831	GTG	2	6	615628	615633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954329
10548	NC_016831	TGA	2	6	615641	615646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954329
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10550	NC_016831	TGA	2	6	615713	615718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954329
10551	NC_016831	TC	3	6	615788	615793	0 %	50 %	0 %	50 %	378954329
10552	NC_016831	TG	3	6	615826	615831	0 %	50 %	50 %	0 %	378954329
10553	NC_016831	TAC	2	6	615835	615840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954329
10554	NC_016831	GC	3	6	615878	615883	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
10555	NC_016831	CAG	2	6	616042	616047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954329
10556	NC_016831	ACT	2	6	616133	616138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954329
10557	NC_016831	GGCTAT	2	12	616162	616173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378954329
10558	NC_016831	CGA	2	6	616218	616223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954329
10559	NC_016831	TCA	2	6	616226	616231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954329
10560	NC_016831	GCG	2	6	616261	616266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954329
10561	NC_016831	GAA	2	6	616284	616289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954329
10562	NC_016831	ATCGGT	2	12	616294	616305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378954329
10563	NC_016831	TGGT	2	8	616349	616356	0 %	50 %	50 %	0 %	378954329
10564	NC_016831	CG	4	8	616380	616387	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
10565	NC_016831	TGC	2	6	616421	616426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954329
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10568	NC_016831	GGC	3	9	616569	616577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954329
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10573	NC_016831	GC	3	6	616720	616725	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
10574	NC_016831	CAAAA	2	10	616795	616804	80 %	0 %	0 %	20 %	378954329
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10580	NC_016831	CGC	2	6	617100	617105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954329
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10587	NC_016831	TGGAC	2	10	617348	617357	20 %	20 %	40 %	20 %	378954329
10588	NC_016831	GCC	2	6	617389	617394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954329
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10591	NC_016831	GC	3	6	617502	617507	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
10592	NC_016831	AACC	2	8	617581	617588	50 %	0 %	0 %	50 %	378954329
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10600	NC_016831	GGCAG	2	10	617991	618000	20 %	0 %	60 %	20 %	378954329
10601	NC_016831	CTGG	2	8	618040	618047	0 %	25 %	50 %	25 %	378954329
10602	NC_016831	CG	3	6	618048	618053	0 %	0 %	50 %	50 %	378954329
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10608	NC_016831	CGT	2	6	618189	618194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954330
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10610	NC_016831	GCTC	2	8	618247	618254	0 %	25 %	25 %	50 %	378954330
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10618	NC_016831	GCT	2	6	618506	618511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954330
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10620	NC_016831	GTG	2	6	618579	618584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954330
10621	NC_016831	GTCACC	2	12	618700	618711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378954330
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10623	NC_016831	TTC	2	6	618846	618851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954330
10624	NC_016831	TGGC	2	8	618854	618861	0 %	25 %	50 %	25 %	378954330
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