MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016633	TCT	2	6	259292	259297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314684
4003	NC_016633	TG	3	6	259310	259315	0 %	50 %	50 %	0 %	374314684
4004	NC_016633	AG	3	6	259380	259385	50 %	0 %	50 %	0 %	374314684
4005	NC_016633	GTT	2	6	259460	259465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314684
4006	NC_016633	T	7	7	259563	259569	0 %	100 %	0 %	0 %	374314684
4007	NC_016633	TGGGA	2	10	259829	259838	20 %	20 %	60 %	0 %	374314685
4008	NC_016633	AAAC	2	8	259873	259880	75 %	0 %	0 %	25 %	374314685
4009	NC_016633	GTGC	2	8	259907	259914	0 %	25 %	50 %	25 %	374314685
4010	NC_016633	GAT	2	6	259938	259943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314685
4011	NC_016633	T	6	6	259972	259977	0 %	100 %	0 %	0 %	374314685
4012	NC_016633	TTGC	2	8	260035	260042	0 %	50 %	25 %	25 %	374314685
4013	NC_016633	TCC	2	6	260046	260051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314685
4014	NC_016633	GAA	2	6	260067	260072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314685
4015	NC_016633	GAC	2	6	260157	260162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314685
4016	NC_016633	TGG	2	6	260185	260190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314685
4017	NC_016633	TTTGAG	2	12	260199	260210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374314685
4018	NC_016633	TCA	2	6	260352	260357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314686
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4020	NC_016633	GTT	2	6	261429	261434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314687
4021	NC_016633	T	6	6	261455	261460	0 %	100 %	0 %	0 %	374314687
4022	NC_016633	GAT	2	6	261463	261468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314687
4023	NC_016633	GATG	2	8	261481	261488	25 %	25 %	50 %	0 %	374314687
4024	NC_016633	G	6	6	261488	261493	0 %	0 %	100 %	0 %	374314687
4025	NC_016633	CGA	2	6	261516	261521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314687
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4028	NC_016633	CTGC	2	8	261675	261682	0 %	25 %	25 %	50 %	374314687
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4033	NC_016633	TTGAT	2	10	262124	262133	20 %	60 %	20 %	0 %	374314687
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4037	NC_016633	AGGAG	2	10	262316	262325	40 %	0 %	60 %	0 %	374314688
4038	NC_016633	CCTT	2	8	262345	262352	0 %	50 %	0 %	50 %	374314688
4039	NC_016633	TGT	2	6	262651	262656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314688
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4044	NC_016633	CT	3	6	263077	263082	0 %	50 %	0 %	50 %	374314689
4045	NC_016633	TTGAA	2	10	263094	263103	40 %	40 %	20 %	0 %	374314689
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4048	NC_016633	CATAG	2	10	263204	263213	40 %	20 %	20 %	20 %	374314689
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4053	NC_016633	GTTT	2	8	263458	263465	0 %	75 %	25 %	0 %	374314689
4054	NC_016633	TCC	2	6	263494	263499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314689
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4058	NC_016633	AGT	2	6	263764	263769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314689
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4062	NC_016633	TCA	2	6	263891	263896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314690
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4087	NC_016633	CCTT	2	8	265231	265238	0 %	50 %	0 %	50 %	374314691
4088	NC_016633	TCT	2	6	265280	265285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314691
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4094	NC_016633	GGGTG	2	10	265510	265519	0 %	20 %	80 %	0 %	374314691
4095	NC_016633	T	6	6	265792	265797	0 %	100 %	0 %	0 %	374314691
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4098	NC_016633	GATC	2	8	265945	265952	25 %	25 %	25 %	25 %	374314691
4099	NC_016633	GCTTTG	2	12	266019	266030	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374314691
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4102	NC_016633	CAGA	2	8	266206	266213	50 %	0 %	25 %	25 %	374314691
4103	NC_016633	G	6	6	266249	266254	0 %	0 %	100 %	0 %	374314691
4104	NC_016633	A	6	6	266269	266274	100 %	0 %	0 %	0 %	374314691
4105	NC_016633	AAGG	2	8	266336	266343	50 %	0 %	50 %	0 %	374314691
4106	NC_016633	AAG	2	6	266427	266432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314691
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4108	NC_016633	GCA	2	6	266618	266623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314691
4109	NC_016633	AT	3	6	266629	266634	50 %	50 %	0 %	0 %	374314691
4110	NC_016633	AGG	2	6	266733	266738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314691
4111	NC_016633	CCGATG	2	12	266781	266792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374314691
4112	NC_016633	A	6	6	266812	266817	100 %	0 %	0 %	0 %	374314691
4113	NC_016633	TTC	2	6	266855	266860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314691
4114	NC_016633	ATG	2	6	266915	266920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314691
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4118	NC_016633	A	6	6	267153	267158	100 %	0 %	0 %	0 %	374314691
4119	NC_016633	CAT	2	6	267214	267219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314691
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4121	NC_016633	GGC	2	6	267236	267241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314691
4122	NC_016633	TTCTC	2	10	267245	267254	0 %	60 %	0 %	40 %	374314691
4123	NC_016633	GAA	2	6	267257	267262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314691
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4153	NC_016633	AAAAG	2	10	270600	270609	80 %	0 %	20 %	0 %	374314694
4154	NC_016633	A	8	8	270628	270635	100 %	0 %	0 %	0 %	374314694
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4161	NC_016633	AAG	2	6	271062	271067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314695
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4242	NC_016633	ATC	2	6	275719	275724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314700
4243	NC_016633	GAA	2	6	275773	275778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314700
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4364	NC_016633	CTTG	2	8	283423	283430	0 %	50 %	25 %	25 %	374314706
4365	NC_016633	GAA	2	6	283492	283497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314706
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4489	NC_016633	TGTC	2	8	292560	292567	0 %	50 %	25 %	25 %	374314713
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4495	NC_016633	CT	3	6	292840	292845	0 %	50 %	0 %	50 %	374314713
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