MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_016831	GCG	2	6	3216778	3216783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956823
54502	NC_016831	AGCA	2	8	3216804	3216811	50 %	0 %	25 %	25 %	378956823
54503	NC_016831	GCC	2	6	3216839	3216844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956823
54504	NC_016831	CG	3	6	3216845	3216850	0 %	0 %	50 %	50 %	378956823
54505	NC_016831	ATC	2	6	3216951	3216956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956823
54506	NC_016831	TTC	2	6	3217002	3217007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956823
54507	NC_016831	TCA	2	6	3217027	3217032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956823
54508	NC_016831	AATT	2	8	3217038	3217045	50 %	50 %	0 %	0 %	378956823
54509	NC_016831	CAA	2	6	3217091	3217096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956823
54510	NC_016831	TCG	2	6	3217150	3217155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54511	NC_016831	GCA	2	6	3217193	3217198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54512	NC_016831	GAC	2	6	3217208	3217213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54513	NC_016831	GCA	2	6	3217259	3217264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54514	NC_016831	GCAGC	2	10	3217268	3217277	20 %	0 %	40 %	40 %	378956823
54515	NC_016831	AACG	2	8	3217300	3217307	50 %	0 %	25 %	25 %	378956823
54516	NC_016831	CGCC	2	8	3217327	3217334	0 %	0 %	25 %	75 %	378956823
54517	NC_016831	CCGC	2	8	3217381	3217388	0 %	0 %	25 %	75 %	378956823
54518	NC_016831	TGT	2	6	3217400	3217405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956823
54519	NC_016831	ATC	2	6	3217438	3217443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956823
54520	NC_016831	GCG	2	6	3217488	3217493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956823
54521	NC_016831	GCA	2	6	3217508	3217513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54522	NC_016831	CGT	3	9	3217538	3217546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54523	NC_016831	TAGCG	2	10	3217574	3217583	20 %	20 %	40 %	20 %	378956823
54524	NC_016831	TCC	2	6	3217615	3217620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956823
54525	NC_016831	CCAT	2	8	3217696	3217703	25 %	25 %	0 %	50 %	378956823
54526	NC_016831	A	6	6	3217749	3217754	100 %	0 %	0 %	0 %	378956823
54527	NC_016831	ACG	2	6	3217773	3217778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54528	NC_016831	CGC	3	9	3217847	3217855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956823
54529	NC_016831	GGC	2	6	3217935	3217940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956823
54530	NC_016831	CG	3	6	3217952	3217957	0 %	0 %	50 %	50 %	378956823
54531	NC_016831	TGT	2	6	3217993	3217998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378956823
54532	NC_016831	CCA	2	6	3218015	3218020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956823
54533	NC_016831	ATG	2	6	3218053	3218058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956823
54534	NC_016831	CGA	3	9	3218059	3218067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54535	NC_016831	A	6	6	3218067	3218072	100 %	0 %	0 %	0 %	378956823
54536	NC_016831	CGT	2	6	3218096	3218101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956823
54537	NC_016831	CCT	2	6	3218120	3218125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378956823
54538	NC_016831	CCAG	2	8	3218130	3218137	25 %	0 %	25 %	50 %	378956823
54539	NC_016831	TCA	2	6	3218152	3218157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956823
54540	NC_016831	GCG	2	6	3218162	3218167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956823
54541	NC_016831	CAA	2	6	3218297	3218302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378956823
54542	NC_016831	AG	3	6	3218331	3218336	50 %	0 %	50 %	0 %	378956823
54543	NC_016831	GCT	2	6	3218492	3218497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956824
54544	NC_016831	TTCAAT	2	12	3218523	3218534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378956824
54545	NC_016831	CAT	2	6	3218603	3218608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378956824
54546	NC_016831	CAG	2	6	3218619	3218624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956824
54547	NC_016831	T	7	7	3218700	3218706	0 %	100 %	0 %	0 %	378956824
54548	NC_016831	CAG	2	6	3218711	3218716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956824
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54550	NC_016831	TCG	2	6	3218894	3218899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956824
54551	NC_016831	CCA	2	6	3218956	3218961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956824
54552	NC_016831	TTC	2	6	3219009	3219014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378956824
54553	NC_016831	TCG	2	6	3219022	3219027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956824
54554	NC_016831	TC	3	6	3219146	3219151	0 %	50 %	0 %	50 %	378956824
54555	NC_016831	GCG	2	6	3219152	3219157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378956824
54556	NC_016831	CGC	2	6	3219186	3219191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956824
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54558	NC_016831	GC	3	6	3219256	3219261	0 %	0 %	50 %	50 %	378956824
54559	NC_016831	CGC	2	6	3219266	3219271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956824
54560	NC_016831	CTG	2	6	3219355	3219360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378956824
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54564	NC_016831	CGGC	2	8	3219547	3219554	0 %	0 %	50 %	50 %	378956824
54565	NC_016831	CAC	2	6	3219587	3219592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956824
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54588	NC_016831	CGC	2	6	3220771	3220776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956826
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54592	NC_016831	TC	3	6	3221053	3221058	0 %	50 %	0 %	50 %	378956826
54593	NC_016831	GCC	2	6	3221106	3221111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378956826
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54600	NC_016831	TGATC	2	10	3221597	3221606	20 %	40 %	20 %	20 %	378956826
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54616	NC_016831	ACC	2	6	3222467	3222472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378956827
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54623	NC_016831	CAG	2	6	3222736	3222741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378956827
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54965	NC_016831	GC	3	6	3240437	3240442	0 %	0 %	50 %	50 %	378956842
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54968	NC_016831	ATA	2	6	3240537	3240542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378956842
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54999	NC_016831	ATG	2	6	3243734	3243739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378956845
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