MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016810	GCG	3	9	624113	624121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698521
11502	NC_016810	T	6	6	624122	624127	0 %	100 %	0 %	0 %	378698521
11503	NC_016810	GCT	2	6	624241	624246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698521
11504	NC_016810	CGG	2	6	624259	624264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698521
11505	NC_016810	TTC	2	6	624305	624310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698521
11506	NC_016810	GCG	2	6	624392	624397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698521
11507	NC_016810	GC	3	6	624401	624406	0 %	0 %	50 %	50 %	378698521
11508	NC_016810	A	6	6	624414	624419	100 %	0 %	0 %	0 %	378698521
11509	NC_016810	GGT	2	6	624442	624447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698521
11510	NC_016810	TGG	2	6	624480	624485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698521
11511	NC_016810	AGC	2	6	624527	624532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698521
11512	NC_016810	TGA	2	6	624540	624545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698521
11513	NC_016810	TGG	2	6	624570	624575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698521
11514	NC_016810	GTCGC	2	10	624602	624611	0 %	20 %	40 %	40 %	378698521
11515	NC_016810	GCG	2	6	624627	624632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698521
11516	NC_016810	TGG	2	6	624759	624764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698521
11517	NC_016810	CG	3	6	624875	624880	0 %	0 %	50 %	50 %	378698521
11518	NC_016810	CGT	2	6	624887	624892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698521
11519	NC_016810	CCG	2	6	624930	624935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698521
11520	NC_016810	TGC	2	6	625017	625022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698521
11521	NC_016810	GC	3	6	625146	625151	0 %	0 %	50 %	50 %	378698522
11522	NC_016810	TGA	2	6	625175	625180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698522
11523	NC_016810	CCA	2	6	625200	625205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698522
11524	NC_016810	ACG	2	6	625259	625264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11525	NC_016810	TGG	2	6	625358	625363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698522
11526	NC_016810	GCG	2	6	625411	625416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698522
11527	NC_016810	GTT	2	6	625446	625451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698522
11528	NC_016810	TGA	2	6	625472	625477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698522
11529	NC_016810	TCA	3	9	625529	625537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698522
11530	NC_016810	TGC	2	6	625572	625577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11531	NC_016810	CCG	2	6	625592	625597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698522
11532	NC_016810	TGG	2	6	625656	625661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698522
11533	NC_016810	TAT	2	6	625668	625673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698522
11534	NC_016810	CCAG	2	8	625746	625753	25 %	0 %	25 %	50 %	378698522
11535	NC_016810	CAG	2	6	625891	625896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11536	NC_016810	ATC	2	6	625901	625906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698522
11537	NC_016810	CGA	2	6	625914	625919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11538	NC_016810	GGC	2	6	625975	625980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698522
11539	NC_016810	CAG	2	6	626032	626037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11540	NC_016810	GC	3	6	626061	626066	0 %	0 %	50 %	50 %	378698522
11541	NC_016810	GTC	2	6	626069	626074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11542	NC_016810	ATG	2	6	626132	626137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698522
11543	NC_016810	AAT	2	6	626165	626170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698522
11544	NC_016810	TAA	2	6	626181	626186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698522
11545	NC_016810	GC	3	6	626231	626236	0 %	0 %	50 %	50 %	378698522
11546	NC_016810	ATA	2	6	626255	626260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698522
11547	NC_016810	CTG	2	6	626271	626276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698522
11548	NC_016810	ATA	2	6	626285	626290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698522
11549	NC_016810	CAC	2	6	626299	626304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698522
11550	NC_016810	GTG	2	6	626312	626317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698522
11551	NC_016810	TCT	2	6	626342	626347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698522
11552	NC_016810	CGCTGG	2	12	626721	626732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378698523
11553	NC_016810	CT	3	6	626761	626766	0 %	50 %	0 %	50 %	378698523
11554	NC_016810	TAA	2	6	626800	626805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698523
11555	NC_016810	ACG	2	6	626844	626849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698523
11556	NC_016810	GGC	2	6	626897	626902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11557	NC_016810	GCC	2	6	626912	626917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698523
