MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_016633	CATG	2	8	3588709	3588716	25 %	25 %	25 %	25 %	374317608
55502	NC_016633	TG	3	6	3588720	3588725	0 %	50 %	50 %	0 %	374317608
55503	NC_016633	AAG	2	6	3588812	3588817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317608
55504	NC_016633	C	6	6	3588844	3588849	0 %	0 %	0 %	100 %	374317608
55505	NC_016633	TCA	2	6	3589044	3589049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317608
55506	NC_016633	A	6	6	3589151	3589156	100 %	0 %	0 %	0 %	374317608
55507	NC_016633	AAAG	2	8	3589172	3589179	75 %	0 %	25 %	0 %	374317608
55508	NC_016633	CAAG	2	8	3589376	3589383	50 %	0 %	25 %	25 %	374317609
55509	NC_016633	ATC	2	6	3589393	3589398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317609
55510	NC_016633	GCC	2	6	3589449	3589454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374317609
55511	NC_016633	TCC	2	6	3589488	3589493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317609
55512	NC_016633	TAA	2	6	3589712	3589717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317609
55513	NC_016633	GCT	2	6	3589750	3589755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317609
55514	NC_016633	GCTG	2	8	3589785	3589792	0 %	25 %	50 %	25 %	374317609
55515	NC_016633	GCA	2	6	3589936	3589941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317609
55516	NC_016633	CTT	2	6	3589991	3589996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317609
55517	NC_016633	CTT	2	6	3590002	3590007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317609
55518	NC_016633	ATA	2	6	3590074	3590079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317609
55519	NC_016633	CAA	2	6	3590208	3590213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374317609
55520	NC_016633	GAA	2	6	3590238	3590243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317609
55521	NC_016633	GTT	2	6	3590248	3590253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374317609
55522	NC_016633	TCC	2	6	3590268	3590273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317609
55523	NC_016633	AGC	2	6	3590275	3590280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317609
55524	NC_016633	GAC	2	6	3590295	3590300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317609
55525	NC_016633	ATGG	2	8	3590496	3590503	25 %	25 %	50 %	0 %	374317609
55526	NC_016633	CTG	2	6	3590564	3590569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317609
55527	NC_016633	CTT	2	6	3590582	3590587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317609
55528	NC_016633	AAT	2	6	3590702	3590707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317609

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.