MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016633	CAG	2	6	1165357	1165362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315468
18003	NC_016633	TGT	2	6	1165370	1165375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315468
18004	NC_016633	A	6	6	1165384	1165389	100 %	0 %	0 %	0 %	374315468
18005	NC_016633	AG	3	6	1165422	1165427	50 %	0 %	50 %	0 %	374315468
18006	NC_016633	CTT	2	6	1165574	1165579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315468
18007	NC_016633	ACA	2	6	1165588	1165593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315468
18008	NC_016633	GAAG	2	8	1165617	1165624	50 %	0 %	50 %	0 %	374315468
18009	NC_016633	CTT	2	6	1165813	1165818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315469
18010	NC_016633	CTTT	2	8	1165858	1165865	0 %	75 %	0 %	25 %	374315469
18011	NC_016633	TCT	2	6	1165950	1165955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315469
18012	NC_016633	GAG	2	6	1165971	1165976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315469
18013	NC_016633	CAA	2	6	1166051	1166056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315469
18014	NC_016633	TCC	2	6	1166255	1166260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315469
18015	NC_016633	ACTT	2	8	1166279	1166286	25 %	50 %	0 %	25 %	374315469
18016	NC_016633	CTTT	2	8	1166425	1166432	0 %	75 %	0 %	25 %	374315469
18017	NC_016633	TCA	2	6	1166449	1166454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315469
18018	NC_016633	CAA	2	6	1166526	1166531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315470
18019	NC_016633	GGA	2	6	1166571	1166576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315470
18020	NC_016633	TTG	2	6	1166594	1166599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315470
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18022	NC_016633	TCT	2	6	1166811	1166816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315470
18023	NC_016633	GCA	2	6	1166840	1166845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315470
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18025	NC_016633	GTCTG	2	10	1167074	1167083	0 %	40 %	40 %	20 %	374315470
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18029	NC_016633	TGA	2	6	1167303	1167308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315470
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18032	NC_016633	CCT	2	6	1167374	1167379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315471
18033	NC_016633	AT	3	6	1167411	1167416	50 %	50 %	0 %	0 %	374315471
18034	NC_016633	CTG	2	6	1167560	1167565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315471
18035	NC_016633	ATCC	2	8	1167612	1167619	25 %	25 %	0 %	50 %	374315471
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18039	NC_016633	AAGA	2	8	1167837	1167844	75 %	0 %	25 %	0 %	374315471
18040	NC_016633	TTG	2	6	1167850	1167855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315471
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18042	NC_016633	TA	3	6	1167984	1167989	50 %	50 %	0 %	0 %	374315471
18043	NC_016633	ACCCC	2	10	1168051	1168060	20 %	0 %	0 %	80 %	374315471
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18052	NC_016633	GAT	2	6	1168664	1168669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315472
18053	NC_016633	CG	3	6	1168756	1168761	0 %	0 %	50 %	50 %	374315472
18054	NC_016633	CTG	2	6	1168775	1168780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315472
18055	NC_016633	TCCC	2	8	1168783	1168790	0 %	25 %	0 %	75 %	374315472
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18059	NC_016633	CAT	2	6	1169297	1169302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315472
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18063	NC_016633	ATG	2	6	1169517	1169522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315472
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18103	NC_016633	AT	3	6	1172306	1172311	50 %	50 %	0 %	0 %	374315475
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18471	NC_016633	T	6	6	1196037	1196042	0 %	100 %	0 %	0 %	374315490
18472	NC_016633	GTT	2	6	1196081	1196086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315491
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18494	NC_016633	ACG	2	6	1197213	1197218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315492
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18499	NC_016633	GCA	2	6	1197496	1197501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315492
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