MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_016810	CGA	2	6	827405	827410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698702
15502	NC_016810	TTA	2	6	827538	827543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698702
15503	NC_016810	TA	3	6	827563	827568	50 %	50 %	0 %	0 %	378698702
15504	NC_016810	ACAG	2	8	827582	827589	50 %	0 %	25 %	25 %	378698702
15505	NC_016810	ATT	2	6	827818	827823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698703
15506	NC_016810	TTG	2	6	827827	827832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698703
15507	NC_016810	AAT	2	6	827847	827852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698703
15508	NC_016810	TCG	2	6	827981	827986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698703
15509	NC_016810	TG	3	6	827990	827995	0 %	50 %	50 %	0 %	378698703
15510	NC_016810	T	6	6	828010	828015	0 %	100 %	0 %	0 %	378698703
15511	NC_016810	TGGCA	2	10	828026	828035	20 %	20 %	40 %	20 %	378698703
15512	NC_016810	AGAA	2	8	828069	828076	75 %	0 %	25 %	0 %	378698703
15513	NC_016810	TGG	2	6	828102	828107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698703
15514	NC_016810	GCC	2	6	828175	828180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698703
15515	NC_016810	AGT	2	6	828181	828186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698703
15516	NC_016810	CTT	2	6	828205	828210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698703
15517	NC_016810	CAA	2	6	828230	828235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698703
15518	NC_016810	TAT	2	6	828252	828257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698703
15519	NC_016810	TTC	2	6	828388	828393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698703
15520	NC_016810	TGG	2	6	828518	828523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698703
15521	NC_016810	ATT	2	6	828559	828564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698703
15522	NC_016810	ATG	2	6	828664	828669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698703
15523	NC_016810	ATT	2	6	828757	828762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698703
15524	NC_016810	GCA	2	6	828817	828822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698703
15525	NC_016810	GTT	2	6	828828	828833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698703
15526	NC_016810	GTT	2	6	828886	828891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698703
15527	NC_016810	AGT	2	6	828910	828915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698703
15528	NC_016810	ATT	2	6	828958	828963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698703
15529	NC_016810	T	6	6	828990	828995	0 %	100 %	0 %	0 %	378698703
15530	NC_016810	GTTTG	2	10	829016	829025	0 %	60 %	40 %	0 %	378698703
15531	NC_016810	TAC	2	6	829046	829051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698703
15532	NC_016810	TAT	2	6	829120	829125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698704
15533	NC_016810	CTG	2	6	829202	829207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698704
15534	NC_016810	CCG	3	9	829230	829238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698704
15535	NC_016810	CTT	2	6	829246	829251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698704
15536	NC_016810	GGC	2	6	829276	829281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698704
15537	NC_016810	CGC	3	9	829285	829293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698704
15538	NC_016810	GAC	2	6	829301	829306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698704
15539	NC_016810	GCC	2	6	829331	829336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698704
15540	NC_016810	CCA	3	9	829342	829350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698704
15541	NC_016810	CGC	2	6	829352	829357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698704
15542	NC_016810	GTC	2	6	829406	829411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698705
15543	NC_016810	CCA	2	6	829423	829428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698705
15544	NC_016810	TGA	2	6	829456	829461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698705
15545	NC_016810	TGC	2	6	829464	829469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698705
15546	NC_016810	GCC	2	6	829475	829480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698705
15547	NC_016810	GCG	2	6	829521	829526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698705
15548	NC_016810	CTGCGC	2	12	829571	829582	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378698705
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15550	NC_016810	TGC	2	6	829623	829628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698705
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15552	NC_016810	TCG	2	6	829683	829688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698705
15553	NC_016810	CG	3	6	829691	829696	0 %	0 %	50 %	50 %	378698705
15554	NC_016810	GC	3	6	829788	829793	0 %	0 %	50 %	50 %	378698705
15555	NC_016810	ACC	2	6	829817	829822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698705
15556	NC_016810	CTGG	2	8	829846	829853	0 %	25 %	50 %	25 %	378698705
15557	NC_016810	CTG	2	6	829868	829873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698705
15558	NC_016810	GGC	2	6	829930	829935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698705
15559	NC_016810	A	6	6	829958	829963	100 %	0 %	0 %	0 %	378698705
15560	NC_016810	CCTGCA	2	12	829978	829989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378698705
15561	NC_016810	CCA	2	6	829998	830003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698705
15562	NC_016810	CTG	2	6	830024	830029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698705
15563	NC_016810	GGCG	2	8	830041	830048	0 %	0 %	75 %	25 %	378698705
15564	NC_016810	TCC	2	6	830072	830077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698705
15565	NC_016810	TGG	2	6	830115	830120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698705
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15571	NC_016810	CGC	2	6	830524	830529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698705
15572	NC_016810	CGG	2	6	830577	830582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698705
15573	NC_016810	CGA	2	6	830671	830676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698705
15574	NC_016810	CGG	2	6	830739	830744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698705
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15578	NC_016810	CAGC	2	8	830878	830885	25 %	0 %	25 %	50 %	378698705
15579	NC_016810	CGG	2	6	830901	830906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698705
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15584	NC_016810	TGA	2	6	831144	831149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698705
15585	NC_016810	CAGGC	2	10	831225	831234	20 %	0 %	40 %	40 %	378698706
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15589	NC_016810	TGGC	2	8	831266	831273	0 %	25 %	50 %	25 %	378698706
15590	NC_016810	GAA	2	6	831280	831285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698706
15591	NC_016810	CTG	3	9	831299	831307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698706
15592	NC_016810	CGG	2	6	831319	831324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698706
15593	NC_016810	GCT	2	6	831325	831330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698706
15594	NC_016810	CTG	2	6	831377	831382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698706
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15597	NC_016810	CGC	2	6	831579	831584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698706
15598	NC_016810	GCT	2	6	831628	831633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698706
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15600	NC_016810	GCG	3	9	831662	831670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698706
15601	NC_016810	ACT	2	6	831714	831719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698706
15602	NC_016810	GGC	3	9	831748	831756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698706
15603	NC_016810	CGG	2	6	831769	831774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698706
15604	NC_016810	GCT	2	6	831823	831828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698706
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15607	NC_016810	A	6	6	831963	831968	100 %	0 %	0 %	0 %	378698706
15608	NC_016810	GGT	2	6	831979	831984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698706
15609	NC_016810	GCT	2	6	831985	831990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698706
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15733	NC_016810	GGAA	2	8	839002	839009	50 %	0 %	50 %	0 %	378698713
15734	NC_016810	CGCCAG	2	12	839051	839062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378698713
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15978	NC_016810	TGA	2	6	851907	851912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698725
15979	NC_016810	CGG	2	6	851937	851942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698725
15980	NC_016810	TAT	2	6	851954	851959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698725
15981	NC_016810	CCG	2	6	851998	852003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698725
15982	NC_016810	CTG	2	6	852010	852015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698725
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