MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 261423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015957	TGC	2	6	624183	624188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008508
15002	NC_015957	CCG	2	6	624192	624197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008508
15003	NC_015957	GGC	2	6	624211	624216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008508
15004	NC_015957	GTG	3	9	624256	624264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008508
15005	NC_015957	TCG	2	6	624279	624284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008508
15006	NC_015957	GTG	2	6	624290	624295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008508
15007	NC_015957	TTC	2	6	624296	624301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008508
15008	NC_015957	CCG	2	6	624303	624308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008508
15009	NC_015957	CCG	2	6	624329	624334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008508
15010	NC_015957	ATC	2	6	624362	624367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008508
15011	NC_015957	ACC	2	6	624455	624460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008508
15012	NC_015957	CGG	2	6	624472	624477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008508
15013	NC_015957	GGCT	2	8	624506	624513	0 %	25 %	50 %	25 %	345008508
15014	NC_015957	GCT	2	6	624520	624525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008508
15015	NC_015957	TCG	2	6	624546	624551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008508
15016	NC_015957	CGT	2	6	624658	624663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008508
15017	NC_015957	GGT	2	6	624667	624672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008508
15018	NC_015957	GCC	2	6	624786	624791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15019	NC_015957	GAG	2	6	624820	624825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008509
15020	NC_015957	C	6	6	624903	624908	0 %	0 %	0 %	100 %	345008509
15021	NC_015957	GCC	2	6	624910	624915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15022	NC_015957	CGG	2	6	624918	624923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008509
15023	NC_015957	GT	3	6	625003	625008	0 %	50 %	50 %	0 %	345008509
15024	NC_015957	GGA	3	9	625050	625058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008509
15025	NC_015957	CGC	2	6	625118	625123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15026	NC_015957	CG	3	6	625136	625141	0 %	0 %	50 %	50 %	345008509
15027	NC_015957	GAG	2	6	625144	625149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008509
15028	NC_015957	GCC	2	6	625165	625170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15029	NC_015957	GCC	2	6	625177	625182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15030	NC_015957	CGC	3	9	625191	625199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15031	NC_015957	GGCCGC	2	12	625203	625214	0 %	0 %	50 %	50 %	345008509
15032	NC_015957	GCC	2	6	625372	625377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008509
15033	NC_015957	GCC	2	6	625401	625406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008510
15034	NC_015957	CTG	2	6	625452	625457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008510
15035	NC_015957	CAC	2	6	625496	625501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008510
15036	NC_015957	CGC	2	6	625517	625522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008510
15037	NC_015957	TGG	3	9	625531	625539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008510
15038	NC_015957	CGG	2	6	625544	625549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008510
15039	NC_015957	CCT	2	6	625565	625570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008510
15040	NC_015957	CGG	2	6	625576	625581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008510
15041	NC_015957	CGT	3	9	625622	625630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008510
15042	NC_015957	CCT	3	9	625631	625639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008510
15043	NC_015957	GTGGCC	2	12	625719	625730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345008510
15044	NC_015957	GTGG	2	8	625748	625755	0 %	25 %	75 %	0 %	345008510
15045	NC_015957	ACC	2	6	625773	625778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008510
15046	NC_015957	CCG	2	6	625813	625818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008510
15047	NC_015957	TGC	2	6	625849	625854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008510
15048	NC_015957	CTC	3	9	625875	625883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008510
15049	NC_015957	TCG	2	6	625891	625896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008510
15050	NC_015957	CCG	2	6	625921	625926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008510
15051	NC_015957	CCG	2	6	625980	625985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008511
15052	NC_015957	TCC	2	6	625995	626000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008511
15053	NC_015957	TCT	2	6	626001	626006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008511
15054	NC_015957	CGCC	2	8	626029	626036	0 %	0 %	25 %	75 %	345008511
15055	NC_015957	CTGATG	2	12	626048	626059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345008511
15056	NC_015957	TCAACC	2	12	626085	626096	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345008511
15057	NC_015957	TCG	2	6	626097	626102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008511
15058	NC_015957	CCATCG	2	12	626160	626171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345008511
15059	NC_015957	CCG	3	9	626172	626180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008511
15060	NC_015957	ATCGGC	2	12	626183	626194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345008511
15061	NC_015957	TCC	2	6	626205	626210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008511
15062	NC_015957	CCG	2	6	626232	626237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008511
15063	NC_015957	C	6	6	626266	626271	0 %	0 %	0 %	100 %	345008511
15064	NC_015957	GAC	2	6	626294	626299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008511
15065	NC_015957	CGC	2	6	626323	626328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008511
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15067	NC_015957	GAC	2	6	626364	626369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008511
15068	NC_015957	CCG	3	9	626375	626383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
15069	NC_015957	CTG	2	6	626395	626400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008512
15070	NC_015957	CTG	2	6	626428	626433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008512
15071	NC_015957	GCC	2	6	626435	626440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
15072	NC_015957	TGC	2	6	626471	626476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15074	NC_015957	TCG	2	6	626507	626512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008512
15075	NC_015957	GCGG	2	8	626533	626540	0 %	0 %	75 %	25 %	345008512
15076	NC_015957	CCG	2	6	626558	626563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
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15079	NC_015957	CGT	2	6	626652	626657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15082	NC_015957	GAC	2	6	626698	626703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15086	NC_015957	CGA	2	6	626772	626777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15089	NC_015957	TGG	2	6	626831	626836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008512
