MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016633	ACTG	2	8	840249	840256	25 %	25 %	25 %	25 %	374315192
13002	NC_016633	GGTCC	2	10	840276	840285	0 %	20 %	40 %	40 %	374315192
13003	NC_016633	AAGA	2	8	840289	840296	75 %	0 %	25 %	0 %	374315192
13004	NC_016633	ACAA	2	8	840310	840317	75 %	0 %	0 %	25 %	374315192
13005	NC_016633	AAT	2	6	840320	840325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315192
13006	NC_016633	TCA	2	6	840375	840380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315193
13007	NC_016633	TCCT	2	8	840442	840449	0 %	50 %	0 %	50 %	374315193
13008	NC_016633	TACC	2	8	840601	840608	25 %	25 %	0 %	50 %	374315193
13009	NC_016633	AG	3	6	840667	840672	50 %	0 %	50 %	0 %	374315193
13010	NC_016633	CCTC	2	8	840687	840694	0 %	25 %	0 %	75 %	374315193
13011	NC_016633	A	7	7	840713	840719	100 %	0 %	0 %	0 %	374315193
13012	NC_016633	GCC	3	9	841094	841102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315193
13013	NC_016633	GCA	2	6	841133	841138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315193
13014	NC_016633	CTGCA	2	10	841165	841174	20 %	20 %	20 %	40 %	374315193
13015	NC_016633	CA	3	6	841198	841203	50 %	0 %	0 %	50 %	374315193
13016	NC_016633	CAG	2	6	841225	841230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315193
13017	NC_016633	ATCAA	2	10	841322	841331	60 %	20 %	0 %	20 %	374315193
13018	NC_016633	GAAG	2	8	841355	841362	50 %	0 %	50 %	0 %	374315193
13019	NC_016633	AGC	2	6	841450	841455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315193
13020	NC_016633	TACT	2	8	841470	841477	25 %	50 %	0 %	25 %	374315193
13021	NC_016633	AAGC	2	8	841567	841574	50 %	0 %	25 %	25 %	374315194
13022	NC_016633	GAA	2	6	841598	841603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315194
13023	NC_016633	AGCCT	2	10	841604	841613	20 %	20 %	20 %	40 %	374315194
13024	NC_016633	GAA	2	6	841619	841624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315194
13025	NC_016633	A	6	6	841640	841645	100 %	0 %	0 %	0 %	374315194
13026	NC_016633	A	7	7	841760	841766	100 %	0 %	0 %	0 %	374315195
13027	NC_016633	ACA	2	6	841842	841847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315195
13028	NC_016633	ACA	2	6	841872	841877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315195
13029	NC_016633	AAC	2	6	841927	841932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315195
13030	NC_016633	GAT	2	6	841949	841954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315195
13031	NC_016633	TCGC	2	8	842067	842074	0 %	25 %	25 %	50 %	374315195
13032	NC_016633	ATC	2	6	842111	842116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315195
13033	NC_016633	CTT	2	6	842225	842230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315195
13034	NC_016633	TGG	2	6	842250	842255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315195
13035	NC_016633	TCC	2	6	842282	842287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315195
13036	NC_016633	AAT	2	6	842314	842319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315195
13037	NC_016633	CCA	2	6	842326	842331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315195
13038	NC_016633	G	6	6	842385	842390	0 %	0 %	100 %	0 %	374315195
13039	NC_016633	GAT	2	6	842395	842400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315195
13040	NC_016633	ATC	2	6	842447	842452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315195
13041	NC_016633	GTA	2	6	842462	842467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315195
13042	NC_016633	GTGCA	2	10	842541	842550	20 %	20 %	40 %	20 %	374315195
13043	NC_016633	CAA	2	6	842837	842842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315196
13044	NC_016633	AG	3	6	842945	842950	50 %	0 %	50 %	0 %	374315196
13045	NC_016633	GTAC	2	8	842974	842981	25 %	25 %	25 %	25 %	374315196
13046	NC_016633	TTC	2	6	843136	843141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315196
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13049	NC_016633	ACCGGT	2	12	843213	843224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374315196
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13051	NC_016633	TCT	2	6	843301	843306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315196
13052	NC_016633	GAA	2	6	843346	843351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315196
13053	NC_016633	CTC	2	6	843363	843368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315196
13054	NC_016633	T	7	7	843419	843425	0 %	100 %	0 %	0 %	374315196
13055	NC_016633	AATGGT	2	12	843441	843452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315196
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13057	NC_016633	GAC	2	6	843654	843659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315196
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13059	NC_016633	GAT	2	6	843672	843677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315196
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13062	NC_016633	CAA	2	6	843731	843736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315196
13063	NC_016633	CAG	2	6	843922	843927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315196
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13065	NC_016633	AGC	2	6	844047	844052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315196
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13071	NC_016633	GAT	2	6	846009	846014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315197
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13102	NC_016633	ATGAA	2	10	848353	848362	60 %	20 %	20 %	0 %	374315199
13103	NC_016633	A	7	7	848433	848439	100 %	0 %	0 %	0 %	374315199
13104	NC_016633	A	6	6	848445	848450	100 %	0 %	0 %	0 %	374315199
13105	NC_016633	TGC	2	6	848480	848485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315199
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13107	NC_016633	G	7	7	848532	848538	0 %	0 %	100 %	0 %	374315199
13108	NC_016633	ATTG	2	8	848540	848547	25 %	50 %	25 %	0 %	374315199
13109	NC_016633	AC	3	6	848554	848559	50 %	0 %	0 %	50 %	374315199
13110	NC_016633	CAGT	2	8	848562	848569	25 %	25 %	25 %	25 %	374315199
13111	NC_016633	CAATG	2	10	848615	848624	40 %	20 %	20 %	20 %	374315199
13112	NC_016633	TC	3	6	848661	848666	0 %	50 %	0 %	50 %	374315199
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13115	NC_016633	GACCT	2	10	848833	848842	20 %	20 %	20 %	40 %	374315200
13116	NC_016633	C	6	6	849017	849022	0 %	0 %	0 %	100 %	374315200
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13119	NC_016633	TCC	2	6	849110	849115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315200
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13121	NC_016633	TTCA	2	8	849400	849407	25 %	50 %	0 %	25 %	374315201
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13483	NC_016633	TCT	2	6	872627	872632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315219
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