MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 chromosome

Total Repeats: 34350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016826	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	379704393
2	NC_016826	T	6	6	282	287	0 %	100 %	0 %	0 %	379704393
3	NC_016826	CGA	2	6	328	333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704393
4	NC_016826	GAA	2	6	444	449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704393
5	NC_016826	TAA	2	6	458	463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704393
6	NC_016826	AGA	2	6	473	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704393
7	NC_016826	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	379704393
8	NC_016826	TGA	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704393
9	NC_016826	ACT	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704393
10	NC_016826	TTTA	2	8	647	654	25 %	75 %	0 %	0 %	379704393
11	NC_016826	TCA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704393
12	NC_016826	GAA	2	6	804	809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704393
13	NC_016826	GAAA	2	8	812	819	75 %	0 %	25 %	0 %	379704393
14	NC_016826	TGAT	2	8	844	851	25 %	50 %	25 %	0 %	379704393
15	NC_016826	TCGC	2	8	861	868	0 %	25 %	25 %	50 %	379704393
16	NC_016826	A	7	7	870	876	100 %	0 %	0 %	0 %	379704393
17	NC_016826	AAG	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704393
18	NC_016826	AAC	2	6	930	935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704393
19	NC_016826	ATC	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704393
20	NC_016826	AAC	2	6	988	993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704393
21	NC_016826	CAAT	2	8	1024	1031	50 %	25 %	0 %	25 %	379704393
22	NC_016826	CGC	2	6	1036	1041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704393
23	NC_016826	A	6	6	1200	1205	100 %	0 %	0 %	0 %	379704393
24	NC_016826	TGC	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704393
25	NC_016826	AGA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704393
26	NC_016826	CTA	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704393
27	NC_016826	CT	3	6	1421	1426	0 %	50 %	0 %	50 %	379704393
28	NC_016826	TTC	2	6	1471	1476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704393
29	NC_016826	TAA	2	6	1484	1489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704393
30	NC_016826	GAT	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704393
31	NC_016826	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704394
32	NC_016826	CTT	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704394
33	NC_016826	AG	3	6	1776	1781	50 %	0 %	50 %	0 %	379704394
34	NC_016826	GAA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704394
35	NC_016826	CTA	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704394
36	NC_016826	CAT	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704394
37	NC_016826	CTT	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704394
38	NC_016826	GAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704394
39	NC_016826	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704394
40	NC_016826	GTC	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704394
41	NC_016826	GTT	2	6	2321	2326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704394
42	NC_016826	GCA	2	6	2354	2359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704394
43	NC_016826	GAT	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704394
44	NC_016826	TCT	3	9	2391	2399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704394
45	NC_016826	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704394
46	NC_016826	CA	3	6	2572	2577	50 %	0 %	0 %	50 %	379704394
47	NC_016826	GAA	2	6	2657	2662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704394
48	NC_016826	ATT	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704394
49	NC_016826	ATCA	2	8	2676	2683	50 %	25 %	0 %	25 %	379704394
50	NC_016826	ACTT	2	8	2714	2721	25 %	50 %	0 %	25 %	379704394
51	NC_016826	TGA	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704394
52	NC_016826	TAT	2	6	2999	3004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704395
53	NC_016826	TTA	2	6	3043	3048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704395
54	NC_016826	TTA	2	6	3236	3241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704396
55	NC_016826	A	6	6	3285	3290	100 %	0 %	0 %	0 %	379704396
56	NC_016826	AC	3	6	3297	3302	50 %	0 %	0 %	50 %	379704396
57	NC_016826	CTT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704396
58	NC_016826	TTA	2	6	3403	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704396
59	NC_016826	TTTTC	2	10	3571	3580	0 %	80 %	0 %	20 %	379704396
60	NC_016826	TAA	2	6	3587	3592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704396
61	NC_016826	TACT	2	8	3593	3600	25 %	50 %	0 %	25 %	379704396
62	NC_016826	GTG	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704396
63	NC_016826	TTA	2	6	3702	3707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704396
64	NC_016826	GCA	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704396
65	NC_016826	A	6	6	3776	3781	100 %	0 %	0 %	0 %	379704396
66	NC_016826	A	6	6	3787	3792	100 %	0 %	0 %	0 %	379704396
67	NC_016826	TGA	2	6	3827	3832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704396
68	NC_016826	TATT	2	8	3860	3867	25 %	75 %	0 %	0 %	379704396
69	NC_016826	TTG	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704397
70	NC_016826	GAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704397
