MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_016633	TGT	2	6	2854072	2854077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374316941
44003	NC_016633	ATG	2	6	2854206	2854211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316941
44004	NC_016633	TAT	2	6	2854249	2854254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374316941
44005	NC_016633	CAGG	2	8	2854274	2854281	25 %	0 %	50 %	25 %	374316941
44006	NC_016633	T	8	8	2854329	2854336	0 %	100 %	0 %	0 %	374316941
44007	NC_016633	GAGC	2	8	2854362	2854369	25 %	0 %	50 %	25 %	374316941
44008	NC_016633	TAT	2	6	2854439	2854444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374316941
44009	NC_016633	ATT	2	6	2854450	2854455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374316941
44010	NC_016633	ATT	2	6	2854542	2854547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374316941
44011	NC_016633	ACAA	2	8	2854595	2854602	75 %	0 %	0 %	25 %	374316941
44012	NC_016633	TGG	2	6	2854603	2854608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374316941
44013	NC_016633	ACC	2	6	2854634	2854639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374316941
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44015	NC_016633	AC	3	6	2854706	2854711	50 %	0 %	0 %	50 %	374316942
44016	NC_016633	GGAT	2	8	2854800	2854807	25 %	25 %	50 %	0 %	374316942
44017	NC_016633	ACC	2	6	2854925	2854930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374316942
44018	NC_016633	CT	3	6	2855019	2855024	0 %	50 %	0 %	50 %	374316942
44019	NC_016633	T	6	6	2855105	2855110	0 %	100 %	0 %	0 %	374316942
44020	NC_016633	GGCT	2	8	2855130	2855137	0 %	25 %	50 %	25 %	374316942
44021	NC_016633	GTTT	2	8	2855152	2855159	0 %	75 %	25 %	0 %	374316942
44022	NC_016633	AGGC	2	8	2855184	2855191	25 %	0 %	50 %	25 %	374316942
44023	NC_016633	TCA	2	6	2855343	2855348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374316942
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44025	NC_016633	GCCA	2	8	2855383	2855390	25 %	0 %	25 %	50 %	374316942
44026	NC_016633	GATA	2	8	2855599	2855606	50 %	25 %	25 %	0 %	374316942
44027	NC_016633	GTG	2	6	2855631	2855636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374316942
44028	NC_016633	T	7	7	2855734	2855740	0 %	100 %	0 %	0 %	374316942
44029	NC_016633	CTT	2	6	2855837	2855842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374316943
44030	NC_016633	CCT	2	6	2855906	2855911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374316943
44031	NC_016633	T	7	7	2855959	2855965	0 %	100 %	0 %	0 %	374316943
44032	NC_016633	TTG	2	6	2855969	2855974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374316943
44033	NC_016633	GTG	2	6	2856039	2856044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374316943
44034	NC_016633	CCGG	2	8	2856113	2856120	0 %	0 %	50 %	50 %	374316943
44035	NC_016633	GAT	2	6	2856153	2856158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316943
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44039	NC_016633	TC	3	6	2856334	2856339	0 %	50 %	0 %	50 %	374316943
44040	NC_016633	TTC	2	6	2856354	2856359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374316943
44041	NC_016633	CATG	2	8	2856515	2856522	25 %	25 %	25 %	25 %	374316943
44042	NC_016633	TTC	2	6	2856552	2856557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374316943
44043	NC_016633	AC	3	6	2856611	2856616	50 %	0 %	0 %	50 %	374316943
44044	NC_016633	TTC	2	6	2856675	2856680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374316943
44045	NC_016633	TGGTG	2	10	2856944	2856953	0 %	40 %	60 %	0 %	374316944
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44049	NC_016633	ATG	2	6	2857159	2857164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316944
44050	NC_016633	TGG	2	6	2857335	2857340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374316944
44051	NC_016633	AT	3	6	2857347	2857352	50 %	50 %	0 %	0 %	374316944
44052	NC_016633	ATC	2	6	2857355	2857360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374316944
44053	NC_016633	GAT	2	6	2857503	2857508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316944
44054	NC_016633	ACT	2	6	2857514	2857519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374316944
44055	NC_016633	TCC	2	6	2857553	2857558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374316944
44056	NC_016633	GAT	2	6	2857568	2857573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316944
44057	NC_016633	GCA	2	6	2857584	2857589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374316944
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44059	NC_016633	GGT	2	6	2857703	2857708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374316944
44060	NC_016633	GAT	2	6	2857724	2857729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316944
44061	NC_016633	GGA	2	6	2857841	2857846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374316944
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44063	NC_016633	ACA	2	6	2857980	2857985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374316944
44064	NC_016633	T	7	7	2858207	2858213	0 %	100 %	0 %	0 %	374316945
44065	NC_016633	ACC	2	6	2858215	2858220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374316945
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44068	NC_016633	GAA	2	6	2858334	2858339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374316945
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44071	NC_016633	TA	3	6	2858428	2858433	50 %	50 %	0 %	0 %	374316945
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44077	NC_016633	TGA	2	6	2858766	2858771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374316945
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44100	NC_016633	CGTAGC	2	12	2860236	2860247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374316947
44101	NC_016633	AAAG	2	8	2860276	2860283	75 %	0 %	25 %	0 %	374316947
44102	NC_016633	TTCTT	2	10	2860311	2860320	0 %	80 %	0 %	20 %	374316947
44103	NC_016633	AAT	2	6	2860362	2860367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374316947
44104	NC_016633	TGGT	2	8	2860450	2860457	0 %	50 %	50 %	0 %	374316947
44105	NC_016633	AAAG	2	8	2860466	2860473	75 %	0 %	25 %	0 %	374316947
44106	NC_016633	TCA	2	6	2860487	2860492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374316947
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44114	NC_016633	T	6	6	2860856	2860861	0 %	100 %	0 %	0 %	374316947
44115	NC_016633	GAC	2	6	2860933	2860938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374316947
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44118	NC_016633	GTTG	2	8	2861126	2861133	0 %	50 %	50 %	0 %	374316948
44119	NC_016633	CGGC	2	8	2861140	2861147	0 %	0 %	50 %	50 %	374316948
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44221	NC_016633	A	7	7	2867701	2867707	100 %	0 %	0 %	0 %	374316953
44222	NC_016633	T	6	6	2867924	2867929	0 %	100 %	0 %	0 %	374316953
44223	NC_016633	CCTTCT	2	12	2867941	2867952	0 %	50 %	0 %	50 %	374316954
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44225	NC_016633	CAG	2	6	2868003	2868008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374316954
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44229	NC_016633	CAA	2	6	2868099	2868104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374316954
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44232	NC_016633	ATCC	2	8	2868173	2868180	25 %	25 %	0 %	50 %	374316954
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44234	NC_016633	CAA	2	6	2868256	2868261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374316954
44235	NC_016633	CATA	2	8	2868271	2868278	50 %	25 %	0 %	25 %	374316954
44236	NC_016633	CA	3	6	2868292	2868297	50 %	0 %	0 %	50 %	374316954
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44239	NC_016633	TGG	2	6	2868498	2868503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374316954
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44285	NC_016633	CAT	2	6	2871280	2871285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374316956
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44464	NC_016633	G	6	6	2882147	2882152	0 %	0 %	100 %	0 %	374316967
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