15090	NC_015957	ACT	2	6	626840	626845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008512
15091	NC_015957	CG	3	6	626859	626864	0 %	0 %	50 %	50 %	345008512
15092	NC_015957	CCG	2	6	626996	627001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
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15100	NC_015957	GCC	2	6	627226	627231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
15101	NC_015957	GGC	2	6	627234	627239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008512
15102	NC_015957	TCGGC	2	10	627251	627260	0 %	20 %	40 %	40 %	345008512
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15105	NC_015957	GC	3	6	627338	627343	0 %	0 %	50 %	50 %	345008512
15106	NC_015957	CGA	2	6	627351	627356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15111	NC_015957	CGC	2	6	627438	627443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
15112	NC_015957	GCA	2	6	627446	627451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15118	NC_015957	CGC	2	6	627603	627608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
15119	NC_015957	CTC	2	6	627655	627660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008512
15120	NC_015957	CTC	2	6	627679	627684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008512
15121	NC_015957	CCG	2	6	627686	627691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008512
15122	NC_015957	GCT	2	6	627711	627716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008512
15123	NC_015957	AGC	2	6	627758	627763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008512
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15133	NC_015957	GGC	2	6	628044	628049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008512
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15139	NC_015957	CGCGG	2	10	628237	628246	0 %	0 %	60 %	40 %	345008512
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15142	NC_015957	GC	3	6	628316	628321	0 %	0 %	50 %	50 %	345008512
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15150	NC_015957	GCC	2	6	628561	628566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008513
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15153	NC_015957	GCT	2	6	628692	628697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008513
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15155	NC_015957	CCG	2	6	628736	628741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008513
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15227	NC_015957	TATC	2	8	630774	630781	25 %	50 %	0 %	25 %	345008514
15228	NC_015957	GTC	2	6	630783	630788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008514
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15231	NC_015957	GCCGTC	2	12	630867	630878	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345008514
15232	NC_015957	GCC	2	6	630882	630887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008514
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15234	NC_015957	GC	3	6	630935	630940	0 %	0 %	50 %	50 %	345008514
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15236	NC_015957	CTG	2	6	630993	630998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008514
15237	NC_015957	CGC	2	6	631007	631012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008514
15238	NC_015957	GCC	2	6	631116	631121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008514
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15241	NC_015957	GCC	3	9	631188	631196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008514
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15243	NC_015957	CCT	2	6	631214	631219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008514
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15256	NC_015957	CGG	2	6	631486	631491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008514
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15268	NC_015957	CG	3	6	632078	632083	0 %	0 %	50 %	50 %	345008515
15269	NC_015957	CCGA	2	8	632112	632119	25 %	0 %	25 %	50 %	345008515
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15344	NC_015957	GGC	2	6	636600	636605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008520
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15349	NC_015957	GAC	2	6	636804	636809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008520
15350	NC_015957	GC	4	8	636827	636834	0 %	0 %	50 %	50 %	345008520
15351	NC_015957	GCA	2	6	636861	636866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008520
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15353	NC_015957	GAT	2	6	636996	637001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008520
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15474	NC_015957	GGC	2	6	641760	641765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008525
15475	NC_015957	GGT	2	6	641769	641774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008525
15476	NC_015957	GGT	2	6	641793	641798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008525
15477	NC_015957	CTG	2	6	641857	641862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008525
15478	NC_015957	TGGCGG	2	12	641870	641881	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345008525
15479	NC_015957	GGCG	2	8	641943	641950	0 %	0 %	75 %	25 %	345008526
15480	NC_015957	CGGCGA	2	12	641994	642005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345008526
15481	NC_015957	TCA	2	6	642012	642017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008526
15482	NC_015957	CCT	2	6	642051	642056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008526
15483	NC_015957	TCA	2	6	642099	642104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008526
15484	NC_015957	CGGC	2	8	642126	642133	0 %	0 %	50 %	50 %	345008526
15485	NC_015957	GGC	2	6	642187	642192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008526
15486	NC_015957	TCAC	2	8	642248	642255	25 %	25 %	0 %	50 %	345008526
15487	NC_015957	GTG	2	6	642263	642268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008526
15488	NC_015957	CGG	2	6	642345	642350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008526
15489	NC_015957	CCT	2	6	642354	642359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008526
15490	NC_015957	GGT	2	6	642379	642384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008526
15491	NC_015957	GCG	2	6	642395	642400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008526
15492	NC_015957	GCT	2	6	642402	642407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008526
15493	NC_015957	GGC	3	9	642438	642446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008526
15494	NC_015957	GGT	2	6	642490	642495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008526
15495	NC_015957	CAG	2	6	642505	642510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008526
15496	NC_015957	GCC	2	6	642533	642538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008526
15497	NC_015957	CCG	2	6	642571	642576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008526
15498	NC_015957	GCC	2	6	642590	642595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008526
15499	NC_015957	CCGGG	2	10	642598	642607	0 %	0 %	60 %	40 %	345008526
15500	NC_015957	CCG	2	6	642618	642623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008526

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