MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016822	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176585
2	NC_016822	CAGG	2	8	420	427	25 %	0 %	50 %	25 %	383176585
3	NC_016822	CT	3	6	445	450	0 %	50 %	0 %	50 %	383176585
4	NC_016822	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	383176585
5	NC_016822	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176585
6	NC_016822	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
7	NC_016822	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	383176585
8	NC_016822	CGC	3	9	570	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176585
9	NC_016822	TCG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176585
10	NC_016822	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	383176585
11	NC_016822	ACT	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176585
12	NC_016822	CCG	2	6	849	854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176585
13	NC_016822	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176585
14	NC_016822	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176585
15	NC_016822	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176585
16	NC_016822	CGG	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176585
17	NC_016822	GCTG	2	8	975	982	0 %	25 %	50 %	25 %	383176585
18	NC_016822	TTG	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176585
19	NC_016822	GGAC	2	8	1013	1020	25 %	0 %	50 %	25 %	383176585
20	NC_016822	GTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176585
21	NC_016822	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176585
22	NC_016822	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
23	NC_016822	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176585
24	NC_016822	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	383176585
25	NC_016822	GTG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176585
26	NC_016822	ATC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176585
27	NC_016822	TG	3	6	1435	1440	0 %	50 %	50 %	0 %	383176585
28	NC_016822	AAG	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176585
29	NC_016822	GGT	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176585
30	NC_016822	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176585
31	NC_016822	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
32	NC_016822	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176585
33	NC_016822	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176585
34	NC_016822	GCTG	2	8	1802	1809	0 %	25 %	50 %	25 %	383176585
35	NC_016822	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176585
36	NC_016822	GAA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176585
37	NC_016822	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176585
38	NC_016822	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176585
39	NC_016822	CCAG	2	8	2003	2010	25 %	0 %	25 %	50 %	383176585
40	NC_016822	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176585
41	NC_016822	ATC	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176585
42	NC_016822	GCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176585
43	NC_016822	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
44	NC_016822	GAT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
45	NC_016822	ATTGAA	2	12	2431	2442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383176585
46	NC_016822	TGC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176585
47	NC_016822	CGA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176585
48	NC_016822	CG	4	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	383176585
49	NC_016822	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
50	NC_016822	TGA	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176585
51	NC_016822	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176585
52	NC_016822	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176585
53	NC_016822	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176585
54	NC_016822	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176586
55	NC_016822	GGC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176586
56	NC_016822	CAA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176586
57	NC_016822	GCAA	2	8	3030	3037	50 %	0 %	25 %	25 %	383176586
58	NC_016822	GGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176586
59	NC_016822	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	383176586
60	NC_016822	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176586
61	NC_016822	TGG	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176586
62	NC_016822	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176586
63	NC_016822	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176586
64	NC_016822	CAT	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176586
65	NC_016822	CAGC	2	8	3283	3290	25 %	0 %	25 %	50 %	383176586
66	NC_016822	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176586
67	NC_016822	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176586
68	NC_016822	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	383176586
69	NC_016822	CTGG	2	8	3419	3426	0 %	25 %	50 %	25 %	383176586
70	NC_016822	TTCA	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	383176586
71	NC_016822	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176586
72	NC_016822	AGCG	2	8	3565	3572	25 %	0 %	50 %	25 %	383176586
73	NC_016822	TCCGGC	2	12	3578	3589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383176586
74	NC_016822	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176586
75	NC_016822	T	6	6	3821	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	383176587
76	NC_016822	CTGA	2	8	3851	3858	25 %	25 %	25 %	25 %	383176587
77	NC_016822	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176587
78	NC_016822	TGA	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176587
79	NC_016822	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	383176587
80	NC_016822	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176587
81	NC_016822	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176587
82	NC_016822	TGA	3	9	4324	4332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176587
83	NC_016822	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176587
84	NC_016822	GC	3	6	4442	4447	0 %	0 %	50 %	50 %	383176587
85	NC_016822	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176587
86	NC_016822	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176587
87	NC_016822	TGC	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176587
88	NC_016822	ACG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176587
89	NC_016822	AAC	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176587
90	NC_016822	GTT	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176587
91	NC_016822	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176587
92	NC_016822	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176587
93	NC_016822	TG	3	6	4815	4820	0 %	50 %	50 %	0 %	383176587
94	NC_016822	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	383176587
95	NC_016822	CCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176587
96	NC_016822	TGC	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176587
97	NC_016822	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176587
98	NC_016822	ATC	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176587
99	NC_016822	GCA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176588
100	NC_016822	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176588
101	NC_016822	ACA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176588
102	NC_016822	CCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176588
103	NC_016822	CCG	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176588
