MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces cattleya NRRL 8057 plasmid pSCAT

Total Repeats: 50388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016113	CAG	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407372
2	NC_016113	ACA	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357407372
3	NC_016113	GCC	2	6	288	293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407372
4	NC_016113	ACG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407372
5	NC_016113	CCG	2	6	308	313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407372
6	NC_016113	CGG	2	6	319	324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407372
7	NC_016113	CAA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357407372
8	NC_016113	CAC	2	6	344	349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
9	NC_016113	GCAAC	2	10	422	431	40 %	0 %	20 %	40 %	357407372
10	NC_016113	ACC	2	6	463	468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
11	NC_016113	ACC	2	6	492	497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
12	NC_016113	CAA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357407372
13	NC_016113	CCAAC	2	10	505	514	40 %	0 %	0 %	60 %	357407372
14	NC_016113	AC	4	8	513	520	50 %	0 %	0 %	50 %	357407372
15	NC_016113	CAGC	2	8	528	535	25 %	0 %	25 %	50 %	357407372
16	NC_016113	CAC	2	6	540	545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
17	NC_016113	CAC	2	6	552	557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
18	NC_016113	C	6	6	561	566	0 %	0 %	0 %	100 %	357407372
19	NC_016113	CAC	2	6	579	584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
20	NC_016113	CCA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407372
21	NC_016113	AGG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357407373
22	NC_016113	AGGCCG	2	12	806	817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357407373
23	NC_016113	CGA	2	6	831	836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407373
24	NC_016113	GGA	2	6	858	863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357407373
25	NC_016113	GCC	2	6	922	927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407373
26	NC_016113	T	6	6	934	939	0 %	100 %	0 %	0 %	357407373
27	NC_016113	ACC	2	6	985	990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407374
28	NC_016113	CG	3	6	1058	1063	0 %	0 %	50 %	50 %	357407374
29	NC_016113	CCGC	2	8	1081	1088	0 %	0 %	25 %	75 %	357407374
30	NC_016113	TGA	2	6	1097	1102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357407374
31	NC_016113	GGA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357407374
32	NC_016113	CCG	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407374
33	NC_016113	CG	3	6	1173	1178	0 %	0 %	50 %	50 %	357407374
34	NC_016113	CGT	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357407374
35	NC_016113	CAC	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407374
36	NC_016113	CCGCG	2	10	1294	1303	0 %	0 %	40 %	60 %	357407374
37	NC_016113	CCG	2	6	1305	1310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407374
38	NC_016113	CGG	2	6	1323	1328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407374
39	NC_016113	CCG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407374
40	NC_016113	GACCT	2	10	1365	1374	20 %	20 %	20 %	40 %	357407374
41	NC_016113	CCG	2	6	1430	1435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407374
42	NC_016113	GCC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407374
43	NC_016113	GGC	2	6	1507	1512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407374
44	NC_016113	AAG	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357407374
45	NC_016113	TCAT	2	8	1537	1544	25 %	50 %	0 %	25 %	357407374
46	NC_016113	CGA	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407374
47	NC_016113	ACTCC	2	10	1775	1784	20 %	20 %	0 %	60 %	357407374
48	NC_016113	CGA	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407374
49	NC_016113	CTT	2	6	2069	2074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357407375
50	NC_016113	GCAG	2	8	2086	2093	25 %	0 %	50 %	25 %	357407375
51	NC_016113	GAG	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357407375
52	NC_016113	GCA	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407375
53	NC_016113	GGC	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
54	NC_016113	CGG	2	6	2191	2196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
55	NC_016113	CGA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407375
56	NC_016113	GCG	2	6	2205	2210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
57	NC_016113	GCC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407375
58	NC_016113	AGG	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357407375
59	NC_016113	TGG	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357407375
60	NC_016113	GGT	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357407375
61	NC_016113	AGC	4	12	2388	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407375
62	NC_016113	GCG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
63	NC_016113	CAGG	2	8	2459	2466	25 %	0 %	50 %	25 %	357407375
64	NC_016113	CGA	3	9	2467	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407375
65	NC_016113	GGC	2	6	2483	2488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
66	NC_016113	TGA	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357407375
67	NC_016113	GTGGCG	2	12	2586	2597	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	357407375
68	NC_016113	CCG	2	6	2613	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407375
69	NC_016113	GCA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407375
70	NC_016113	ACC	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407375
71	NC_016113	CGC	2	6	2743	2748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407375
72	NC_016113	CCGCG	2	10	2765	2774	0 %	0 %	40 %	60 %	357407375
73	NC_016113	CAG	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407375
74	NC_016113	GCG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
75	NC_016113	GGCC	2	8	2861	2868	0 %	0 %	50 %	50 %	357407375
