MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016633	CCAT	2	8	417894	417901	25 %	25 %	0 %	50 %	374314826
6502	NC_016633	AAG	2	6	417943	417948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314826
6503	NC_016633	AAT	2	6	418114	418119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314826
6504	NC_016633	AGG	2	6	418141	418146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314826
6505	NC_016633	GT	3	6	418167	418172	0 %	50 %	50 %	0 %	374314826
6506	NC_016633	GCA	2	6	418173	418178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314826
6507	NC_016633	CAGG	2	8	418182	418189	25 %	0 %	50 %	25 %	374314826
6508	NC_016633	ATA	2	6	418191	418196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314826
6509	NC_016633	CGC	2	6	418294	418299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314826
6510	NC_016633	CCTC	2	8	418347	418354	0 %	25 %	0 %	75 %	374314826
6511	NC_016633	CAC	2	6	418369	418374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314826
6512	NC_016633	GAT	2	6	418459	418464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314826
6513	NC_016633	A	6	6	418627	418632	100 %	0 %	0 %	0 %	374314826
6514	NC_016633	TTC	2	6	418646	418651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314826
6515	NC_016633	T	6	6	418687	418692	0 %	100 %	0 %	0 %	374314826
6516	NC_016633	ATC	2	6	418839	418844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314826
6517	NC_016633	CAA	2	6	418930	418935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314826
6518	NC_016633	T	6	6	418943	418948	0 %	100 %	0 %	0 %	374314826
6519	NC_016633	CAG	2	6	418963	418968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314826
6520	NC_016633	CTTT	2	8	419002	419009	0 %	75 %	0 %	25 %	374314826
6521	NC_016633	T	6	6	419051	419056	0 %	100 %	0 %	0 %	374314827
6522	NC_016633	CTTT	2	8	419066	419073	0 %	75 %	0 %	25 %	374314827
6523	NC_016633	A	6	6	419381	419386	100 %	0 %	0 %	0 %	374314828
6524	NC_016633	TCTT	2	8	419396	419403	0 %	75 %	0 %	25 %	374314828
6525	NC_016633	TCT	2	6	419423	419428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314828
6526	NC_016633	ATTC	2	8	419541	419548	25 %	50 %	0 %	25 %	374314828
6527	NC_016633	AGA	2	6	419655	419660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314828
6528	NC_016633	A	8	8	419681	419688	100 %	0 %	0 %	0 %	374314828
6529	NC_016633	TTGC	2	8	419692	419699	0 %	50 %	25 %	25 %	374314828
6530	NC_016633	GAG	2	6	419743	419748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314828
6531	NC_016633	TTC	2	6	419759	419764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314828
6532	NC_016633	T	8	8	419770	419777	0 %	100 %	0 %	0 %	374314828
6533	NC_016633	CAT	2	6	419897	419902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314828
6534	NC_016633	ATA	2	6	419905	419910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314828
6535	NC_016633	T	6	6	419931	419936	0 %	100 %	0 %	0 %	374314828
6536	NC_016633	CTT	2	6	419939	419944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314828
6537	NC_016633	AT	3	6	419994	419999	50 %	50 %	0 %	0 %	374314828
6538	NC_016633	TTC	2	6	420024	420029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314828
6539	NC_016633	CAC	2	6	420077	420082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314828
6540	NC_016633	GCAA	2	8	420099	420106	50 %	0 %	25 %	25 %	374314828
6541	NC_016633	CT	3	6	420108	420113	0 %	50 %	0 %	50 %	374314828
6542	NC_016633	TTTCCC	2	12	420150	420161	0 %	50 %	0 %	50 %	374314828
6543	NC_016633	ATC	2	6	420659	420664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314829
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6545	NC_016633	AAG	2	6	420726	420731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314829
6546	NC_016633	A	6	6	420754	420759	100 %	0 %	0 %	0 %	374314829
6547	NC_016633	ACC	2	6	420762	420767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314829
6548	NC_016633	A	6	6	420823	420828	100 %	0 %	0 %	0 %	374314829
6549	NC_016633	TGC	2	6	420840	420845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314829
6550	NC_016633	TTA	2	6	420874	420879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314829
6551	NC_016633	CCT	2	6	420929	420934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314829
6552	NC_016633	TAC	2	6	421024	421029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314829
6553	NC_016633	ATC	2	6	421047	421052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314829
6554	NC_016633	TG	3	6	421197	421202	0 %	50 %	50 %	0 %	374314829
6555	NC_016633	ATCG	2	8	421258	421265	25 %	25 %	25 %	25 %	374314829
6556	NC_016633	GAC	2	6	421304	421309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314829
6557	NC_016633	A	6	6	421320	421325	100 %	0 %	0 %	0 %	374314829
6558	NC_016633	CAAG	2	8	421389	421396	50 %	0 %	25 %	25 %	374314829
6559	NC_016633	GTAT	2	8	421404	421411	25 %	50 %	25 %	0 %	374314829
6560	NC_016633	CTG	2	6	421417	421422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314829
6561	NC_016633	CAGGG	2	10	421458	421467	20 %	0 %	60 %	20 %	374314829
6562	NC_016633	AAT	2	6	421475	421480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314829
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6571	NC_016633	ATG	2	6	422075	422080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314830
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6619	NC_016633	ATCA	2	8	424465	424472	50 %	25 %	0 %	25 %	374314832
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6622	NC_016633	AT	3	6	424583	424588	50 %	50 %	0 %	0 %	374314832
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