MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016633	TCT	2	6	635705	635710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315012
10002	NC_016633	ATC	2	6	636045	636050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315012
10003	NC_016633	TAC	2	6	636134	636139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315013
10004	NC_016633	TAT	2	6	636199	636204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315013
10005	NC_016633	TA	3	6	636231	636236	50 %	50 %	0 %	0 %	374315013
10006	NC_016633	TAC	2	6	636317	636322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315013
10007	NC_016633	GCC	2	6	636365	636370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315013
10008	NC_016633	TAC	2	6	636433	636438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315013
10009	NC_016633	AAG	2	6	636452	636457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315013
10010	NC_016633	AG	3	6	636518	636523	50 %	0 %	50 %	0 %	374315013
10011	NC_016633	A	6	6	636534	636539	100 %	0 %	0 %	0 %	374315013
10012	NC_016633	TC	3	6	636646	636651	0 %	50 %	0 %	50 %	374315013
10013	NC_016633	TTACCC	2	12	636699	636710	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374315013
10014	NC_016633	TCT	2	6	636730	636735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315013
10015	NC_016633	A	6	6	636805	636810	100 %	0 %	0 %	0 %	374315013
10016	NC_016633	CGAA	2	8	636870	636877	50 %	0 %	25 %	25 %	374315013
10017	NC_016633	GAG	2	6	636878	636883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315013
10018	NC_016633	GCAG	2	8	636958	636965	25 %	0 %	50 %	25 %	374315013
10019	NC_016633	GAT	2	6	637084	637089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315013
10020	NC_016633	GGAA	2	8	637213	637220	50 %	0 %	50 %	0 %	374315013
10021	NC_016633	TTTC	2	8	637266	637273	0 %	75 %	0 %	25 %	374315013
10022	NC_016633	CCA	2	6	637287	637292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315013
10023	NC_016633	GA	3	6	637392	637397	50 %	0 %	50 %	0 %	374315013
10024	NC_016633	CTG	2	6	637509	637514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315013
10025	NC_016633	GCC	2	6	637520	637525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315013
10026	NC_016633	GAT	2	6	637640	637645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315013
10027	NC_016633	ATT	2	6	637655	637660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374315013
10028	NC_016633	TGC	2	6	637666	637671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315013
10029	NC_016633	ATA	2	6	637733	637738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315013
10030	NC_016633	GCT	2	6	638058	638063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315014
10031	NC_016633	AG	3	6	638116	638121	50 %	0 %	50 %	0 %	374315014
10032	NC_016633	CTTGAG	2	12	638128	638139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374315014
10033	NC_016633	CAG	2	6	638212	638217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315014
10034	NC_016633	CCCTG	2	10	638299	638308	0 %	20 %	20 %	60 %	374315014
10035	NC_016633	GGT	3	9	638392	638400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315014
10036	NC_016633	GGA	2	6	638441	638446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315014
10037	NC_016633	AGG	2	6	638454	638459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315014
10038	NC_016633	TA	3	6	638485	638490	50 %	50 %	0 %	0 %	374315014
10039	NC_016633	ATC	2	6	638512	638517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315014
10040	NC_016633	AAC	2	6	638525	638530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315014
10041	NC_016633	CCT	2	6	638559	638564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315014
10042	NC_016633	TCC	2	6	638603	638608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315014
10043	NC_016633	ACC	2	6	638633	638638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374315014
10044	NC_016633	A	6	6	638648	638653	100 %	0 %	0 %	0 %	374315014
10045	NC_016633	GAA	2	6	638687	638692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315014
10046	NC_016633	TTC	2	6	638740	638745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315014
10047	NC_016633	AGAA	2	8	638766	638773	75 %	0 %	25 %	0 %	374315014
10048	NC_016633	AGG	2	6	638799	638804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315014
10049	NC_016633	A	6	6	638813	638818	100 %	0 %	0 %	0 %	374315014
10050	NC_016633	CAG	2	6	638841	638846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315014
10051	NC_016633	TCCTGG	2	12	638949	638960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315015
10052	NC_016633	GGTAAT	2	12	638996	639007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315015
10053	NC_016633	CTG	2	6	639008	639013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315015
10054	NC_016633	GCC	2	6	639076	639081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315015
10055	NC_016633	GTA	2	6	639360	639365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315015
10056	NC_016633	TCA	2	6	639495	639500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315015
10057	NC_016633	AATAC	2	10	639504	639513	60 %	20 %	0 %	20 %	374315015
10058	NC_016633	TGCAT	2	10	639666	639675	20 %	40 %	20 %	20 %	374315015
10059	NC_016633	ACTTCC	2	12	639744	639755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374315015
10060	NC_016633	TTC	2	6	639857	639862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315015
10061	NC_016633	GAAG	2	8	639873	639880	50 %	0 %	50 %	0 %	374315015
10062	NC_016633	TCC	2	6	639900	639905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315015
10063	NC_016633	CTG	2	6	639956	639961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315015
10064	NC_016633	TCA	2	6	639973	639978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315015
10065	NC_016633	TGA	2	6	640048	640053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315015
10066	NC_016633	ATG	2	6	640122	640127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315015
10067	NC_016633	ATC	2	6	640157	640162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315015
10068	NC_016633	AGGC	2	8	640163	640170	25 %	0 %	50 %	25 %	374315015
10069	NC_016633	T	7	7	640286	640292	0 %	100 %	0 %	0 %	374315015
10070	NC_016633	AT	3	6	640299	640304	50 %	50 %	0 %	0 %	374315015
10071	NC_016633	GAT	2	6	640330	640335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315016
10072	NC_016633	TA	3	6	640347	640352	50 %	50 %	0 %	0 %	374315016
