MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_016633	TCT	2	6	3520114	3520119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317551
54502	NC_016633	TTA	2	6	3520169	3520174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317551
54503	NC_016633	ATT	2	6	3520248	3520253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317551
54504	NC_016633	TAC	2	6	3523871	3523876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317552
54505	NC_016633	AGA	2	6	3523938	3523943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317552
54506	NC_016633	TGG	2	6	3523980	3523985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317552
54507	NC_016633	GGCA	2	8	3524093	3524100	25 %	0 %	50 %	25 %	374317552
54508	NC_016633	GAG	2	6	3524186	3524191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317552
54509	NC_016633	GAG	2	6	3524281	3524286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317552
54510	NC_016633	CAA	2	6	3524302	3524307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374317552
54511	NC_016633	CGC	2	6	3524347	3524352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374317552
54512	NC_016633	TGG	2	6	3524394	3524399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317552
54513	NC_016633	CAG	2	6	3524428	3524433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317552
54514	NC_016633	CTG	2	6	3524456	3524461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317552
54515	NC_016633	GAAG	2	8	3524530	3524537	50 %	0 %	50 %	0 %	374317552
54516	NC_016633	GCC	2	6	3524568	3524573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374317552
54517	NC_016633	TGTAT	3	15	3524674	3524688	20 %	60 %	20 %	0 %	374317552
54518	NC_016633	CAT	2	6	3524742	3524747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317552
54519	NC_016633	AGA	2	6	3524749	3524754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317552
54520	NC_016633	TTCC	2	8	3524755	3524762	0 %	50 %	0 %	50 %	374317552
54521	NC_016633	TCA	2	6	3524783	3524788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317552
54522	NC_016633	GTG	2	6	3525125	3525130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317553
54523	NC_016633	GCT	3	9	3525232	3525240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317553
54524	NC_016633	CTTG	2	8	3525461	3525468	0 %	50 %	25 %	25 %	374317554
54525	NC_016633	CT	3	6	3525509	3525514	0 %	50 %	0 %	50 %	374317554
54526	NC_016633	CTT	2	6	3525517	3525522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317554
54527	NC_016633	AAG	2	6	3525577	3525582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317554
54528	NC_016633	GA	3	6	3525585	3525590	50 %	0 %	50 %	0 %	374317554
54529	NC_016633	AG	3	6	3525641	3525646	50 %	0 %	50 %	0 %	374317554
54530	NC_016633	CAG	2	6	3525691	3525696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317554
54531	NC_016633	CTT	2	6	3525700	3525705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317554
54532	NC_016633	TTTC	2	8	3525840	3525847	0 %	75 %	0 %	25 %	374317554
54533	NC_016633	GAG	2	6	3525859	3525864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317554
54534	NC_016633	ATC	2	6	3525889	3525894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317554
54535	NC_016633	ATT	2	6	3525898	3525903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317554
54536	NC_016633	A	6	6	3526002	3526007	100 %	0 %	0 %	0 %	374317554
54537	NC_016633	TCG	2	6	3526028	3526033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317554
54538	NC_016633	TGA	2	6	3526048	3526053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317554
54539	NC_016633	TC	3	6	3526118	3526123	0 %	50 %	0 %	50 %	374317554
54540	NC_016633	TCC	2	6	3526147	3526152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317554
54541	NC_016633	GGA	2	6	3526188	3526193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317554
54542	NC_016633	CTGGCA	2	12	3526200	3526211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374317554
54543	NC_016633	CGA	2	6	3526247	3526252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317554
54544	NC_016633	GAA	2	6	3526356	3526361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317554
54545	NC_016633	TA	3	6	3526374	3526379	50 %	50 %	0 %	0 %	374317554
54546	NC_016633	CCA	2	6	3526391	3526396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317554
54547	NC_016633	TGC	2	6	3526426	3526431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317554
54548	NC_016633	GTC	2	6	3526542	3526547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317554
54549	NC_016633	TAT	2	6	3526703	3526708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374317554
54550	NC_016633	TAA	2	6	3526757	3526762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374317554
54551	NC_016633	AAATC	2	10	3526869	3526878	60 %	20 %	0 %	20 %	374317555
54552	NC_016633	CT	3	6	3526925	3526930	0 %	50 %	0 %	50 %	374317555
54553	NC_016633	AGC	2	6	3527083	3527088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317555
54554	NC_016633	CT	3	6	3527117	3527122	0 %	50 %	0 %	50 %	374317555
54555	NC_016633	AG	3	6	3527239	3527244	50 %	0 %	50 %	0 %	374317555
54556	NC_016633	GGAA	2	8	3527245	3527252	50 %	0 %	50 %	0 %	374317555
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54559	NC_016633	TAGT	2	8	3527310	3527317	25 %	50 %	25 %	0 %	374317555
54560	NC_016633	GAA	2	6	3527336	3527341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317555
54561	NC_016633	GAA	2	6	3527372	3527377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317555
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54565	NC_016633	GTA	2	6	3527917	3527922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317556
54566	NC_016633	GAA	2	6	3528027	3528032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317556
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54577	NC_016633	TGC	2	6	3528827	3528832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317557
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54583	NC_016633	GATA	2	8	3528988	3528995	50 %	25 %	25 %	0 %	374317557
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54586	NC_016633	ATTG	2	8	3529070	3529077	25 %	50 %	25 %	0 %	374317557
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54600	NC_016633	A	6	6	3530600	3530605	100 %	0 %	0 %	0 %	374317559
54601	NC_016633	GAA	2	6	3530689	3530694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317559
54602	NC_016633	CTA	2	6	3530739	3530744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317559
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54604	NC_016633	ATCC	2	8	3530890	3530897	25 %	25 %	0 %	50 %	374317559
54605	NC_016633	CG	3	6	3530918	3530923	0 %	0 %	50 %	50 %	374317559
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54607	NC_016633	GAAA	2	8	3531039	3531046	75 %	0 %	25 %	0 %	374317559
54608	NC_016633	CGA	2	6	3531075	3531080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317559
54609	NC_016633	TGGG	2	8	3531116	3531123	0 %	25 %	75 %	0 %	374317559
54610	NC_016633	TTC	2	6	3531166	3531171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317559
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54612	NC_016633	TGC	2	6	3531330	3531335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317559
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54615	NC_016633	CTTTG	2	10	3532197	3532206	0 %	60 %	20 %	20 %	374317560
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