MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10004	NC_016810	ATA	2	6	542253	542258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698445
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10010	NC_016810	GC	3	6	542511	542516	0 %	0 %	50 %	50 %	378698446
10011	NC_016810	GCC	2	6	542523	542528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698446
10012	NC_016810	CTG	2	6	542549	542554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698446
10013	NC_016810	GCG	2	6	542606	542611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698446
10014	NC_016810	CGC	2	6	542612	542617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698446
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10017	NC_016810	GCG	2	6	542810	542815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698447
10018	NC_016810	GTG	2	6	542950	542955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698447
10019	NC_016810	CGC	2	6	543035	543040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698447
10020	NC_016810	GAT	2	6	543058	543063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698447
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10022	NC_016810	GGC	2	6	543229	543234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698447
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10028	NC_016810	TGA	2	6	543674	543679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698448
10029	NC_016810	CGTA	2	8	543827	543834	25 %	25 %	25 %	25 %	378698448
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10054	NC_016810	GCT	3	9	545195	545203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698448
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10060	NC_016810	CTG	2	6	545772	545777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698449
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10103	NC_016810	TTA	2	6	547599	547604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698451
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10227	NC_016810	GCCT	2	8	553837	553844	0 %	25 %	25 %	50 %	378698455
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10231	NC_016810	GC	3	6	553945	553950	0 %	0 %	50 %	50 %	378698455
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10237	NC_016810	TGA	2	6	554329	554334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698455
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10353	NC_016810	CCGT	2	8	560581	560588	0 %	25 %	25 %	50 %	378698461
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10356	NC_016810	GGC	2	6	560649	560654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698461
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10358	NC_016810	ACGCG	2	10	560678	560687	20 %	0 %	40 %	40 %	378698461
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10478	NC_016810	CTGG	2	8	566663	566670	0 %	25 %	50 %	25 %	378698469
10479	NC_016810	CGC	2	6	566887	566892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698469
10480	NC_016810	CTG	2	6	566988	566993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698469
10481	NC_016810	GCT	2	6	567011	567016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698469
10482	NC_016810	GTG	2	6	567078	567083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698469
10483	NC_016810	TGA	3	9	567130	567138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698469
10484	NC_016810	CGG	2	6	567206	567211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698469
10485	NC_016810	CGC	2	6	567214	567219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698469
10486	NC_016810	GCTG	2	8	567241	567248	0 %	25 %	50 %	25 %	378698469
10487	NC_016810	GCA	2	6	567329	567334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698469
10488	NC_016810	TGC	2	6	567340	567345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698469
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10490	NC_016810	CTG	2	6	567366	567371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698469
10491	NC_016810	TGG	2	6	567427	567432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698469
10492	NC_016810	CGGGC	2	10	567454	567463	0 %	0 %	60 %	40 %	378698469
10493	NC_016810	TTA	2	6	567478	567483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698469
10494	NC_016810	CCG	2	6	567514	567519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698469
10495	NC_016810	TGC	2	6	567565	567570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698469
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10498	NC_016810	TC	3	6	567649	567654	0 %	50 %	0 %	50 %	378698469
10499	NC_016810	TTG	2	6	567681	567686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698469
10500	NC_016810	TGC	2	6	567709	567714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698469

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