MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 plasmid pSLPG

Total Repeats: 3208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015974	GCC	2	6	88	93	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430513
2	NC_015974	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430513
3	NC_015974	TCG	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430513
4	NC_015974	TGA	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430513
5	NC_015974	CCGC	2	8	237	244	0 %	0 %	25 %	75 %	347430513
6	NC_015974	CGC	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430513
7	NC_015974	CGA	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430513
8	NC_015974	AAG	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347430513
9	NC_015974	TCG	3	9	391	399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430513
10	NC_015974	CG	3	6	398	403	0 %	0 %	50 %	50 %	347430513
11	NC_015974	AAG	2	6	404	409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347430513
12	NC_015974	TGCG	2	8	620	627	0 %	25 %	50 %	25 %	347430513
13	NC_015974	TCGG	2	8	830	837	0 %	25 %	50 %	25 %	347430513
14	NC_015974	GGCGC	2	10	855	864	0 %	0 %	60 %	40 %	347430513
15	NC_015974	CA	3	6	900	905	50 %	0 %	0 %	50 %	347430513
16	NC_015974	GGC	2	6	906	911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430513
17	NC_015974	GGC	2	6	915	920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430513
18	NC_015974	GGC	2	6	1021	1026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430513
19	NC_015974	CG	3	6	1060	1065	0 %	0 %	50 %	50 %	347430513
20	NC_015974	ACG	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430513
21	NC_015974	CT	3	6	1355	1360	0 %	50 %	0 %	50 %	347430514
22	NC_015974	CTG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430514
23	NC_015974	CG	3	6	1458	1463	0 %	0 %	50 %	50 %	347430514
24	NC_015974	GCG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430514
25	NC_015974	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430514
26	NC_015974	GCC	3	9	1575	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430514
27	NC_015974	AAT	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347430514
28	NC_015974	CTG	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430514
29	NC_015974	CGACCT	2	12	1842	1853	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347430514
30	NC_015974	GAG	2	6	1858	1863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430514
31	NC_015974	ACG	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430514
32	NC_015974	GC	3	6	1996	2001	0 %	0 %	50 %	50 %	347430514
33	NC_015974	TGG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347430514
34	NC_015974	TGC	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430514
35	NC_015974	GC	3	6	2127	2132	0 %	0 %	50 %	50 %	347430514
36	NC_015974	TGG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347430514
37	NC_015974	CCG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430514
38	NC_015974	TCG	2	6	2179	2184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430514
39	NC_015974	CGG	2	6	2186	2191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430514
40	NC_015974	CTG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430514
41	NC_015974	CGC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430514
42	NC_015974	TGA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430514
43	NC_015974	TGCCT	2	10	2461	2470	0 %	40 %	20 %	40 %	347430514
44	NC_015974	AGG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430514
45	NC_015974	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430515
46	NC_015974	AAG	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347430515
47	NC_015974	GCG	2	6	2679	2684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430515
48	NC_015974	CGT	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430515
49	NC_015974	CG	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
50	NC_015974	CTC	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347430515
51	NC_015974	GAG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430515
52	NC_015974	GCAA	2	8	2884	2891	50 %	0 %	25 %	25 %	347430515
53	NC_015974	CGC	2	6	2910	2915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430515
54	NC_015974	GCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430515
55	NC_015974	CG	3	6	2957	2962	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
56	NC_015974	GC	3	6	2987	2992	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
57	NC_015974	TCG	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430515
58	NC_015974	CGA	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430515
59	NC_015974	GC	3	6	3081	3086	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
60	NC_015974	GC	5	10	3107	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
61	NC_015974	GC	4	8	3125	3132	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
62	NC_015974	TAT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347430515
63	NC_015974	CGG	2	6	3229	3234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430515
64	NC_015974	GGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430515
65	NC_015974	CT	3	6	3298	3303	0 %	50 %	0 %	50 %	347430515
66	NC_015974	GGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430515
67	NC_015974	CGG	2	6	3318	3323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430515
