MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016831	TCC	2	6	522148	522153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954243
9002	NC_016831	GCG	2	6	522263	522268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954243
9003	NC_016831	TCGGGA	2	12	522271	522282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378954243
9004	NC_016831	TGG	2	6	522410	522415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954243
9005	NC_016831	GAT	2	6	522417	522422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954243
9006	NC_016831	TCA	2	6	522427	522432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954243
9007	NC_016831	A	6	6	522442	522447	100 %	0 %	0 %	0 %	378954243
9008	NC_016831	CGG	3	9	522489	522497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954243
9009	NC_016831	ATT	2	6	522504	522509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954243
9010	NC_016831	CG	3	6	522543	522548	0 %	0 %	50 %	50 %	378954243
9011	NC_016831	GCA	2	6	522551	522556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954243
9012	NC_016831	CGC	2	6	522632	522637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954243
9013	NC_016831	CGA	2	6	522649	522654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954243
9014	NC_016831	TG	3	6	522663	522668	0 %	50 %	50 %	0 %	378954243
9015	NC_016831	AATA	2	8	522720	522727	75 %	25 %	0 %	0 %	378954244
9016	NC_016831	ACC	2	6	522996	523001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954245
9017	NC_016831	TGGG	2	8	523013	523020	0 %	25 %	75 %	0 %	378954245
9018	NC_016831	CGC	2	6	523039	523044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954245
9019	NC_016831	GC	3	6	523064	523069	0 %	0 %	50 %	50 %	378954245
9020	NC_016831	CAC	2	6	523093	523098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954245
9021	NC_016831	TCG	2	6	523173	523178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954245
9022	NC_016831	GC	3	6	523179	523184	0 %	0 %	50 %	50 %	378954245
9023	NC_016831	GCA	2	6	523198	523203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954245
9024	NC_016831	CGCA	2	8	523351	523358	25 %	0 %	25 %	50 %	378954245
9025	NC_016831	CAT	2	6	523369	523374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954245
9026	NC_016831	CCG	2	6	523380	523385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954245
9027	NC_016831	A	7	7	523394	523400	100 %	0 %	0 %	0 %	378954245
9028	NC_016831	GCG	2	6	523452	523457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954245
9029	NC_016831	TGA	2	6	523494	523499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954245
9030	NC_016831	ACT	2	6	523603	523608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954245
9031	NC_016831	TGA	2	6	523627	523632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954245
9032	NC_016831	CAG	2	6	523672	523677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954245
9033	NC_016831	AAG	2	6	523680	523685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954245
9034	NC_016831	CAA	2	6	523766	523771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954245
9035	NC_016831	ACGC	2	8	523783	523790	25 %	0 %	25 %	50 %	378954245
9036	NC_016831	GCC	3	9	523897	523905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954245
9037	NC_016831	CCG	2	6	523914	523919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954245
9038	NC_016831	CAG	2	6	523979	523984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954245
9039	NC_016831	CCG	2	6	524025	524030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954245
9040	NC_016831	CGC	2	6	524116	524121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954245
9041	NC_016831	GC	3	6	524127	524132	0 %	0 %	50 %	50 %	378954245
9042	NC_016831	CGG	2	6	524150	524155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954245
9043	NC_016831	GGCGC	2	10	524177	524186	0 %	0 %	60 %	40 %	378954245
9044	NC_016831	CTG	2	6	524243	524248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954245
9045	NC_016831	CAA	2	6	524251	524256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954245
9046	NC_016831	GC	3	6	524275	524280	0 %	0 %	50 %	50 %	378954245
9047	NC_016831	ACC	2	6	524338	524343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954245
9048	NC_016831	GC	3	6	524423	524428	0 %	0 %	50 %	50 %	378954245
9049	NC_016831	GGC	2	6	524568	524573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954246
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9051	NC_016831	GCA	2	6	524633	524638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954246
9052	NC_016831	ACG	2	6	524653	524658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954246
9053	NC_016831	GCC	2	6	524662	524667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954246
9054	NC_016831	AGCC	2	8	524680	524687	25 %	0 %	25 %	50 %	378954246
9055	NC_016831	CG	3	6	524690	524695	0 %	0 %	50 %	50 %	378954246
9056	NC_016831	CGC	2	6	524739	524744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954246
9057	NC_016831	GCGCC	2	10	524783	524792	0 %	0 %	40 %	60 %	378954246
9058	NC_016831	CGC	2	6	524819	524824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954246
9059	NC_016831	CGC	3	9	524835	524843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954246
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9061	NC_016831	GAC	2	6	524865	524870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954246
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9069	NC_016831	CGC	2	6	525201	525206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954246
9070	NC_016831	GCC	2	6	525208	525213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954246
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9091	NC_016831	CGG	3	9	526351	526359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954247
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9094	NC_016831	CCG	2	6	526548	526553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954247
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9102	NC_016831	ATCG	2	8	527719	527726	25 %	25 %	25 %	25 %	378954248
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9111	NC_016831	ATG	2	6	528290	528295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954248
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9490	NC_016831	TGA	2	6	552714	552719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954269
9491	NC_016831	TGC	2	6	552738	552743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954269
9492	NC_016831	GCCA	2	8	552744	552751	25 %	0 %	25 %	50 %	378954269
9493	NC_016831	CATG	2	8	552790	552797	25 %	25 %	25 %	25 %	378954269
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9495	NC_016831	GGC	2	6	552830	552835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954269
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