MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83002	NC_016810	AGA	2	6	4521455	4521460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378702105
83003	NC_016810	AAT	2	6	4521517	4521522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378702105
83004	NC_016810	TATC	2	8	4521600	4521607	25 %	50 %	0 %	25 %	378702105
83005	NC_016810	TAT	2	6	4521648	4521653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702105
83006	NC_016810	T	6	6	4521664	4521669	0 %	100 %	0 %	0 %	378702105
83007	NC_016810	TAC	2	6	4521690	4521695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702105
83008	NC_016810	TCT	2	6	4521757	4521762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378702105
83009	NC_016810	CAG	2	6	4521782	4521787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702105
83010	NC_016810	A	6	6	4521788	4521793	100 %	0 %	0 %	0 %	378702105
83011	NC_016810	CTTT	2	8	4521808	4521815	0 %	75 %	0 %	25 %	378702105
83012	NC_016810	T	7	7	4521813	4521819	0 %	100 %	0 %	0 %	378702105
83013	NC_016810	A	6	6	4521836	4521841	100 %	0 %	0 %	0 %	378702105
83014	NC_016810	ATG	2	6	4521908	4521913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702105
83015	NC_016810	GAT	2	6	4521924	4521929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702105
83016	NC_016810	GGT	2	6	4521975	4521980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702105
83017	NC_016810	ATG	2	6	4522061	4522066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702105
83018	NC_016810	T	7	7	4522096	4522102	0 %	100 %	0 %	0 %	378702105
83019	NC_016810	GTG	2	6	4522117	4522122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702105
83020	NC_016810	ATG	2	6	4522130	4522135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702105
83021	NC_016810	CAG	4	12	4522300	4522311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702105
83022	NC_016810	TTA	3	9	4522312	4522320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702105
83023	NC_016810	AGT	2	6	4522333	4522338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702105
83024	NC_016810	TCG	2	6	4522458	4522463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702105
83025	NC_016810	AAT	2	6	4522512	4522517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378702105
83026	NC_016810	ATT	2	6	4522539	4522544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702105
83027	NC_016810	CAT	2	6	4522919	4522924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702106
83028	NC_016810	CAG	2	6	4522953	4522958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702106
83029	NC_016810	CAG	2	6	4523063	4523068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702106
83030	NC_016810	GAA	2	6	4523080	4523085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378702106
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83032	NC_016810	CATT	2	8	4523799	4523806	25 %	50 %	0 %	25 %	378702107
83033	NC_016810	CAA	2	6	4524007	4524012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378702107
83034	NC_016810	TTATT	2	10	4524017	4524026	20 %	80 %	0 %	0 %	378702107
83035	NC_016810	TATT	2	8	4524062	4524069	25 %	75 %	0 %	0 %	378702107
83036	NC_016810	T	6	6	4524086	4524091	0 %	100 %	0 %	0 %	378702107
83037	NC_016810	AT	3	6	4524110	4524115	50 %	50 %	0 %	0 %	378702107
83038	NC_016810	CTTAT	2	10	4524149	4524158	20 %	60 %	0 %	20 %	378702107
83039	NC_016810	ACG	2	6	4524272	4524277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378702107
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83042	NC_016810	ATC	2	6	4524438	4524443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702107
83043	NC_016810	TTAT	2	8	4524444	4524451	25 %	75 %	0 %	0 %	378702107
83044	NC_016810	GGCA	2	8	4524466	4524473	25 %	0 %	50 %	25 %	378702107
83045	NC_016810	TGC	2	6	4524493	4524498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702107
83046	NC_016810	TGA	2	6	4524616	4524621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702107
83047	NC_016810	GAT	2	6	4524659	4524664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702107
83048	NC_016810	GTC	2	6	4524684	4524689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702107
83049	NC_016810	GGT	2	6	4524711	4524716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702107
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83052	NC_016810	TGA	2	6	4524793	4524798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702107
83053	NC_016810	A	6	6	4524805	4524810	100 %	0 %	0 %	0 %	378702107
83054	NC_016810	ATT	2	6	4524894	4524899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378702107
83055	NC_016810	TGA	2	6	4524935	4524940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378702107
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83058	NC_016810	ACC	2	6	4525193	4525198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378702107
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83060	NC_016810	CGG	2	6	4525305	4525310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378702108
83061	NC_016810	TGC	2	6	4525329	4525334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702108
83062	NC_016810	TCGT	2	8	4525381	4525388	0 %	50 %	25 %	25 %	378702108
83063	NC_016810	GCC	2	6	4525398	4525403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378702108
83064	NC_016810	T	7	7	4525496	4525502	0 %	100 %	0 %	0 %	378702108
83065	NC_016810	CCA	2	6	4525504	4525509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378702108
83066	NC_016810	TCA	2	6	4525539	4525544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378702108
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83068	NC_016810	A	8	8	4525676	4525683	100 %	0 %	0 %	0 %	378702109
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83070	NC_016810	TGG	2	6	4525997	4526002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702109
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83077	NC_016810	ACA	2	6	4526692	4526697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378702110
83078	NC_016810	TC	3	6	4526729	4526734	0 %	50 %	0 %	50 %	378702110
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83083	NC_016810	GC	3	6	4526829	4526834	0 %	0 %	50 %	50 %	378702110
83084	NC_016810	GC	3	6	4526870	4526875	0 %	0 %	50 %	50 %	378702110
83085	NC_016810	GCT	2	6	4526965	4526970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702110
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83090	NC_016810	GTG	2	6	4527570	4527575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378702111
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83109	NC_016810	ATGT	2	8	4528536	4528543	25 %	50 %	25 %	0 %	378702111
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83235	NC_016810	GCG	2	6	4534418	4534423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378702116
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83339	NC_016810	CATTT	2	10	4540191	4540200	20 %	60 %	0 %	20 %	378702123
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83344	NC_016810	GGCG	2	8	4540306	4540313	0 %	0 %	75 %	25 %	378702123
83345	NC_016810	GCT	2	6	4540327	4540332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702123
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83347	NC_016810	CTG	2	6	4540376	4540381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702123
83348	NC_016810	GTGCTG	2	12	4540493	4540504	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378702123
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83466	NC_016810	CGG	2	6	4546279	4546284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378702127
83467	NC_016810	CAAC	2	8	4546328	4546335	50 %	0 %	0 %	50 %	378702127
83468	NC_016810	CTG	2	6	4546375	4546380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378702127
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