76	NC_016113	GCG	2	6	2884	2889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407375
77	NC_016113	GGGTGG	2	12	2890	2901	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	357407375
78	NC_016113	TGTCC	2	10	2905	2914	0 %	40 %	20 %	40 %	357407375
79	NC_016113	G	7	7	2917	2923	0 %	0 %	100 %	0 %	357407376
80	NC_016113	GGTCAG	2	12	2929	2940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357407376
81	NC_016113	CGT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357407376
82	NC_016113	CGC	2	6	2991	2996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407376
83	NC_016113	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407376
84	NC_016113	GCGGG	2	10	3042	3051	0 %	0 %	80 %	20 %	357407376
85	NC_016113	GCA	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407376
86	NC_016113	GCC	2	6	3107	3112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407376
87	NC_016113	CCG	2	6	3138	3143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407376
88	NC_016113	CAG	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407376
89	NC_016113	CCA	2	6	3300	3305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407376
90	NC_016113	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357407376
91	NC_016113	TCG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357407376
92	NC_016113	CAG	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407376
93	NC_016113	GAC	2	6	3391	3396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407376
94	NC_016113	GGCC	2	8	3399	3406	0 %	0 %	50 %	50 %	357407376
95	NC_016113	CGG	2	6	3419	3424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407376
96	NC_016113	GCC	2	6	3430	3435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407376
97	NC_016113	CCA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407376
98	NC_016113	GCC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407376
99	NC_016113	CAG	3	9	3547	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407376
100	NC_016113	CG	4	8	3561	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	357407376
101	NC_016113	GCGG	2	8	3630	3637	0 %	0 %	75 %	25 %	357407376
102	NC_016113	GTG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357407376
103	NC_016113	ACC	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407376
104	NC_016113	GCCG	2	8	3757	3764	0 %	0 %	50 %	50 %	357407376
105	NC_016113	CCG	2	6	3800	3805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407376
106	NC_016113	GGCC	2	8	3840	3847	0 %	0 %	50 %	50 %	357407376
107	NC_016113	GCA	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407377
108	NC_016113	GCC	2	6	3956	3961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407377
109	NC_016113	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407377
110	NC_016113	CCT	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357407377
111	NC_016113	TGT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357407377
112	NC_016113	CAG	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407377
113	NC_016113	CGGG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	75 %	25 %	357407377
114	NC_016113	CG	3	6	4279	4284	0 %	0 %	50 %	50 %	357407377
115	NC_016113	TGGGCG	2	12	4325	4336	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	357407377
116	NC_016113	GCG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407377
117	NC_016113	TCG	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357407377
118	NC_016113	CG	3	6	4390	4395	0 %	0 %	50 %	50 %	357407377
119	NC_016113	GC	3	6	4427	4432	0 %	0 %	50 %	50 %	357407377
120	NC_016113	CGG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407378
121	NC_016113	CGTTCT	2	12	4716	4727	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	357407378
122	NC_016113	CGG	2	6	4823	4828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407379
123	NC_016113	GTCCG	2	10	4857	4866	0 %	20 %	40 %	40 %	357407379
124	NC_016113	CAGGGC	2	12	4875	4886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357407379
125	NC_016113	CGG	2	6	4897	4902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407379
126	NC_016113	GGCG	2	8	4916	4923	0 %	0 %	75 %	25 %	357407379
127	NC_016113	CCG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407379
128	NC_016113	GCCA	2	8	4993	5000	25 %	0 %	25 %	50 %	357407379
129	NC_016113	CCGGC	2	10	5020	5029	0 %	0 %	40 %	60 %	357407379
130	NC_016113	GCA	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407379
131	NC_016113	GGC	2	6	5070	5075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407379
132	NC_016113	CAGG	2	8	5178	5185	25 %	0 %	50 %	25 %	357407379
133	NC_016113	CGA	3	9	5240	5248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407379
134	NC_016113	GCCC	2	8	5265	5272	0 %	0 %	25 %	75 %	357407379
135	NC_016113	GTGCG	2	10	5285	5294	0 %	20 %	60 %	20 %	357407379
136	NC_016113	CGT	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357407379
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138	NC_016113	GGC	2	6	5355	5360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407379
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254	NC_016113	CCA	2	6	9066	9071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407382
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256	NC_016113	TCAC	2	8	9179	9186	25 %	25 %	0 %	50 %	357407382
257	NC_016113	CGGCAG	2	12	9205	9216	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357407382
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259	NC_016113	GCC	2	6	9399	9404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357407382
260	NC_016113	CACC	2	8	9424	9431	25 %	0 %	0 %	75 %	357407382
261	NC_016113	CGG	2	6	9451	9456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357407382
262	NC_016113	CAG	2	6	9457	9462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407382
263	NC_016113	CAC	2	6	9556	9561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357407382
264	NC_016113	CAG	2	6	9619	9624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357407382
265	NC_016113	C	6	6	9689	9694	0 %	0 %	0 %	100 %	357407382
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