104	NC_016822	CCA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176588
105	NC_016822	CTC	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176588
106	NC_016822	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176588
107	NC_016822	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176588
108	NC_016822	GCT	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176589
109	NC_016822	GGA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176589
110	NC_016822	TCA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176589
111	NC_016822	AAG	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176589
112	NC_016822	CAGT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	383176589
113	NC_016822	AAT	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176589
114	NC_016822	TCA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176589
115	NC_016822	TTC	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176589
116	NC_016822	TTC	2	6	5912	5917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176589
117	NC_016822	CAC	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176589
118	NC_016822	TGC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176589
119	NC_016822	TTG	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176589
120	NC_016822	TGA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176589
121	NC_016822	AAATCG	2	12	6152	6163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383176589
122	NC_016822	AGCG	2	8	6270	6277	25 %	0 %	50 %	25 %	383176589
123	NC_016822	GTG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176589
124	NC_016822	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176590
125	NC_016822	GCC	2	6	6760	6765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176590
126	NC_016822	GTT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176590
127	NC_016822	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176590
128	NC_016822	ATC	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176590
129	NC_016822	CGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176590
130	NC_016822	TGCCGC	2	12	7108	7119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383176590
131	NC_016822	CGC	2	6	7204	7209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176590
132	NC_016822	GCC	2	6	7210	7215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176590
133	NC_016822	GCCA	2	8	7227	7234	25 %	0 %	25 %	50 %	383176590
134	NC_016822	TTA	2	6	7284	7289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176590
135	NC_016822	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	383176591
136	NC_016822	TCC	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176591
137	NC_016822	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176591
138	NC_016822	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	383176591
139	NC_016822	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176591
140	NC_016822	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176592
141	NC_016822	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	383176592
142	NC_016822	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	383176592
143	NC_016822	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	383176592
144	NC_016822	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	383176592
145	NC_016822	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176592
146	NC_016822	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	383176592
147	NC_016822	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176592
148	NC_016822	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	383176592
149	NC_016822	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176592
150	NC_016822	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176592
151	NC_016822	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176592
152	NC_016822	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176592
153	NC_016822	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	383176592
154	NC_016822	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176592
155	NC_016822	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176592
156	NC_016822	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176592
157	NC_016822	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	383176592
158	NC_016822	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176592
159	NC_016822	A	6	6	9165	9170	100 %	0 %	0 %	0 %	383176592
160	NC_016822	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176592
161	NC_016822	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176593
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163	NC_016822	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176593
164	NC_016822	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176593
165	NC_016822	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	383176593
166	NC_016822	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176593
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168	NC_016822	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	383176593
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172	NC_016822	CAC	2	6	10010	10015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176594
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174	NC_016822	GCG	2	6	10051	10056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176594
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176	NC_016822	GAA	2	6	10149	10154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176594
177	NC_016822	CAG	2	6	10242	10247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176594
178	NC_016822	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	383176594
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180	NC_016822	CAG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176594
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231	NC_016822	CAG	2	6	12990	12995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176597
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245	NC_016822	GAA	2	6	13812	13817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176597
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247	NC_016822	CAG	2	6	13968	13973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176597
248	NC_016822	CAG	3	9	13983	13991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176597
249	NC_016822	AAC	2	6	14016	14021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176597
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252	NC_016822	A	6	6	14070	14075	100 %	0 %	0 %	0 %	383176597
253	NC_016822	ATT	2	6	14180	14185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176598
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259	NC_016822	GTC	2	6	14486	14491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176598
260	NC_016822	GCG	2	6	14497	14502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176598
261	NC_016822	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	383176598
262	NC_016822	GAA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176598
263	NC_016822	TTC	2	6	14692	14697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176598
264	NC_016822	CAG	2	6	14704	14709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176598
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267	NC_016822	GCA	2	6	14789	14794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176598
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293	NC_016822	TCT	2	6	16787	16792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176600
294	NC_016822	ACG	2	6	16798	16803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176600
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