10073	NC_016633	CCG	2	6	640457	640462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315016
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10075	NC_016633	CAT	2	6	640549	640554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315016
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10077	NC_016633	CGG	2	6	640767	640772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374315016
10078	NC_016633	ACT	2	6	640843	640848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315016
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10080	NC_016633	CAGC	2	8	640891	640898	25 %	0 %	25 %	50 %	374315017
10081	NC_016633	T	6	6	640900	640905	0 %	100 %	0 %	0 %	374315017
10082	NC_016633	CCAA	2	8	641045	641052	50 %	0 %	0 %	50 %	374315017
10083	NC_016633	TATG	2	8	641064	641071	25 %	50 %	25 %	0 %	374315017
10084	NC_016633	TAC	2	6	641077	641082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315017
10085	NC_016633	CAGAA	2	10	641121	641130	60 %	0 %	20 %	20 %	374315017
10086	NC_016633	ATA	2	6	641192	641197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315017
10087	NC_016633	CAG	2	6	641342	641347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315017
10088	NC_016633	CAG	2	6	641354	641359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315017
10089	NC_016633	TCA	2	6	641382	641387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315017
10090	NC_016633	GGAA	2	8	641432	641439	50 %	0 %	50 %	0 %	374315017
10091	NC_016633	GAT	2	6	641440	641445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315017
10092	NC_016633	CAA	2	6	641657	641662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315017
10093	NC_016633	C	6	6	641883	641888	0 %	0 %	0 %	100 %	374315018
10094	NC_016633	G	6	6	641893	641898	0 %	0 %	100 %	0 %	374315018
10095	NC_016633	CCCG	2	8	641975	641982	0 %	0 %	25 %	75 %	374315018
10096	NC_016633	GGA	2	6	641997	642002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315018
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10099	NC_016633	CAG	2	6	642193	642198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315018
10100	NC_016633	GCCT	2	8	642291	642298	0 %	25 %	25 %	50 %	374315018
10101	NC_016633	CCCG	2	8	642429	642436	0 %	0 %	25 %	75 %	374315018
10102	NC_016633	CCAT	2	8	642451	642458	25 %	25 %	0 %	50 %	374315018
10103	NC_016633	A	7	7	642463	642469	100 %	0 %	0 %	0 %	374315018
10104	NC_016633	GAGGTT	2	12	642525	642536	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374315018
10105	NC_016633	GCAA	2	8	642625	642632	50 %	0 %	25 %	25 %	374315018
10106	NC_016633	AAC	2	6	642707	642712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315019
10107	NC_016633	CAGGAG	2	12	642716	642727	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374315019
10108	NC_016633	GAAC	2	8	642733	642740	50 %	0 %	25 %	25 %	374315019
10109	NC_016633	AT	3	6	642795	642800	50 %	50 %	0 %	0 %	374315019
10110	NC_016633	ATC	2	6	643092	643097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315019
10111	NC_016633	TCTG	2	8	643148	643155	0 %	50 %	25 %	25 %	374315019
10112	NC_016633	TGG	2	6	643270	643275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315019
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10116	NC_016633	AAT	2	6	643403	643408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374315019
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10118	NC_016633	ATC	2	6	643486	643491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315020
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10120	NC_016633	TGT	2	6	643516	643521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374315020
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10243	NC_016633	GCT	2	6	651672	651677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315028
10244	NC_016633	CCG	2	6	651811	651816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315028
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10347	NC_016633	TC	5	10	658819	658828	0 %	50 %	0 %	50 %	374315033
10348	NC_016633	C	6	6	658842	658847	0 %	0 %	0 %	100 %	374315034
10349	NC_016633	TGG	2	6	659046	659051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374315034
10350	NC_016633	TTC	2	6	659064	659069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315034
10351	NC_016633	C	6	6	659099	659104	0 %	0 %	0 %	100 %	374315034
10352	NC_016633	TCA	2	6	659121	659126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315034
10353	NC_016633	TCAA	2	8	659307	659314	50 %	25 %	0 %	25 %	374315034
10354	NC_016633	CTTT	2	8	659383	659390	0 %	75 %	0 %	25 %	374315034
10355	NC_016633	ACA	2	6	659401	659406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374315034
10356	NC_016633	TTC	2	6	659471	659476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315034
10357	NC_016633	TCC	2	6	659511	659516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315034
10358	NC_016633	AGCA	2	8	659522	659529	50 %	0 %	25 %	25 %	374315034
10359	NC_016633	TCT	2	6	659554	659559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374315034
10360	NC_016633	TCA	2	6	659595	659600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374315034
10361	NC_016633	TGC	2	6	659604	659609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374315034
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10363	NC_016633	GCC	2	6	659745	659750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374315034
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10486	NC_016633	GTAT	2	8	674562	674569	25 %	50 %	25 %	0 %	374315042
10487	NC_016633	ACG	2	6	674582	674587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315042
10488	NC_016633	AGG	2	6	674595	674600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374315042
10489	NC_016633	GTTA	2	8	674632	674639	25 %	50 %	25 %	0 %	374315042
10490	NC_016633	CCT	2	6	674673	674678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374315042
10491	NC_016633	AGAA	3	12	674743	674754	75 %	0 %	25 %	0 %	374315042
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10495	NC_016633	AAG	2	6	674888	674893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374315042
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10498	NC_016633	T	6	6	675177	675182	0 %	100 %	0 %	0 %	374315043
10499	NC_016633	ATG	2	6	675269	675274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374315043
10500	NC_016633	CAG	2	6	675605	675610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374315043

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