MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 261423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015957	GGC	2	6	520828	520833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008413
12502	NC_015957	TGC	3	9	520840	520848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12503	NC_015957	CGG	2	6	520856	520861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008413
12504	NC_015957	GCC	2	6	520869	520874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008413
12505	NC_015957	CGGG	2	8	520892	520899	0 %	0 %	75 %	25 %	345008413
12506	NC_015957	CGTCC	2	10	520944	520953	0 %	20 %	20 %	60 %	345008413
12507	NC_015957	GCC	2	6	521014	521019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008413
12508	NC_015957	GC	3	6	521128	521133	0 %	0 %	50 %	50 %	345008413
12509	NC_015957	TGA	2	6	521171	521176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008413
12510	NC_015957	TCG	2	6	521179	521184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12511	NC_015957	AGC	2	6	521245	521250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12512	NC_015957	CGG	2	6	521285	521290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008413
12513	NC_015957	GGC	2	6	521322	521327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008413
12514	NC_015957	GGC	2	6	521394	521399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008413
12515	NC_015957	TGG	2	6	521417	521422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008413
12516	NC_015957	CAG	2	6	521430	521435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12517	NC_015957	GCA	2	6	521450	521455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12518	NC_015957	AGC	2	6	521482	521487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12519	NC_015957	CCG	2	6	521585	521590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008413
12520	NC_015957	CAC	2	6	521622	521627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008413
12521	NC_015957	GAC	2	6	521637	521642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008413
12522	NC_015957	CCT	2	6	521820	521825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008414
12523	NC_015957	GGC	2	6	521827	521832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008414
12524	NC_015957	AGC	2	6	521849	521854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008414
12525	NC_015957	TCT	2	6	521871	521876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008414
12526	NC_015957	CGT	2	6	521895	521900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008414
12527	NC_015957	TGA	2	6	521910	521915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008414
12528	NC_015957	CAC	2	6	521935	521940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008414
12529	NC_015957	TCG	2	6	521957	521962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008414
12530	NC_015957	CTT	2	6	521968	521973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008414
12531	NC_015957	TCG	2	6	521999	522004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008414
12532	NC_015957	GGTC	2	8	522033	522040	0 %	25 %	50 %	25 %	345008414
12533	NC_015957	GGC	2	6	522052	522057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008414
12534	NC_015957	CTG	2	6	522067	522072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008414
12535	NC_015957	GGC	2	6	522073	522078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008414
12536	NC_015957	GC	3	6	522089	522094	0 %	0 %	50 %	50 %	345008414
12537	NC_015957	GAGCC	2	10	522104	522113	20 %	0 %	40 %	40 %	345008414
12538	NC_015957	AGCG	2	8	522149	522156	25 %	0 %	50 %	25 %	345008414
12539	NC_015957	CTT	2	6	522232	522237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008414
12540	NC_015957	GTG	2	6	522284	522289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008414
12541	NC_015957	CA	3	6	522290	522295	50 %	0 %	0 %	50 %	345008414
12542	NC_015957	GGTG	2	8	522328	522335	0 %	25 %	75 %	0 %	345008414
12543	NC_015957	GGA	2	6	522400	522405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008414
12544	NC_015957	CGA	2	6	522414	522419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008414
12545	NC_015957	CTT	2	6	522693	522698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008415
12546	NC_015957	GTCG	2	8	522699	522706	0 %	25 %	50 %	25 %	345008415
12547	NC_015957	TGG	2	6	522725	522730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008415
12548	NC_015957	CGT	2	6	522815	522820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
12549	NC_015957	GTC	2	6	522828	522833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
12550	NC_015957	CCG	2	6	522883	522888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
12551	NC_015957	C	6	6	522898	522903	0 %	0 %	0 %	100 %	345008415
12552	NC_015957	GCC	2	6	522963	522968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
12553	NC_015957	TCG	2	6	522988	522993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
12554	NC_015957	GGA	2	6	523014	523019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008415
12555	NC_015957	GCT	2	6	523020	523025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008415
12556	NC_015957	CGC	2	6	523028	523033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
12557	NC_015957	CGC	2	6	523037	523042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008415
12558	NC_015957	GGA	2	6	523059	523064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008415
12559	NC_015957	CGG	2	6	523100	523105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008415
12560	NC_015957	CTT	2	6	523113	523118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008415
12561	NC_015957	GAC	2	6	523170	523175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008415
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12573	NC_015957	CGG	2	6	523469	523474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008415
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12577	NC_015957	GGCG	2	8	523896	523903	0 %	0 %	75 %	25 %	345008416
12578	NC_015957	CGG	2	6	523913	523918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
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12586	NC_015957	GAC	2	6	524101	524106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008416
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12588	NC_015957	GGC	2	6	524376	524381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008416
12589	NC_015957	TCT	2	6	524396	524401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008416
12590	NC_015957	CG	3	6	524428	524433	0 %	0 %	50 %	50 %	345008416
12591	NC_015957	ATG	2	6	524437	524442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008416
12592	NC_015957	GTG	2	6	524458	524463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008416
12593	NC_015957	GCCC	2	8	524482	524489	0 %	0 %	25 %	75 %	345008416
12594	NC_015957	CCA	2	6	524514	524519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008416
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12596	NC_015957	ATC	2	6	524608	524613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008416
12597	NC_015957	CGT	2	6	524666	524671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
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12600	NC_015957	CGT	2	6	524790	524795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
12601	NC_015957	CAG	2	6	524842	524847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008416
12602	NC_015957	TCG	2	6	524855	524860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008416
12603	NC_015957	GGT	2	6	524862	524867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008416
12604	NC_015957	CGG	2	6	525121	525126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008417
12605	NC_015957	GGC	2	6	525141	525146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008417
12606	NC_015957	GCCGAA	2	12	525198	525209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
12607	NC_015957	TGG	2	6	525317	525322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
12608	NC_015957	GTC	2	6	525339	525344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
12609	NC_015957	GTG	2	6	525349	525354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008417
12610	NC_015957	GCA	2	6	525362	525367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
12611	NC_015957	GCA	2	6	525389	525394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
12612	NC_015957	CCA	2	6	525401	525406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008417
12613	NC_015957	GGTCGG	2	12	525419	525430	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345008417
12614	NC_015957	GCT	2	6	525437	525442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008417
12615	NC_015957	GCA	2	6	525461	525466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008417
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12736	NC_015957	GC	3	6	529808	529813	0 %	0 %	50 %	50 %	345008421
12737	NC_015957	CGCAGC	2	12	529827	529838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345008421
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12972	NC_015957	GC	3	6	542277	542282	0 %	0 %	50 %	50 %	345008435
12973	NC_015957	GGT	2	6	542356	542361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008435
12974	NC_015957	GAT	2	6	542365	542370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008435
12975	NC_015957	GGC	2	6	542371	542376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
12976	NC_015957	CGC	2	6	542395	542400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008435
12977	NC_015957	GC	3	6	542399	542404	0 %	0 %	50 %	50 %	345008435
12978	NC_015957	GCG	3	9	542467	542475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008435
12979	NC_015957	TCG	2	6	542550	542555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008435
12980	NC_015957	GC	3	6	542602	542607	0 %	0 %	50 %	50 %	345008435
12981	NC_015957	GCG	2	6	542965	542970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008436
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12985	NC_015957	GCC	2	6	543126	543131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008436
12986	NC_015957	TCT	2	6	543143	543148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008436
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