MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_016831	GGT	2	6	396411	396416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954149
7003	NC_016831	GAA	2	6	396471	396476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954149
7004	NC_016831	TAC	2	6	396501	396506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954149
7005	NC_016831	ACGGCA	2	12	396536	396547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954149
7006	NC_016831	ATG	2	6	396551	396556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954149
7007	NC_016831	TCG	2	6	396599	396604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954149
7008	NC_016831	TGG	2	6	396633	396638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954149
7009	NC_016831	GGC	2	6	396724	396729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954149
7010	NC_016831	CGC	2	6	397063	397068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954150
7011	NC_016831	TAT	2	6	397082	397087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954150
7012	NC_016831	GCT	2	6	397109	397114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954150
7013	NC_016831	CG	3	6	397156	397161	0 %	0 %	50 %	50 %	378954150
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7017	NC_016831	GCC	2	6	397299	397304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954150
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7019	NC_016831	CGC	2	6	397324	397329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954150
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7021	NC_016831	TGG	2	6	397381	397386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954150
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7025	NC_016831	GGT	3	9	397784	397792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954150
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7031	NC_016831	CGT	2	6	398024	398029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954150
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7033	NC_016831	AGCAC	2	10	398128	398137	40 %	0 %	20 %	40 %	378954150
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7041	NC_016831	TCG	2	6	398529	398534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954150
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7121	NC_016831	CCA	2	6	410840	410845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954151
7122	NC_016831	CGACGG	2	12	410853	410864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378954151
7123	NC_016831	CAA	2	6	410925	410930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954151
7124	NC_016831	ACG	2	6	410977	410982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954151
7125	NC_016831	GCA	2	6	411044	411049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954151
7126	NC_016831	CAA	2	6	411066	411071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954151
7127	NC_016831	GTCATC	2	12	411108	411119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378954151
7128	NC_016831	CT	3	6	411121	411126	0 %	50 %	0 %	50 %	378954151
7129	NC_016831	TAC	2	6	411171	411176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954151
7130	NC_016831	CGA	2	6	411186	411191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954151
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7132	NC_016831	GACC	2	8	411210	411217	25 %	0 %	25 %	50 %	378954151
7133	NC_016831	ACG	2	6	411242	411247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954151
7134	NC_016831	GCT	2	6	411288	411293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954151
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7140	NC_016831	TGAT	2	8	411473	411480	25 %	50 %	25 %	0 %	378954151
7141	NC_016831	GC	4	8	411580	411587	0 %	0 %	50 %	50 %	378954151
7142	NC_016831	GCAG	2	8	411613	411620	25 %	0 %	50 %	25 %	378954151
7143	NC_016831	GCA	2	6	411677	411682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954151
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7153	NC_016831	GCG	2	6	412103	412108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954151
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7217	NC_016831	ACT	2	6	414809	414814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954151
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7222	NC_016831	AG	3	6	415074	415079	50 %	0 %	50 %	0 %	378954151
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7225	NC_016831	TGA	2	6	415398	415403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954151
7226	NC_016831	GCAG	2	8	415458	415465	25 %	0 %	50 %	25 %	378954151
7227	NC_016831	GCA	2	6	415514	415519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954151
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7229	NC_016831	TCC	2	6	415777	415782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954152
7230	NC_016831	CCGT	2	8	415840	415847	0 %	25 %	25 %	50 %	378954152
7231	NC_016831	GTC	2	6	415849	415854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954152
7232	NC_016831	CG	3	6	415868	415873	0 %	0 %	50 %	50 %	378954152
7233	NC_016831	GC	3	6	416000	416005	0 %	0 %	50 %	50 %	378954152
7234	NC_016831	TGTTGC	2	12	416161	416172	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378954152
7235	NC_016831	CGG	2	6	416197	416202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954152
7236	NC_016831	GTA	2	6	416217	416222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954152
7237	NC_016831	GCT	2	6	416243	416248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954152
7238	NC_016831	CAA	2	6	416268	416273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954152
7239	NC_016831	CTG	2	6	416277	416282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954152
7240	NC_016831	GCT	2	6	416305	416310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954152
7241	NC_016831	GC	4	8	416321	416328	0 %	0 %	50 %	50 %	378954152
7242	NC_016831	ACC	2	6	416383	416388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954152
7243	NC_016831	TCG	2	6	416425	416430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954152
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7486	NC_016831	TGC	2	6	431498	431503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954164
7487	NC_016831	TAC	2	6	431597	431602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954164
7488	NC_016831	TGT	2	6	431603	431608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954164
7489	NC_016831	TAT	2	6	431643	431648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954164
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