68	NC_015974	GT	3	6	3328	3333	0 %	50 %	50 %	0 %	347430515
69	NC_015974	GCA	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430515
70	NC_015974	CG	3	6	3405	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	347430515
71	NC_015974	GCC	2	6	3420	3425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430515
72	NC_015974	C	6	6	3429	3434	0 %	0 %	0 %	100 %	347430515
73	NC_015974	AAG	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347430515
74	NC_015974	G	6	6	3489	3494	0 %	0 %	100 %	0 %	347430515
75	NC_015974	GGT	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347430515
76	NC_015974	GCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430515
77	NC_015974	ATC	2	6	3727	3732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347430516
78	NC_015974	CGT	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430516
79	NC_015974	GGA	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430516
80	NC_015974	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347430516
81	NC_015974	CGATAT	2	12	3981	3992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347430516
82	NC_015974	TCT	3	9	4094	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347430517
83	NC_015974	CGG	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430517
84	NC_015974	AGGGC	2	10	4306	4315	20 %	0 %	60 %	20 %	347430517
85	NC_015974	GGTG	2	8	4523	4530	0 %	25 %	75 %	0 %	347430517
86	NC_015974	TCC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347430517
87	NC_015974	TCG	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430517
88	NC_015974	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430517
89	NC_015974	CGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430517
90	NC_015974	CATC	2	8	4760	4767	25 %	25 %	0 %	50 %	347430517
91	NC_015974	AT	3	6	4785	4790	50 %	50 %	0 %	0 %	347430518
92	NC_015974	CAC	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347430518
93	NC_015974	GCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430518
94	NC_015974	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430518
95	NC_015974	CCGCG	2	10	4984	4993	0 %	0 %	40 %	60 %	347430518
96	NC_015974	AGC	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
97	NC_015974	CGC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430519
98	NC_015974	TTC	2	6	5390	5395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347430519
99	NC_015974	GAC	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
100	NC_015974	CAG	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
101	NC_015974	CCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430519
102	NC_015974	GC	3	6	5441	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
103	NC_015974	TGATC	2	10	5506	5515	20 %	40 %	20 %	20 %	347430519
104	NC_015974	CG	3	6	5565	5570	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
105	NC_015974	CG	3	6	5609	5614	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
106	NC_015974	CCG	2	6	5615	5620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430519
107	NC_015974	CGCTG	2	10	5653	5662	0 %	20 %	40 %	40 %	347430519
108	NC_015974	GCC	2	6	5673	5678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430519
109	NC_015974	CAG	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
110	NC_015974	GGC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430519
111	NC_015974	CG	3	6	5846	5851	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
112	NC_015974	AACG	2	8	5859	5866	50 %	0 %	25 %	25 %	347430519
113	NC_015974	CG	3	6	5876	5881	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
114	NC_015974	GCG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430519
115	NC_015974	GC	3	6	5907	5912	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
116	NC_015974	AGC	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
117	NC_015974	G	6	6	5950	5955	0 %	0 %	100 %	0 %	347430519
118	NC_015974	TCC	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347430519
119	NC_015974	AGCG	2	8	6055	6062	25 %	0 %	50 %	25 %	347430519
120	NC_015974	AGC	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
121	NC_015974	GCA	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430519
122	NC_015974	GAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430519
123	NC_015974	GCCG	2	8	6334	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
124	NC_015974	GC	3	6	6349	6354	0 %	0 %	50 %	50 %	347430519
125	NC_015974	CTC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347430519
126	NC_015974	CGG	2	6	6400	6405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430519
127	NC_015974	CGT	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430520
128	NC_015974	GCC	2	6	6618	6623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430520
129	NC_015974	GCCG	2	8	6636	6643	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
130	NC_015974	GCCG	2	8	6651	6658	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
131	NC_015974	GC	3	6	6684	6689	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
132	NC_015974	CGC	2	6	6723	6728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430520
133	NC_015974	GTG	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347430520
134	NC_015974	CAA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347430520
135	NC_015974	CG	3	6	6861	6866	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
