MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016633	GCC	2	6	1133894	1133899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315439
17502	NC_016633	CAA	2	6	1133928	1133933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315439
17503	NC_016633	CTT	2	6	1134019	1134024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315439
17504	NC_016633	TCCA	2	8	1134041	1134048	25 %	25 %	0 %	50 %	374315439
17505	NC_016633	TTG	2	6	1134080	1134085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315439
17506	NC_016633	AAC	2	6	1134097	1134102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315439
17507	NC_016633	ATCT	2	8	1134166	1134173	25 %	50 %	0 %	25 %	374315439
17508	NC_016633	GCAG	2	8	1134259	1134266	25 %	0 %	50 %	25 %	374315439
17509	NC_016633	AC	3	6	1134269	1134274	50 %	0 %	0 %	50 %	374315439
17510	NC_016633	ACCA	2	8	1134301	1134308	50 %	0 %	0 %	50 %	374315439
17511	NC_016633	CAGG	2	8	1134365	1134372	25 %	0 %	50 %	25 %	374315439
17512	NC_016633	AAAG	2	8	1134383	1134390	75 %	0 %	25 %	0 %	374315439
17513	NC_016633	GCA	2	6	1134458	1134463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315439
17514	NC_016633	CCTT	2	8	1134607	1134614	0 %	50 %	0 %	50 %	374315439
17515	NC_016633	TGGC	2	8	1134899	1134906	0 %	25 %	50 %	25 %	374315439
17516	NC_016633	CAT	2	6	1134963	1134968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315439
17517	NC_016633	ACC	2	6	1134985	1134990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315439
17518	NC_016633	CCA	2	6	1135023	1135028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315439
17519	NC_016633	AAT	2	6	1135036	1135041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315439
17520	NC_016633	CGT	2	6	1135159	1135164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315440
17521	NC_016633	TCG	2	6	1135217	1135222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315440
17522	NC_016633	CAA	2	6	1135225	1135230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315440
17523	NC_016633	TCCT	2	8	1135270	1135277	0 %	50 %	0 %	50 %	374315440
17524	NC_016633	CAG	2	6	1135302	1135307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315440
17525	NC_016633	TC	4	8	1135428	1135435	0 %	50 %	0 %	50 %	374315440
17526	NC_016633	TGA	2	6	1135515	1135520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315440
17527	NC_016633	GAC	2	6	1135675	1135680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315440
17528	NC_016633	CATG	2	8	1135779	1135786	25 %	25 %	25 %	25 %	374315440
17529	NC_016633	CGC	2	6	1135797	1135802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315440
17530	NC_016633	TGCC	2	8	1135833	1135840	0 %	25 %	25 %	50 %	374315440
17531	NC_016633	CCAA	2	8	1136117	1136124	50 %	0 %	0 %	50 %	374315440
17532	NC_016633	TCA	2	6	1136231	1136236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315440
17533	NC_016633	GCA	2	6	1136249	1136254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315440
17534	NC_016633	AG	3	6	1136281	1136286	50 %	0 %	50 %	0 %	374315440
17535	NC_016633	C	6	6	1136306	1136311	0 %	0 %	0 %	100 %	374315440
17536	NC_016633	CCG	2	6	1136336	1136341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315440
17537	NC_016633	GGCA	2	8	1136370	1136377	25 %	0 %	50 %	25 %	374315440
17538	NC_016633	TCGA	2	8	1136459	1136466	25 %	25 %	25 %	25 %	374315440
17539	NC_016633	GGAA	2	8	1136550	1136557	50 %	0 %	50 %	0 %	374315440
17540	NC_016633	C	6	6	1136566	1136571	0 %	0 %	0 %	100 %	374315440
17541	NC_016633	GCT	2	6	1136573	1136578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315440
17542	NC_016633	CAC	2	6	1136583	1136588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315440
17543	NC_016633	TCA	2	6	1136706	1136711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315440
17544	NC_016633	TG	3	6	1136718	1136723	0 %	50 %	50 %	0 %	374315440
17545	NC_016633	TCA	2	6	1136745	1136750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315440
17546	NC_016633	TGCGG	2	10	1136867	1136876	0 %	20 %	60 %	20 %	374315441
17547	NC_016633	CAT	2	6	1136954	1136959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315441
17548	NC_016633	TGG	2	6	1136974	1136979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315441
17549	NC_016633	ATCC	2	8	1136996	1137003	25 %	25 %	0 %	50 %	374315441
17550	NC_016633	TCA	2	6	1137111	1137116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315441
17551	NC_016633	GGT	2	6	1137208	1137213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315441
17552	NC_016633	GCTG	2	8	1137268	1137275	0 %	25 %	50 %	25 %	374315441
17553	NC_016633	AGTC	2	8	1137305	1137312	25 %	25 %	25 %	25 %	374315441
17554	NC_016633	TCT	2	6	1137313	1137318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315441
