MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016633	AGTC	2	8	675613	675620	25 %	25 %	25 %	25 %	374315043
10502	NC_016633	GTT	2	6	675662	675667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315043
10503	NC_016633	AT	3	6	675711	675716	50 %	50 %	0 %	0 %	374315043
10504	NC_016633	GGC	2	6	675775	675780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315043
10505	NC_016633	TTTG	2	8	675833	675840	0 %	75 %	25 %	0 %	374315043
10506	NC_016633	AGA	2	6	676010	676015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315043
10507	NC_016633	GA	3	6	676139	676144	50 %	0 %	50 %	0 %	374315043
10508	NC_016633	AGGA	2	8	676163	676170	50 %	0 %	50 %	0 %	374315043
10509	NC_016633	ACGA	2	8	676171	676178	50 %	0 %	25 %	25 %	374315043
10510	NC_016633	CGAA	2	8	676238	676245	50 %	0 %	25 %	25 %	374315043
10511	NC_016633	C	6	6	676288	676293	0 %	0 %	0 %	100 %	374315043
10512	NC_016633	ACC	2	6	676407	676412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315043
10513	NC_016633	CGC	2	6	676530	676535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315043
10514	NC_016633	CAA	2	6	676576	676581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315043
10515	NC_016633	CCT	2	6	676728	676733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315044
10516	NC_016633	CCATG	2	10	676743	676752	20 %	20 %	20 %	40 %	374315044
10517	NC_016633	CAT	2	6	676759	676764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315044
10518	NC_016633	CTT	2	6	676770	676775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315044
10519	NC_016633	CGC	2	6	676923	676928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315044
10520	NC_016633	TCG	2	6	676937	676942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315044
10521	NC_016633	TCA	2	6	676944	676949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315044
10522	NC_016633	GCC	2	6	677065	677070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315044
10523	NC_016633	GT	3	6	677101	677106	0 %	50 %	50 %	0 %	374315044
10524	NC_016633	TAA	2	6	677217	677222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315044
10525	NC_016633	T	7	7	677319	677325	0 %	100 %	0 %	0 %	374315044
10526	NC_016633	ATG	2	6	677606	677611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315045
10527	NC_016633	ACA	2	6	677636	677641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315045
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10529	NC_016633	GCC	2	6	677753	677758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315045
10530	NC_016633	TG	3	6	677840	677845	0 %	50 %	50 %	0 %	374315045
10531	NC_016633	TGGC	2	8	677881	677888	0 %	25 %	50 %	25 %	374315045
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10534	NC_016633	TTGG	2	8	678352	678359	0 %	50 %	50 %	0 %	374315045
10535	NC_016633	TACCC	2	10	678383	678392	20 %	20 %	0 %	60 %	374315045
10536	NC_016633	GTA	2	6	678400	678405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315045
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10538	NC_016633	CAA	2	6	678556	678561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315045
10539	NC_016633	GAA	2	6	678717	678722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315045
10540	NC_016633	ACC	2	6	678778	678783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315045
10541	NC_016633	CACC	2	8	678795	678802	25 %	0 %	0 %	75 %	374315045
10542	NC_016633	ATG	2	6	678806	678811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315045
10543	NC_016633	CCT	2	6	678902	678907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315045
10544	NC_016633	ACC	2	6	678950	678955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315045
10545	NC_016633	TGA	2	6	679041	679046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315045
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10547	NC_016633	AAAGG	2	10	679132	679141	60 %	0 %	40 %	0 %	374315045
10548	NC_016633	GAA	2	6	679150	679155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315045
10549	NC_016633	A	6	6	679166	679171	100 %	0 %	0 %	0 %	374315045
10550	NC_016633	CAA	2	6	679218	679223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315045
10551	NC_016633	TGATT	2	10	679257	679266	20 %	60 %	20 %	0 %	374315045
10552	NC_016633	TTCCTG	2	12	679620	679631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374315046
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10554	NC_016633	GCT	2	6	679727	679732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315046
10555	NC_016633	GCA	2	6	679836	679841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315046
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10557	NC_016633	CGA	2	6	679941	679946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315046
10558	NC_016633	GCT	2	6	679957	679962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315046
10559	NC_016633	CATT	2	8	679974	679981	25 %	50 %	0 %	25 %	374315046
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10561	NC_016633	CCTC	2	8	680037	680044	0 %	25 %	0 %	75 %	374315046
10562	NC_016633	CTG	2	6	680072	680077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315046
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10591	NC_016633	TGA	2	6	681723	681728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315047
10592	NC_016633	GGCAAT	2	12	681759	681770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374315047
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10594	NC_016633	CGT	2	6	681853	681858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315047
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10600	NC_016633	ACAGT	2	10	682148	682157	40 %	20 %	20 %	20 %	374315047
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10604	NC_016633	TTCC	2	8	682283	682290	0 %	50 %	0 %	50 %	374315047
10605	NC_016633	T	6	6	682387	682392	0 %	100 %	0 %	0 %	374315047
10606	NC_016633	GAA	2	6	682403	682408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315047
10607	NC_016633	GGTC	2	8	682523	682530	0 %	25 %	50 %	25 %	374315047
10608	NC_016633	AGACG	2	10	682839	682848	40 %	0 %	40 %	20 %	374315047
10609	NC_016633	CAG	2	6	682993	682998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315047
10610	NC_016633	A	8	8	683023	683030	100 %	0 %	0 %	0 %	374315047
10611	NC_016633	GGT	2	6	683032	683037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315047
10612	NC_016633	CT	3	6	683084	683089	0 %	50 %	0 %	50 %	374315047
10613	NC_016633	GAC	2	6	683164	683169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315047
10614	NC_016633	TTGCAA	2	12	683192	683203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374315047
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10616	NC_016633	ATGA	2	8	683436	683443	50 %	25 %	25 %	0 %	374315048
10617	NC_016633	CA	3	6	683473	683478	50 %	0 %	0 %	50 %	374315048
10618	NC_016633	ACT	4	12	683493	683504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315048
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10623	NC_016633	GGC	2	6	683751	683756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315048
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10984	NC_016633	ATG	2	6	707120	707125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315067
10985	NC_016633	TGT	2	6	707136	707141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315067
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