MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016831	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	378953827
502	NC_016831	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	378953827
503	NC_016831	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	378953827
504	NC_016831	ACGGTG	2	12	28235	28246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378953827
505	NC_016831	TTG	2	6	28269	28274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953827
506	NC_016831	GT	3	6	28357	28362	0 %	50 %	50 %	0 %	378953827
507	NC_016831	ATC	2	6	28371	28376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953827
508	NC_016831	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	378953827
509	NC_016831	TCC	2	6	28382	28387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953827
510	NC_016831	ACA	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953827
511	NC_016831	CTG	2	6	28451	28456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953828
512	NC_016831	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	378953828
513	NC_016831	A	6	6	28593	28598	100 %	0 %	0 %	0 %	378953828
514	NC_016831	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	378953828
515	NC_016831	CCG	2	6	28629	28634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953828
516	NC_016831	TTC	2	6	28762	28767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953828
517	NC_016831	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	378953828
518	NC_016831	AAC	2	6	28793	28798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953828
519	NC_016831	ATG	2	6	28812	28817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953828
520	NC_016831	TCG	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953828
521	NC_016831	CCG	2	6	28947	28952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953828
522	NC_016831	A	6	6	29120	29125	100 %	0 %	0 %	0 %	378953828
523	NC_016831	ATG	2	6	29286	29291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953828
524	NC_016831	ACA	2	6	29366	29371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953828
525	NC_016831	GAC	2	6	29504	29509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953829
526	NC_016831	AAC	2	6	29632	29637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953829
527	NC_016831	ATG	2	6	29814	29819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953829
528	NC_016831	AAT	2	6	29840	29845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953829
529	NC_016831	GGT	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953829
530	NC_016831	CGG	2	6	29946	29951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953829
531	NC_016831	ATGA	2	8	29973	29980	50 %	25 %	25 %	0 %	378953829
532	NC_016831	TGC	2	6	30027	30032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953830
533	NC_016831	GGC	2	6	30034	30039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953830
534	NC_016831	CT	3	6	30107	30112	0 %	50 %	0 %	50 %	378953830
535	NC_016831	CG	3	6	30170	30175	0 %	0 %	50 %	50 %	378953830
536	NC_016831	GCA	2	6	30225	30230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953830
537	NC_016831	GCG	2	6	30237	30242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953830
538	NC_016831	GCG	2	6	30263	30268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953830
539	NC_016831	AG	3	6	30376	30381	50 %	0 %	50 %	0 %	378953830
540	NC_016831	CG	3	6	30433	30438	0 %	0 %	50 %	50 %	378953830
541	NC_016831	GGC	2	6	30452	30457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953830
542	NC_016831	TATC	2	8	30599	30606	25 %	50 %	0 %	25 %	378953831
543	NC_016831	GTAA	2	8	30636	30643	50 %	25 %	25 %	0 %	378953831
544	NC_016831	TGG	2	6	30686	30691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953831
545	NC_016831	CGC	2	6	30742	30747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953831
546	NC_016831	ATT	2	6	30749	30754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953831
547	NC_016831	GC	3	6	30765	30770	0 %	0 %	50 %	50 %	378953831
548	NC_016831	GGT	2	6	30788	30793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953831
549	NC_016831	CCG	2	6	30814	30819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953831
550	NC_016831	CGC	2	6	30848	30853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953831
551	NC_016831	TTCG	2	8	30898	30905	0 %	50 %	25 %	25 %	378953831
552	NC_016831	GCA	2	6	30950	30955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953831
553	NC_016831	ATCTG	2	10	30967	30976	20 %	40 %	20 %	20 %	378953831
554	NC_016831	TTACG	2	10	31022	31031	20 %	40 %	20 %	20 %	378953831
555	NC_016831	TTA	2	6	31038	31043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953831
556	NC_016831	GC	3	6	31055	31060	0 %	0 %	50 %	50 %	378953831
557	NC_016831	TAT	2	6	31271	31276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953832
558	NC_016831	TAT	2	6	31278	31283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953832
559	NC_016831	CGC	2	6	31352	31357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953832
560	NC_016831	CGG	2	6	31390	31395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953832
561	NC_016831	GTCA	2	8	31407	31414	25 %	25 %	25 %	25 %	378953832
562	NC_016831	GGT	2	6	31433	31438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953832
563	NC_016831	CGC	2	6	31475	31480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953832
564	NC_016831	CAG	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953832
565	NC_016831	CAA	2	6	31515	31520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953832
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569	NC_016831	GTG	2	6	31640	31645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953832
570	NC_016831	T	6	6	31723	31728	0 %	100 %	0 %	0 %	378953832
571	NC_016831	GGC	2	6	31754	31759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953832
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580	NC_016831	TGCGT	2	10	32169	32178	0 %	40 %	40 %	20 %	378953833
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592	NC_016831	AACA	2	8	32717	32724	75 %	0 %	0 %	25 %	378953834
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597	NC_016831	ATC	2	6	32832	32837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953834
598	NC_016831	CGCA	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	378953834
599	NC_016831	T	6	6	32918	32923	0 %	100 %	0 %	0 %	378953834
600	NC_016831	ATT	2	6	32937	32942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953834
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608	NC_016831	TC	3	6	33486	33491	0 %	50 %	0 %	50 %	378953835
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610	NC_016831	TTAT	2	8	33530	33537	25 %	75 %	0 %	0 %	378953835
611	NC_016831	TGA	2	6	33726	33731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953835
612	NC_016831	AT	3	6	33736	33741	50 %	50 %	0 %	0 %	378953835
613	NC_016831	A	7	7	33761	33767	100 %	0 %	0 %	0 %	378953835
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619	NC_016831	A	6	6	33927	33932	100 %	0 %	0 %	0 %	378953835
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629	NC_016831	TAC	2	6	34179	34184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953835
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