MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 79210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016831	GC	3	6	283025	283030	0 %	0 %	50 %	50 %	378954048
5002	NC_016831	CGA	2	6	283118	283123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954048
5003	NC_016831	AAT	2	6	283159	283164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954048
5004	NC_016831	CG	3	6	283260	283265	0 %	0 %	50 %	50 %	378954049
5005	NC_016831	GGT	2	6	283275	283280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954049
5006	NC_016831	TAT	2	6	283350	283355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954049
5007	NC_016831	GCCA	2	8	283374	283381	25 %	0 %	25 %	50 %	378954049
5008	NC_016831	GAT	2	6	283395	283400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954049
5009	NC_016831	TCATTA	2	12	283405	283416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378954049
5010	NC_016831	CGC	2	6	283548	283553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954049
5011	NC_016831	TCT	2	6	283575	283580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954049
5012	NC_016831	TCG	2	6	283604	283609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954049
5013	NC_016831	TAA	2	6	283716	283721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954050
5014	NC_016831	GGC	2	6	283755	283760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954050
5015	NC_016831	GCA	2	6	283776	283781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954050
5016	NC_016831	GCG	2	6	283790	283795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954050
5017	NC_016831	TGC	2	6	283796	283801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954050
5018	NC_016831	TGA	2	6	283862	283867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954050
5019	NC_016831	GAA	2	6	283891	283896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954050
5020	NC_016831	TAT	2	6	283978	283983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954050
5021	NC_016831	CG	3	6	283984	283989	0 %	0 %	50 %	50 %	378954050
5022	NC_016831	GTAT	3	12	284105	284116	25 %	50 %	25 %	0 %	378954050
5023	NC_016831	GCG	2	6	284128	284133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954050
5024	NC_016831	TGC	2	6	284234	284239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954050
5025	NC_016831	CACT	2	8	284346	284353	25 %	25 %	0 %	50 %	378954050
5026	NC_016831	TCG	2	6	284520	284525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954051
5027	NC_016831	GTC	2	6	284615	284620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954051
5028	NC_016831	GC	4	8	284641	284648	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
5029	NC_016831	AGC	2	6	284818	284823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954051
5030	NC_016831	CAA	2	6	284995	285000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954051
5031	NC_016831	AGT	2	6	285037	285042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954051
5032	NC_016831	GGC	2	6	285083	285088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954051
5033	NC_016831	CGAT	2	8	285096	285103	25 %	25 %	25 %	25 %	378954051
5034	NC_016831	ATTA	2	8	285152	285159	50 %	50 %	0 %	0 %	378954051
5035	NC_016831	TCT	2	6	285171	285176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954051
5036	NC_016831	TTCA	2	8	285230	285237	25 %	50 %	0 %	25 %	378954051
5037	NC_016831	CGC	2	6	285247	285252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954051
5038	NC_016831	CAG	2	6	285257	285262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954051
5039	NC_016831	CCA	2	6	285265	285270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954051
5040	NC_016831	CAG	2	6	285302	285307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954051
5041	NC_016831	T	6	6	285319	285324	0 %	100 %	0 %	0 %	378954051
5042	NC_016831	CCA	2	6	285346	285351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954051
5043	NC_016831	CGC	2	6	285404	285409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954051
5044	NC_016831	GC	3	6	285411	285416	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
5045	NC_016831	GCG	2	6	285424	285429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954051
5046	NC_016831	CGC	2	6	285496	285501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954051
5047	NC_016831	GCC	2	6	285536	285541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954051
5048	NC_016831	CG	3	6	285566	285571	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
5049	NC_016831	TCA	2	6	285676	285681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954051
5050	NC_016831	CG	3	6	285688	285693	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
5051	NC_016831	TCA	2	6	285723	285728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954051
5052	NC_016831	GAA	2	6	285749	285754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954051
5053	NC_016831	CTT	2	6	285811	285816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954051
5054	NC_016831	GCA	2	6	285865	285870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954051
5055	NC_016831	CT	3	6	285900	285905	0 %	50 %	0 %	50 %	378954051
5056	NC_016831	GGCT	2	8	285917	285924	0 %	25 %	50 %	25 %	378954051
5057	NC_016831	GTT	2	6	285959	285964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954051
5058	NC_016831	CACG	2	8	285973	285980	25 %	0 %	25 %	50 %	378954051
5059	NC_016831	T	6	6	285992	285997	0 %	100 %	0 %	0 %	378954051
5060	NC_016831	TA	3	6	286027	286032	50 %	50 %	0 %	0 %	378954051
5061	NC_016831	ATC	2	6	286053	286058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954051
5062	NC_016831	GC	3	6	286062	286067	0 %	0 %	50 %	50 %	378954051
5063	NC_016831	TGG	2	6	286077	286082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954051
5064	NC_016831	TGT	2	6	286147	286152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954051
5065	NC_016831	AAAT	2	8	286404	286411	75 %	25 %	0 %	0 %	378954052
5066	NC_016831	CGT	2	6	286441	286446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954052
5067	NC_016831	GGC	3	9	286516	286524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954052
5068	NC_016831	CCA	2	6	286584	286589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954052
5069	NC_016831	CT	3	6	286619	286624	0 %	50 %	0 %	50 %	378954052
5070	NC_016831	GCC	2	6	286749	286754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954052