136	NC_015974	GCCG	2	8	6881	6888	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
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140	NC_015974	GCT	2	6	7146	7151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430520
141	NC_015974	GC	3	6	7176	7181	0 %	0 %	50 %	50 %	347430520
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171	NC_015974	ATCG	2	8	9174	9181	25 %	25 %	25 %	25 %	347430522
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255	NC_015974	TGA	2	6	13098	13103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430524
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257	NC_015974	AGC	2	6	13154	13159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430524
258	NC_015974	GAC	2	6	13237	13242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430524
259	NC_015974	GGA	2	6	13252	13257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430524
260	NC_015974	GC	3	6	13294	13299	0 %	0 %	50 %	50 %	347430524
261	NC_015974	GGC	2	6	13318	13323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430524
262	NC_015974	GTCCC	2	10	13339	13348	0 %	20 %	20 %	60 %	347430524
263	NC_015974	CGCC	2	8	13356	13363	0 %	0 %	25 %	75 %	347430524
264	NC_015974	GGT	2	6	13392	13397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347430524
265	NC_015974	CGA	3	9	13401	13409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430524
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391	NC_015974	CGACCA	2	12	19291	19302	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347430533
392	NC_015974	CAG	2	6	19322	19327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430533
393	NC_015974	CCA	2	6	19339	19344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347430533
394	NC_015974	GCGT	2	8	19430	19437	0 %	25 %	50 %	25 %	347430533
395	NC_015974	GGC	2	6	19463	19468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430533
396	NC_015974	GC	3	6	19477	19482	0 %	0 %	50 %	50 %	347430533
397	NC_015974	CGA	2	6	19516	19521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430533
398	NC_015974	GCC	4	12	19553	19564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430533
399	NC_015974	AGG	2	6	19602	19607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430533
400	NC_015974	GAG	2	6	19610	19615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347430533
401	NC_015974	CGC	2	6	19649	19654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430534
402	NC_015974	GCC	2	6	19719	19724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430534
403	NC_015974	CGA	2	6	19744	19749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430534
404	NC_015974	GCG	2	6	19800	19805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430534
405	NC_015974	CGA	2	6	19807	19812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430534
406	NC_015974	GCG	2	6	19857	19862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430534
407	NC_015974	CCG	2	6	19918	19923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430534
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409	NC_015974	GGC	2	6	20051	20056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430534
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411	NC_015974	CGA	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430535
412	NC_015974	GGCG	2	8	20093	20100	0 %	0 %	75 %	25 %	347430535
413	NC_015974	TGA	2	6	20123	20128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430535
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420	NC_015974	CGA	2	6	20390	20395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430535
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422	NC_015974	CAT	2	6	20499	20504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347430535
423	NC_015974	CGC	2	6	20524	20529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430536
424	NC_015974	GCA	2	6	20569	20574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430536
425	NC_015974	GTA	2	6	20594	20599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430536
426	NC_015974	CG	4	8	20610	20617	0 %	0 %	50 %	50 %	347430536
427	NC_015974	CCA	2	6	20626	20631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347430536
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432	NC_015974	TCC	2	6	20802	20807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347430536
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435	NC_015974	CGG	2	6	21098	21103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347430537
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461	NC_015974	ATG	2	6	22311	22316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347430537
462	NC_015974	GCCGG	2	10	22360	22369	0 %	0 %	60 %	40 %	347430537
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489	NC_015974	AGC	3	9	23642	23650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347430539
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492	NC_015974	TCG	2	6	23703	23708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347430539
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498	NC_015974	TTGC	2	8	23933	23940	0 %	50 %	25 %	25 %	347430539
499	NC_015974	CTTTC	2	10	23973	23982	0 %	60 %	0 %	40 %	347430539
500	NC_015974	CGC	2	6	23991	23996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347430539

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