17555	NC_016633	CCG	2	6	1137435	1137440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315441
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17560	NC_016633	CGGA	2	8	1137590	1137597	25 %	0 %	50 %	25 %	374315441
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17565	NC_016633	GTCCG	2	10	1137806	1137815	0 %	20 %	40 %	40 %	374315441
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17567	NC_016633	CCTT	2	8	1137860	1137867	0 %	50 %	0 %	50 %	374315442
17568	NC_016633	GCA	2	6	1137902	1137907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315442
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17570	NC_016633	TCG	2	6	1137965	1137970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315442
17571	NC_016633	GAT	2	6	1138189	1138194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315442
17572	NC_016633	GAT	2	6	1138294	1138299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315442
17573	NC_016633	CCT	2	6	1138361	1138366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315443
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17575	NC_016633	CCG	2	6	1138528	1138533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315443
17576	NC_016633	ACAGC	2	10	1138561	1138570	40 %	0 %	20 %	40 %	374315443
17577	NC_016633	CGT	2	6	1138598	1138603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315443
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17581	NC_016633	ATCGAT	2	12	1138833	1138844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374315443
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17584	NC_016633	TGCCA	2	10	1139178	1139187	20 %	20 %	20 %	40 %	374315443
17585	NC_016633	CGTA	2	8	1139237	1139244	25 %	25 %	25 %	25 %	374315443
17586	NC_016633	AAT	2	6	1139342	1139347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315443
17587	NC_016633	GCC	2	6	1139398	1139403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315443
17588	NC_016633	ATG	2	6	1139548	1139553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315443
17589	NC_016633	AGCC	2	8	1139705	1139712	25 %	0 %	25 %	50 %	374315444
17590	NC_016633	AATC	2	8	1139776	1139783	50 %	25 %	0 %	25 %	374315444
17591	NC_016633	ACC	2	6	1139973	1139978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315444
17592	NC_016633	GCG	2	6	1139979	1139984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315444
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17598	NC_016633	AG	3	6	1140479	1140484	50 %	0 %	50 %	0 %	374315444
17599	NC_016633	CAGG	2	8	1140503	1140510	25 %	0 %	50 %	25 %	374315444
17600	NC_016633	CAG	2	6	1140536	1140541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315444
17601	NC_016633	CTGGAC	2	12	1140548	1140559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374315444
17602	NC_016633	CCTG	2	8	1140564	1140571	0 %	25 %	25 %	50 %	374315444
17603	NC_016633	TCA	2	6	1140609	1140614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315444
17604	NC_016633	TGC	2	6	1140670	1140675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315444
17605	NC_016633	GCC	2	6	1140695	1140700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315444
17606	NC_016633	AGGA	2	8	1140769	1140776	50 %	0 %	50 %	0 %	374315444
17607	NC_016633	A	6	6	1140795	1140800	100 %	0 %	0 %	0 %	374315444
17608	NC_016633	CGT	2	6	1140808	1140813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315444
17609	NC_016633	ATC	2	6	1140861	1140866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315444
17610	NC_016633	TGA	2	6	1140892	1140897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315444
17611	NC_016633	TTC	2	6	1140999	1141004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315444
17612	NC_016633	GCTTCA	2	12	1141039	1141050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374315444
17613	NC_016633	TCCCC	2	10	1141180	1141189	0 %	20 %	0 %	80 %	374315444
17614	NC_016633	ATTAT	2	10	1141227	1141236	40 %	60 %	0 %	0 %	374315444
17615	NC_016633	TCG	2	6	1141243	1141248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315445
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17617	NC_016633	GCT	2	6	1141309	1141314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315445
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17733	NC_016633	TGA	2	6	1149119	1149124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315452
17734	NC_016633	AT	4	8	1149152	1149159	50 %	50 %	0 %	0 %	374315452
17735	NC_016633	CGT	2	6	1149164	1149169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315452
17736	NC_016633	TCA	2	6	1149254	1149259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315452
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