MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016831	GAC	2	6	370296	370301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954129
6502	NC_016831	GGCA	2	8	370312	370319	25 %	0 %	50 %	25 %	378954129
6503	NC_016831	TAAC	2	8	370353	370360	50 %	25 %	0 %	25 %	378954129
6504	NC_016831	AATTA	2	10	370363	370372	60 %	40 %	0 %	0 %	378954129
6505	NC_016831	TGA	2	6	370450	370455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954130
6506	NC_016831	A	6	6	370490	370495	100 %	0 %	0 %	0 %	378954130
6507	NC_016831	TTA	2	6	370503	370508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954130
6508	NC_016831	AAT	2	6	370515	370520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954130
6509	NC_016831	CG	3	6	370663	370668	0 %	0 %	50 %	50 %	378954131
6510	NC_016831	CAC	2	6	370734	370739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954131
6511	NC_016831	A	7	7	370807	370813	100 %	0 %	0 %	0 %	378954131
6512	NC_016831	GC	3	6	370880	370885	0 %	0 %	50 %	50 %	378954131
6513	NC_016831	TCA	2	6	370921	370926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954131
6514	NC_016831	CGC	2	6	370944	370949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954131
6515	NC_016831	CG	3	6	370954	370959	0 %	0 %	50 %	50 %	378954131
6516	NC_016831	T	6	6	370976	370981	0 %	100 %	0 %	0 %	378954131
6517	NC_016831	CAC	2	6	371013	371018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954131
6518	NC_016831	GCG	2	6	371024	371029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954131
6519	NC_016831	CCT	2	6	371050	371055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954131
6520	NC_016831	CTT	2	6	371063	371068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954131
6521	NC_016831	TCG	2	6	371089	371094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954131
6522	NC_016831	CCGC	2	8	371113	371120	0 %	0 %	25 %	75 %	378954131
6523	NC_016831	GCA	2	6	371153	371158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954131
6524	NC_016831	CCA	2	6	371160	371165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954131
6525	NC_016831	CGGAG	2	10	371172	371181	20 %	0 %	60 %	20 %	378954131
6526	NC_016831	CAT	2	6	371271	371276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954131
6527	NC_016831	GCG	2	6	371285	371290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954131
6528	NC_016831	A	6	6	371319	371324	100 %	0 %	0 %	0 %	378954131
6529	NC_016831	GC	3	6	371327	371332	0 %	0 %	50 %	50 %	378954131
6530	NC_016831	CGCC	2	8	371357	371364	0 %	0 %	25 %	75 %	378954131
6531	NC_016831	TCCTG	2	10	371377	371386	0 %	40 %	20 %	40 %	378954131
6532	NC_016831	GCG	2	6	371387	371392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954131
6533	NC_016831	ATC	2	6	371424	371429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954131
6534	NC_016831	CGG	2	6	371450	371455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954131
6535	NC_016831	A	6	6	371460	371465	100 %	0 %	0 %	0 %	378954131
6536	NC_016831	GGT	2	6	371469	371474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954131
6537	NC_016831	GTG	2	6	371701	371706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954132
6538	NC_016831	GCTGGC	2	12	371721	371732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378954132
6539	NC_016831	AAC	2	6	371743	371748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954132
6540	NC_016831	CGA	2	6	371762	371767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6541	NC_016831	AAGCG	2	10	371772	371781	40 %	0 %	40 %	20 %	378954132
6542	NC_016831	GCA	2	6	371838	371843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6543	NC_016831	CGGCG	2	10	371895	371904	0 %	0 %	60 %	40 %	378954132
6544	NC_016831	TGG	2	6	372065	372070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954132
6545	NC_016831	CCG	2	6	372083	372088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954132
6546	NC_016831	A	6	6	372128	372133	100 %	0 %	0 %	0 %	378954132
6547	NC_016831	CCAGC	2	10	372153	372162	20 %	0 %	20 %	60 %	378954132
6548	NC_016831	GCT	2	6	372186	372191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6549	NC_016831	TC	4	8	372316	372323	0 %	50 %	0 %	50 %	378954132
6550	NC_016831	CTG	2	6	372343	372348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6551	NC_016831	GC	3	6	372394	372399	0 %	0 %	50 %	50 %	378954132
6552	NC_016831	CTG	3	9	372415	372423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6553	NC_016831	GGCG	2	8	372453	372460	0 %	0 %	75 %	25 %	378954132
6554	NC_016831	GTT	2	6	372516	372521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954132
6555	NC_016831	CGGCG	2	10	372597	372606	0 %	0 %	60 %	40 %	378954132
6556	NC_016831	TTC	2	6	372626	372631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954132
6557	NC_016831	CGA	2	6	372662	372667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6558	NC_016831	GCG	3	9	372706	372714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954132
6559	NC_016831	GCT	2	6	372747	372752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6560	NC_016831	GC	3	6	372800	372805	0 %	0 %	50 %	50 %	378954132
6561	NC_016831	AGCA	2	8	372814	372821	50 %	0 %	25 %	25 %	378954132
6562	NC_016831	CG	3	6	372839	372844	0 %	0 %	50 %	50 %	378954132
6563	NC_016831	CGT	2	6	372969	372974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6564	NC_016831	TGC	2	6	373073	373078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6565	NC_016831	A	6	6	373142	373147	100 %	0 %	0 %	0 %	378954132
6566	NC_016831	CGC	2	6	373148	373153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954132
6567	NC_016831	GC	3	6	373205	373210	0 %	0 %	50 %	50 %	378954132
6568	NC_016831	GTG	2	6	373364	373369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954132
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6570	NC_016831	GCCA	2	8	373381	373388	25 %	0 %	25 %	50 %	378954132
6571	NC_016831	AAG	2	6	373394	373399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954132
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6574	NC_016831	GTC	2	6	373451	373456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
6575	NC_016831	TCG	2	6	373464	373469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
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6581	NC_016831	TGG	2	6	373745	373750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954132
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6584	NC_016831	GCG	2	6	373910	373915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954132
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6587	NC_016831	TGG	2	6	374050	374055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954132
6588	NC_016831	CGAT	2	8	374060	374067	25 %	25 %	25 %	25 %	378954132
6589	NC_016831	TGG	2	6	374144	374149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954132
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6592	NC_016831	GCG	2	6	374363	374368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954132
6593	NC_016831	TTC	2	6	374413	374418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954132
6594	NC_016831	GGC	2	6	374487	374492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954132
6595	NC_016831	GGC	2	6	374503	374508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954132
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6605	NC_016831	GGCGAA	2	12	374941	374952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378954132
6606	NC_016831	GC	3	6	374999	375004	0 %	0 %	50 %	50 %	378954132
6607	NC_016831	GCGT	2	8	375026	375033	0 %	25 %	50 %	25 %	378954132
6608	NC_016831	GGCCT	2	10	375036	375045	0 %	20 %	40 %	40 %	378954132
6609	NC_016831	GA	3	6	375083	375088	50 %	0 %	50 %	0 %	378954132
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6612	NC_016831	CTG	2	6	375148	375153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954132
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