71	NC_016826	A	6	6	3949	3954	100 %	0 %	0 %	0 %	379704397
72	NC_016826	ATG	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704397
73	NC_016826	GAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704397
74	NC_016826	TAT	2	6	4067	4072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704397
75	NC_016826	CAG	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704398
76	NC_016826	TTG	2	6	4193	4198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704398
77	NC_016826	GCT	2	6	4258	4263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704398
78	NC_016826	TGGTA	2	10	4296	4305	20 %	40 %	40 %	0 %	379704398
79	NC_016826	TGA	2	6	4314	4319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704398
80	NC_016826	A	7	7	4354	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	379704398
81	NC_016826	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704398
82	NC_016826	GTG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704398
83	NC_016826	GTT	2	6	4480	4485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704398
84	NC_016826	TGA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704398
85	NC_016826	TTG	2	6	4538	4543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704398
86	NC_016826	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704398
87	NC_016826	TTC	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704398
88	NC_016826	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	379704398
89	NC_016826	AGA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704398
90	NC_016826	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	379704398
91	NC_016826	ACA	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704398
92	NC_016826	GCA	2	6	4873	4878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704398
93	NC_016826	GTT	2	6	4894	4899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704398
94	NC_016826	GAA	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704398
95	NC_016826	TGA	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704398
96	NC_016826	TTC	2	6	4957	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704398
97	NC_016826	ACTT	2	8	5038	5045	25 %	50 %	0 %	25 %	379704398
98	NC_016826	AAG	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704398
99	NC_016826	CTC	2	6	5099	5104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704398
100	NC_016826	AGC	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704398
101	NC_016826	ATG	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704398
102	NC_016826	GTC	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704398
103	NC_016826	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704398
104	NC_016826	CAT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704398
105	NC_016826	AAT	2	6	5567	5572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704399
106	NC_016826	TTA	2	6	5602	5607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704399
107	NC_016826	ATG	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704399
108	NC_016826	TTCGTC	2	12	5670	5681	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379704399
109	NC_016826	TGG	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704399
110	NC_016826	ATT	2	6	5720	5725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704399
111	NC_016826	CA	4	8	5727	5734	50 %	0 %	0 %	50 %	379704399
112	NC_016826	GTT	2	6	5795	5800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704399
113	NC_016826	AC	3	6	5850	5855	50 %	0 %	0 %	50 %	379704399
114	NC_016826	TTTA	2	8	5883	5890	25 %	75 %	0 %	0 %	379704399
115	NC_016826	TTA	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704400
116	NC_016826	GAA	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704400
117	NC_016826	AGT	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704400
118	NC_016826	CTCAA	2	10	6104	6113	40 %	20 %	0 %	40 %	379704400
119	NC_016826	T	6	6	6177	6182	0 %	100 %	0 %	0 %	379704400
120	NC_016826	GAT	2	6	6186	6191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704400
121	NC_016826	TGC	3	9	6194	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704400
122	NC_016826	T	6	6	6257	6262	0 %	100 %	0 %	0 %	379704400
123	NC_016826	A	6	6	6270	6275	100 %	0 %	0 %	0 %	379704400
124	NC_016826	TTG	2	6	6318	6323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704400
125	NC_016826	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704400
126	NC_016826	CAG	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704400
127	NC_016826	TGA	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704400
128	NC_016826	CAG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704400
129	NC_016826	AGA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704400
130	NC_016826	GA	3	6	6666	6671	50 %	0 %	50 %	0 %	379704400
131	NC_016826	ACAA	2	8	6694	6701	75 %	0 %	0 %	25 %	379704400
132	NC_016826	T	6	6	6764	6769	0 %	100 %	0 %	0 %	379704400
133	NC_016826	TC	3	6	6771	6776	0 %	50 %	0 %	50 %	379704400
134	NC_016826	TCT	2	6	6829	6834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704400
135	NC_016826	TGA	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704400
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262	NC_016826	A	7	7	12317	12323	100 %	0 %	0 %	0 %	379704406
263	NC_016826	A	6	6	12343	12348	100 %	0 %	0 %	0 %	379704406
264	NC_016826	TA	4	8	12403	12410	50 %	50 %	0 %	0 %	379704406
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