MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_016633	AGT	2	6	2916865	2916870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317002
45003	NC_016633	AAG	2	6	2916991	2916996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317003
45004	NC_016633	AGC	2	6	2917082	2917087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317003
45005	NC_016633	TGG	2	6	2917124	2917129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317003
45006	NC_016633	TGCT	2	8	2917130	2917137	0 %	50 %	25 %	25 %	374317003
45007	NC_016633	CTTC	2	8	2917160	2917167	0 %	50 %	0 %	50 %	374317003
45008	NC_016633	TAT	2	6	2917237	2917242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317003
45009	NC_016633	CG	3	6	2917258	2917263	0 %	0 %	50 %	50 %	374317003
45010	NC_016633	TGG	2	6	2917326	2917331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317003
45011	NC_016633	ATC	2	6	2917336	2917341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317003
45012	NC_016633	TG	3	6	2917448	2917453	0 %	50 %	50 %	0 %	374317003
45013	NC_016633	GCAG	2	8	2917611	2917618	25 %	0 %	50 %	25 %	374317003
45014	NC_016633	AGA	2	6	2917656	2917661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317003
45015	NC_016633	CTT	2	6	2917664	2917669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317003
45016	NC_016633	TTTC	2	8	2917750	2917757	0 %	75 %	0 %	25 %	374317003
45017	NC_016633	CAGTG	2	10	2917833	2917842	20 %	20 %	40 %	20 %	374317003
45018	NC_016633	AAC	2	6	2917891	2917896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374317003
45019	NC_016633	TCC	2	6	2917989	2917994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317003
45020	NC_016633	ACC	2	6	2918004	2918009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317003
45021	NC_016633	A	7	7	2918010	2918016	100 %	0 %	0 %	0 %	374317003
45022	NC_016633	ATC	2	6	2918140	2918145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317003
45023	NC_016633	AACAAG	2	12	2918146	2918157	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374317003
45024	NC_016633	GCCT	2	8	2918339	2918346	0 %	25 %	25 %	50 %	374317004
45025	NC_016633	CCT	2	6	2918354	2918359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317004
45026	NC_016633	TGC	2	6	2918382	2918387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317004
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45028	NC_016633	ATGT	2	8	2918531	2918538	25 %	50 %	25 %	0 %	374317004
45029	NC_016633	AAG	2	6	2918567	2918572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317004
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45032	NC_016633	GT	3	6	2918702	2918707	0 %	50 %	50 %	0 %	374317004
45033	NC_016633	GAA	2	6	2918729	2918734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317004
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45035	NC_016633	GATT	2	8	2918808	2918815	25 %	50 %	25 %	0 %	374317004
45036	NC_016633	TCTG	2	8	2918857	2918864	0 %	50 %	25 %	25 %	374317004
45037	NC_016633	GAA	2	6	2918871	2918876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317004
45038	NC_016633	GGCC	2	8	2918898	2918905	0 %	0 %	50 %	50 %	374317004
45039	NC_016633	TTCC	2	8	2918995	2919002	0 %	50 %	0 %	50 %	374317004
45040	NC_016633	AAGA	2	8	2919136	2919143	75 %	0 %	25 %	0 %	374317004
45041	NC_016633	CTT	2	6	2919186	2919191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317004
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45044	NC_016633	GGGAA	2	10	2919375	2919384	40 %	0 %	60 %	0 %	374317005
45045	NC_016633	AAAAC	2	10	2919410	2919419	80 %	0 %	0 %	20 %	374317005
45046	NC_016633	GTTCG	2	10	2919511	2919520	0 %	40 %	40 %	20 %	374317005
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45049	NC_016633	TGA	2	6	2919674	2919679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317005
45050	NC_016633	CT	3	6	2919701	2919706	0 %	50 %	0 %	50 %	374317005
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45052	NC_016633	GTC	2	6	2919805	2919810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317005
45053	NC_016633	AGA	2	6	2919825	2919830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317005
45054	NC_016633	GTG	2	6	2919881	2919886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317005
45055	NC_016633	TCC	2	6	2919973	2919978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317005
45056	NC_016633	GGA	2	6	2920024	2920029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317005
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45058	NC_016633	GAA	2	6	2920063	2920068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317005
45059	NC_016633	TGCA	2	8	2920081	2920088	25 %	25 %	25 %	25 %	374317005
45060	NC_016633	GGT	2	6	2920230	2920235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317005
45061	NC_016633	CTT	2	6	2920258	2920263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317005
45062	NC_016633	TGCT	2	8	2920329	2920336	0 %	50 %	25 %	25 %	374317005
45063	NC_016633	TACC	2	8	2920416	2920423	25 %	25 %	0 %	50 %	374317005
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45067	NC_016633	T	6	6	2920796	2920801	0 %	100 %	0 %	0 %	374317006
45068	NC_016633	G	7	7	2920936	2920942	0 %	0 %	100 %	0 %	374317006
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45082	NC_016633	TTGG	2	8	2921932	2921939	0 %	50 %	50 %	0 %	374317006
45083	NC_016633	GTT	2	6	2922014	2922019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317006
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45112	NC_016633	GGAT	2	8	2923701	2923708	25 %	25 %	50 %	0 %	374317006
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45118	NC_016633	C	6	6	2924651	2924656	0 %	0 %	0 %	100 %	374317007
45119	NC_016633	AAGA	2	8	2924715	2924722	75 %	0 %	25 %	0 %	374317007
45120	NC_016633	CTT	2	6	2924764	2924769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317007
45121	NC_016633	GAA	2	6	2924798	2924803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317007
45122	NC_016633	TAT	2	6	2924823	2924828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317007
45123	NC_016633	GGA	2	6	2924858	2924863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317007
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45125	NC_016633	AAG	2	6	2924925	2924930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317007
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45127	NC_016633	GCC	3	9	2925120	2925128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374317008
45128	NC_016633	TGA	2	6	2925131	2925136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317008
45129	NC_016633	CTG	2	6	2925146	2925151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317008
45130	NC_016633	TCC	2	6	2925339	2925344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317008
45131	NC_016633	CATTT	2	10	2925372	2925381	20 %	60 %	0 %	20 %	374317008
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45145	NC_016633	CGA	2	6	2926149	2926154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317009
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45149	NC_016633	ACC	2	6	2926273	2926278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317009
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45159	NC_016633	TCCT	2	8	2926859	2926866	0 %	50 %	0 %	50 %	374317010
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45226	NC_016633	ATG	2	6	2930116	2930121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317014
45227	NC_016633	GGC	2	6	2930162	2930167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317014
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45229	NC_016633	GTC	2	6	2930246	2930251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317014
45230	NC_016633	TTC	2	6	2930259	2930264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317014
45231	NC_016633	TC	4	8	2930302	2930309	0 %	50 %	0 %	50 %	374317014
45232	NC_016633	CGA	2	6	2930321	2930326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317014
45233	NC_016633	T	6	6	2930374	2930379	0 %	100 %	0 %	0 %	374317014
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45470	NC_016633	ATG	2	6	2944589	2944594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317026
45471	NC_016633	TGA	2	6	2944604	2944609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317026
45472	NC_016633	GAG	2	6	2944625	2944630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317026
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