MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016810	CGT	2	6	697137	697142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698588
13003	NC_016810	TCC	2	6	697199	697204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698588
13004	NC_016810	AT	3	6	697243	697248	50 %	50 %	0 %	0 %	378698588
13005	NC_016810	CAAC	2	8	697294	697301	50 %	0 %	0 %	50 %	378698588
13006	NC_016810	TCA	2	6	697308	697313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698588
13007	NC_016810	GA	3	6	697357	697362	50 %	0 %	50 %	0 %	378698588
13008	NC_016810	TTC	2	6	697553	697558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698589
13009	NC_016810	TGC	2	6	697627	697632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698589
13010	NC_016810	ACC	2	6	697686	697691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698589
13011	NC_016810	GTAA	2	8	697730	697737	50 %	25 %	25 %	0 %	378698589
13012	NC_016810	TTAAT	2	10	697912	697921	40 %	60 %	0 %	0 %	378698590
13013	NC_016810	GAA	2	6	697940	697945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698590
13014	NC_016810	GCT	2	6	697984	697989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698590
13015	NC_016810	ACC	2	6	698028	698033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698590
13016	NC_016810	GCG	2	6	698047	698052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698590
13017	NC_016810	CAG	2	6	698246	698251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698590
13018	NC_016810	T	6	6	698252	698257	0 %	100 %	0 %	0 %	378698590
13019	NC_016810	GTCC	2	8	698283	698290	0 %	25 %	25 %	50 %	378698590
13020	NC_016810	CGG	2	6	698299	698304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698590
13021	NC_016810	AATC	2	8	698306	698313	50 %	25 %	0 %	25 %	378698590
13022	NC_016810	CAG	2	6	698408	698413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698590
13023	NC_016810	TTCG	2	8	698477	698484	0 %	50 %	25 %	25 %	378698590
13024	NC_016810	TCA	2	6	698614	698619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698590
13025	NC_016810	CGA	2	6	698623	698628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698590
13026	NC_016810	CGG	2	6	698644	698649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698590
13027	NC_016810	CA	3	6	698666	698671	50 %	0 %	0 %	50 %	378698590
13028	NC_016810	GA	3	6	698713	698718	50 %	0 %	50 %	0 %	378698590
13029	NC_016810	GAG	2	6	698754	698759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698590
13030	NC_016810	TCA	2	6	698866	698871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698590
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13033	NC_016810	GC	3	6	699245	699250	0 %	0 %	50 %	50 %	378698591
13034	NC_016810	CTG	2	6	699387	699392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698591
13035	NC_016810	TGC	2	6	699412	699417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698591
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13040	NC_016810	GCTG	2	8	699508	699515	0 %	25 %	50 %	25 %	378698591
13041	NC_016810	GC	3	6	699569	699574	0 %	0 %	50 %	50 %	378698591
13042	NC_016810	GCT	3	9	699585	699593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698591
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13052	NC_016810	GGCCA	2	10	700053	700062	20 %	0 %	40 %	40 %	378698591
13053	NC_016810	TCCGC	2	10	700162	700171	0 %	20 %	20 %	60 %	378698591
13054	NC_016810	GCG	2	6	700208	700213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698591
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13056	NC_016810	TGC	2	6	700225	700230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698591
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13065	NC_016810	AGCC	2	8	700694	700701	25 %	0 %	25 %	50 %	378698592
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13091	NC_016810	GCCGT	2	10	701746	701755	0 %	20 %	40 %	40 %	378698593
13092	NC_016810	CGG	2	6	701826	701831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698593
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13104	NC_016810	AGC	2	6	702406	702411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698593
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13108	NC_016810	CG	3	6	702522	702527	0 %	0 %	50 %	50 %	378698593
13109	NC_016810	CTGC	2	8	702529	702536	0 %	25 %	25 %	50 %	378698593
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13480	NC_016810	GC	4	8	721414	721421	0 %	0 %	50 %	50 %	378698610
13481	NC_016810	TTG	2	6	721483	721488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698610
13482	NC_016810	CGC	2	6	721561	721566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698610
13483	NC_016810	CGG	2	6	721585	721590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698610
13484	NC_016810	GGT	2	6	721595	721600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698610
13485	NC_016810	T	6	6	721629	721634	0 %	100 %	0 %	0 %	378698610
13486	NC_016810	CTG	2	6	721638	721643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698610
13487	NC_016810	GGA	2	6	721652	721657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698610
13488	NC_016810	GGC	2	6	721769	721774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698610
13489	NC_016810	AGA	2	6	721781	721786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698610
13490	NC_016810	TCT	2	6	721797	721802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698610
13491	NC_016810	TGA	2	6	721846	721851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698610
13492	NC_016810	TTC	2	6	721905	721910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698610
13493	NC_016810	T	6	6	721913	721918	0 %	100 %	0 %	0 %	378698610
13494	NC_016810	CAG	2	6	722025	722030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698611
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13498	NC_016810	CAG	2	6	722163	722168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698611
13499	NC_016810	TGC	2	6	722191	722196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698611
13500	NC_016810	GTC	2	6	722197	722202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698611

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