5071	NC_016831	GCC	2	6	286756	286761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954052
5072	NC_016831	TGA	2	6	286772	286777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954052
5073	NC_016831	CGC	2	6	286863	286868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954052
5074	NC_016831	GACCA	2	10	286879	286888	40 %	0 %	20 %	40 %	378954052
5075	NC_016831	GCT	2	6	286957	286962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954052
5076	NC_016831	AGC	2	6	287012	287017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954053
5077	NC_016831	GC	3	6	287100	287105	0 %	0 %	50 %	50 %	378954053
5078	NC_016831	CGC	2	6	287153	287158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954053
5079	NC_016831	AAC	2	6	287318	287323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954053
5080	NC_016831	ATA	2	6	287365	287370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954053
5081	NC_016831	CACCG	2	10	287497	287506	20 %	0 %	20 %	60 %	378954054
5082	NC_016831	TCA	2	6	287540	287545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954054
5083	NC_016831	T	6	6	287566	287571	0 %	100 %	0 %	0 %	378954054
5084	NC_016831	CTGG	2	8	287677	287684	0 %	25 %	50 %	25 %	378954054
5085	NC_016831	TGA	2	6	287697	287702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954054
5086	NC_016831	GCG	2	6	287745	287750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954054
5087	NC_016831	CAA	2	6	287760	287765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954054
5088	NC_016831	CGA	2	6	287787	287792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954054
5089	NC_016831	GCA	4	12	287853	287864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954054
5090	NC_016831	GGTCG	2	10	287881	287890	0 %	20 %	60 %	20 %	378954054
5091	NC_016831	GATTT	2	10	287933	287942	20 %	60 %	20 %	0 %	378954054
5092	NC_016831	T	7	7	287940	287946	0 %	100 %	0 %	0 %	378954054
5093	NC_016831	TTTC	2	8	288135	288142	0 %	75 %	0 %	25 %	378954054
5094	NC_016831	TCTGC	2	10	288171	288180	0 %	40 %	20 %	40 %	378954054
5095	NC_016831	TTTGAA	2	12	288283	288294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378954054
5096	NC_016831	TAAA	2	8	288387	288394	75 %	25 %	0 %	0 %	378954055
5097	NC_016831	TCA	2	6	288425	288430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954055
5098	NC_016831	GCC	2	6	288480	288485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954055
5099	NC_016831	GCC	2	6	288498	288503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954055
5100	NC_016831	ACCAG	2	10	288553	288562	40 %	0 %	20 %	40 %	378954055
5101	NC_016831	GCG	2	6	288602	288607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954055
5102	NC_016831	TCGC	2	8	288617	288624	0 %	25 %	25 %	50 %	378954055
5103	NC_016831	AAC	2	6	288655	288660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954055
5104	NC_016831	CCA	2	6	288668	288673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954055
5105	NC_016831	GGCGC	2	10	288688	288697	0 %	0 %	60 %	40 %	378954055
5106	NC_016831	ATT	2	6	288748	288753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954055
5107	NC_016831	ATC	2	6	288766	288771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954055
5108	NC_016831	GAT	2	6	288783	288788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954055
5109	NC_016831	ACC	2	6	288814	288819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954055
5110	NC_016831	AG	3	6	288822	288827	50 %	0 %	50 %	0 %	378954055
5111	NC_016831	GAA	2	6	288915	288920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954055
5112	NC_016831	CAT	2	6	288975	288980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954055
5113	NC_016831	TCT	2	6	289052	289057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954056
5114	NC_016831	TG	3	6	289058	289063	0 %	50 %	50 %	0 %	378954056
5115	NC_016831	CCGC	2	8	289100	289107	0 %	0 %	25 %	75 %	378954056
5116	NC_016831	GC	3	6	289119	289124	0 %	0 %	50 %	50 %	378954056
5117	NC_016831	TAA	2	6	289125	289130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954056
5118	NC_016831	TAT	2	6	289131	289136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954056
5119	NC_016831	ACG	2	6	289150	289155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954056
5120	NC_016831	CG	3	6	289154	289159	0 %	0 %	50 %	50 %	378954056
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5122	NC_016831	GCA	2	6	289209	289214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954056
5123	NC_016831	TGA	2	6	289374	289379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954056
5124	NC_016831	ACG	2	6	289450	289455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954056
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5244	NC_016831	CAG	2	6	301859	301864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954063
5245	NC_016831	GCT	2	6	302021	302026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954063
5246	NC_016831	TCA	2	6	302031	302036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954063
5247	NC_016831	CA	3	6	302035	302040	50 %	0 %	0 %	50 %	378954063
5248	NC_016831	GCAG	2	8	302092	302099	25 %	0 %	50 %	25 %	378954063
5249	NC_016831	GGCGC	2	10	302166	302175	0 %	0 %	60 %	40 %	378954063
5250	NC_016831	TGA	2	6	302182	302187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954063
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5253	NC_016831	CGG	2	6	302236	302241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954063
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5273	NC_016831	CGAT	2	8	303019	303026	25 %	25 %	25 %	25 %	378954063
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5488	NC_016831	GAA	2	6	315881	315886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954077
5489	NC_016831	TAT	2	6	315947	315952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954077
5490	NC_016831	TGAGCG	2	12	316016	316027	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378954077
5491	NC_016831	CGTT	2	8	316146	316153	0 %	50 %	25 %	25 %	378954077
5492	NC_016831	GCC	2	6	316155	316160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954077
5493	NC_016831	GC	3	6	316168	316173	0 %	0 %	50 %	50 %	378954077
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5500	NC_016831	CGC	3	9	316420	316428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954077

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