11558	NC_016810	GGC	2	6	626918	626923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11559	NC_016810	ATA	2	6	626955	626960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698523
11560	NC_016810	G	6	6	626995	627000	0 %	0 %	100 %	0 %	378698523
11561	NC_016810	CGG	2	6	627037	627042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11562	NC_016810	GGC	3	9	627052	627060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11563	NC_016810	CAAC	2	8	627068	627075	50 %	0 %	0 %	50 %	378698523
11564	NC_016810	GCG	3	9	627113	627121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11565	NC_016810	GTG	2	6	627161	627166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698523
11566	NC_016810	GCTGG	2	10	627221	627230	0 %	20 %	60 %	20 %	378698523
11567	NC_016810	GCG	2	6	627236	627241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11568	NC_016810	GCG	2	6	627257	627262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11569	NC_016810	GCT	2	6	627328	627333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698523
11570	NC_016810	GGC	3	9	627334	627342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11571	NC_016810	AGC	2	6	627353	627358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698523
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11573	NC_016810	GCG	2	6	627410	627415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11574	NC_016810	GCAGG	2	10	627416	627425	20 %	0 %	60 %	20 %	378698523
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11578	NC_016810	ATT	2	6	627689	627694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698523
11579	NC_016810	AT	3	6	627700	627705	50 %	50 %	0 %	0 %	378698523
11580	NC_016810	CAG	2	6	627803	627808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698523
11581	NC_016810	CGG	2	6	627850	627855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11582	NC_016810	ATA	2	6	627882	627887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698523
11583	NC_016810	ATA	2	6	627912	627917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698523
11584	NC_016810	CTG	2	6	627959	627964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698523
11585	NC_016810	ATG	2	6	628020	628025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698523
11586	NC_016810	GCC	2	6	628040	628045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698523
11587	NC_016810	GACCG	2	10	628240	628249	20 %	0 %	40 %	40 %	378698523
11588	NC_016810	TGC	2	6	628251	628256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698523
11589	NC_016810	CAT	2	6	628390	628395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698523
11590	NC_016810	ATTA	2	8	628412	628419	50 %	50 %	0 %	0 %	378698523
11591	NC_016810	GAT	2	6	628436	628441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698523
11592	NC_016810	CGG	2	6	628456	628461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698523
11593	NC_016810	TGA	2	6	628649	628654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698523
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11595	NC_016810	TTA	2	6	628942	628947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698524
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11599	NC_016810	GCC	2	6	628999	629004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698524
11600	NC_016810	CGT	2	6	629034	629039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698524
11601	NC_016810	CAC	2	6	629040	629045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698524
11602	NC_016810	GCT	2	6	629117	629122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698524
11603	NC_016810	GGC	2	6	629168	629173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698524
11604	NC_016810	TGC	3	9	629203	629211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698524
11605	NC_016810	T	6	6	629237	629242	0 %	100 %	0 %	0 %	378698524
11606	NC_016810	TAA	2	6	629330	629335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698524
11607	NC_016810	ATT	2	6	629357	629362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698524
11608	NC_016810	CAGA	2	8	629392	629399	50 %	0 %	25 %	25 %	378698524
11609	NC_016810	GGC	2	6	629430	629435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698524
11610	NC_016810	CCG	2	6	629466	629471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698524
11611	NC_016810	AGC	2	6	629532	629537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698524
11612	NC_016810	T	7	7	629693	629699	0 %	100 %	0 %	0 %	378698524
11613	NC_016810	TCA	2	6	629720	629725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698524
11614	NC_016810	CGG	2	6	629789	629794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698524
11615	NC_016810	CTG	2	6	629895	629900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698524
11616	NC_016810	CGG	2	6	629929	629934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698524
11617	NC_016810	CAT	2	6	629939	629944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698524
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11619	NC_016810	TTACC	2	10	630242	630251	20 %	40 %	0 %	40 %	378698524
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11976	NC_016810	TAG	2	6	646862	646867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698541
11977	NC_016810	A	6	6	646871	646876	100 %	0 %	0 %	0 %	378698541
11978	NC_016810	GGC	2	6	647040	647045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698541
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