MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_016633	GCA	2	6	3428442	3428447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317478
53002	NC_016633	CGA	2	6	3428593	3428598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317478
53003	NC_016633	TTCCC	2	10	3428629	3428638	0 %	40 %	0 %	60 %	374317478
53004	NC_016633	ATC	2	6	3428669	3428674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317478
53005	NC_016633	GGCAAA	2	12	3428699	3428710	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374317478
53006	NC_016633	CCTT	2	8	3428720	3428727	0 %	50 %	0 %	50 %	374317478
53007	NC_016633	CAA	2	6	3428783	3428788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374317478
53008	NC_016633	GAT	2	6	3428800	3428805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317478
53009	NC_016633	GAA	2	6	3428864	3428869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317478
53010	NC_016633	AAG	2	6	3428906	3428911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374317478
53011	NC_016633	TTC	2	6	3428923	3428928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317478
53012	NC_016633	ACC	2	6	3428957	3428962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317478
53013	NC_016633	CATG	2	8	3428971	3428978	25 %	25 %	25 %	25 %	374317478
53014	NC_016633	TCC	2	6	3428983	3428988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374317478
53015	NC_016633	GAAAA	2	10	3429026	3429035	80 %	0 %	20 %	0 %	374317478
53016	NC_016633	ATG	2	6	3429162	3429167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317478
53017	NC_016633	AAAG	2	8	3429202	3429209	75 %	0 %	25 %	0 %	374317478
53018	NC_016633	AAGGG	2	10	3429210	3429219	40 %	0 %	60 %	0 %	374317478
53019	NC_016633	TTC	2	6	3429270	3429275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317478
53020	NC_016633	CTT	2	6	3429308	3429313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374317478
53021	NC_016633	ACC	2	6	3429323	3429328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317478
53022	NC_016633	GCTG	2	8	3429336	3429343	0 %	25 %	50 %	25 %	374317478
53023	NC_016633	GGC	2	6	3429383	3429388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317478
53024	NC_016633	CGGG	2	8	3429465	3429472	0 %	0 %	75 %	25 %	374317478
53025	NC_016633	ATCC	2	8	3429496	3429503	25 %	25 %	0 %	50 %	374317478
53026	NC_016633	ACAG	2	8	3429617	3429624	50 %	0 %	25 %	25 %	374317478
53027	NC_016633	CCTT	2	8	3429643	3429650	0 %	50 %	0 %	50 %	374317478
53028	NC_016633	TGCC	2	8	3429682	3429689	0 %	25 %	25 %	50 %	374317478
53029	NC_016633	CCAT	2	8	3429690	3429697	25 %	25 %	0 %	50 %	374317478
53030	NC_016633	CCCTTA	2	12	3429750	3429761	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374317478
53031	NC_016633	ACC	2	6	3429807	3429812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374317478
53032	NC_016633	A	6	6	3429872	3429877	100 %	0 %	0 %	0 %	374317478
53033	NC_016633	GAG	2	6	3429899	3429904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317478
53034	NC_016633	TC	3	6	3429979	3429984	0 %	50 %	0 %	50 %	374317478
53035	NC_016633	TGC	2	6	3429985	3429990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317478
53036	NC_016633	TTTCC	2	10	3429994	3430003	0 %	60 %	0 %	40 %	374317478
53037	NC_016633	GAG	2	6	3430037	3430042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374317478
53038	NC_016633	GGC	2	6	3430049	3430054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374317478
53039	NC_016633	GTA	2	6	3430055	3430060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317478
53040	NC_016633	AG	3	6	3430102	3430107	50 %	0 %	50 %	0 %	374317478
53041	NC_016633	TCA	2	6	3430119	3430124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317478
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53044	NC_016633	GTG	2	6	3430340	3430345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374317478
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53049	NC_016633	TGC	2	6	3430961	3430966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317478
53050	NC_016633	TGA	2	6	3430969	3430974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317478
53051	NC_016633	GACGAT	2	12	3430979	3430990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374317478
53052	NC_016633	GAT	2	6	3431000	3431005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374317478
53053	NC_016633	GAC	2	6	3431006	3431011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374317478
53054	NC_016633	TCA	2	6	3431076	3431081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374317478
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53112	NC_016633	TGC	2	6	3434888	3434893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374317481
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53224	NC_016633	TATGC	2	10	3441207	3441216	20 %	40 %	20 %	20 %	374317486
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