MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 188705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015953	CGA	2	6	824	829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997653
2	NC_015953	CTGAT	2	10	919	928	20 %	40 %	20 %	20 %	344997653
3	NC_015953	CGC	2	6	1043	1048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997653
4	NC_015953	CTG	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997653
5	NC_015953	CTG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997653
6	NC_015953	CGG	2	6	1126	1131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997653
7	NC_015953	GCG	2	6	1217	1222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997653
8	NC_015953	GTG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997653
9	NC_015953	GGA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997653
10	NC_015953	GCT	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997653
11	NC_015953	CGT	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
12	NC_015953	GGA	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997654
13	NC_015953	CGG	2	6	1407	1412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997654
14	NC_015953	CGTA	2	8	1457	1464	25 %	25 %	25 %	25 %	344997654
15	NC_015953	GCG	2	6	1544	1549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997654
16	NC_015953	TGC	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
17	NC_015953	CG	3	6	1639	1644	0 %	0 %	50 %	50 %	344997654
18	NC_015953	TGC	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
19	NC_015953	GCGG	2	8	1750	1757	0 %	0 %	75 %	25 %	344997654
20	NC_015953	G	6	6	1793	1798	0 %	0 %	100 %	0 %	344997654
21	NC_015953	GGC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997654
22	NC_015953	CAG	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997654
23	NC_015953	CGG	2	6	1976	1981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997654
24	NC_015953	TGG	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997654
25	NC_015953	GGCG	2	8	2071	2078	0 %	0 %	75 %	25 %	344997654
26	NC_015953	GTCC	2	8	2096	2103	0 %	25 %	25 %	50 %	344997654
27	NC_015953	GGA	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997654
28	NC_015953	CTG	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
29	NC_015953	CTG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
30	NC_015953	GTC	2	6	2270	2275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
31	NC_015953	GTT	2	6	2314	2319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344997654
32	NC_015953	GC	3	6	2336	2341	0 %	0 %	50 %	50 %	344997654
33	NC_015953	GTT	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344997654
34	NC_015953	GTC	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
35	NC_015953	TGG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997654
36	NC_015953	GAA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997654
37	NC_015953	GCG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997654
38	NC_015953	GCTG	2	8	2551	2558	0 %	25 %	50 %	25 %	344997654
39	NC_015953	GCT	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
40	NC_015953	CG	3	6	2728	2733	0 %	0 %	50 %	50 %	344997654
41	NC_015953	GAG	2	6	2741	2746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997654
42	NC_015953	TCA	2	6	2770	2775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997654
43	NC_015953	CGG	3	9	2807	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997654
44	NC_015953	CCG	2	6	2885	2890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997654
45	NC_015953	GTC	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
46	NC_015953	TCG	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
47	NC_015953	GCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997654
48	NC_015953	AGC	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997654
49	NC_015953	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
50	NC_015953	GGA	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997654
51	NC_015953	AGC	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997654
52	NC_015953	TCG	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997654
53	NC_015953	TGG	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997655
54	NC_015953	AGC	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
55	NC_015953	GGC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
56	NC_015953	GCA	3	9	3458	3466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
57	NC_015953	GGC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
58	NC_015953	CCA	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997655
59	NC_015953	GAG	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
60	NC_015953	AAC	2	6	3640	3645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344997655
61	NC_015953	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
62	NC_015953	GGT	2	6	3695	3700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997655
63	NC_015953	CTG	2	6	3714	3719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
64	NC_015953	GCC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
65	NC_015953	GCT	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
66	NC_015953	GCT	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
67	NC_015953	GCGG	2	8	3857	3864	0 %	0 %	75 %	25 %	344997655
68	NC_015953	GA	3	6	3868	3873	50 %	0 %	50 %	0 %	344997655
69	NC_015953	CA	3	6	3884	3889	50 %	0 %	0 %	50 %	344997655
70	NC_015953	GCG	2	6	3893	3898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
71	NC_015953	GAG	2	6	3915	3920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
72	NC_015953	CGG	3	9	3971	3979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
73	NC_015953	GCA	3	9	4004	4012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
74	NC_015953	CTG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
75	NC_015953	AAG	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997655
76	NC_015953	GCG	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
77	NC_015953	GTC	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
78	NC_015953	CTGG	2	8	4202	4209	0 %	25 %	50 %	25 %	344997655
79	NC_015953	GAG	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
80	NC_015953	ATC	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997655
81	NC_015953	GCT	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
82	NC_015953	GGC	2	6	4304	4309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
83	NC_015953	GGA	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
84	NC_015953	CGG	3	9	4373	4381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
85	NC_015953	TGG	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997655
86	NC_015953	TGA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997655
87	NC_015953	C	6	6	4540	4545	0 %	0 %	0 %	100 %	344997655
88	NC_015953	GGC	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
89	NC_015953	GCA	2	6	4619	4624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
90	NC_015953	GCA	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
91	NC_015953	CAC	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997655
92	NC_015953	CTA	2	6	4775	4780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997655
93	NC_015953	CAG	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
94	NC_015953	GC	3	6	4802	4807	0 %	0 %	50 %	50 %	344997655
95	NC_015953	CTT	2	6	4832	4837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344997655
96	NC_015953	GCC	2	6	4851	4856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
97	NC_015953	AGC	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
98	NC_015953	GGA	3	9	4874	4882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
99	NC_015953	ACCG	2	8	4887	4894	25 %	0 %	25 %	50 %	344997655
100	NC_015953	AGC	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
101	NC_015953	GCC	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
102	NC_015953	TCA	2	6	4993	4998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997655
103	NC_015953	CCG	2	6	5006	5011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
104	NC_015953	GGA	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
105	NC_015953	ACC	3	9	5086	5094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997655
106	NC_015953	TCG	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
107	NC_015953	GCC	2	6	5117	5122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
108	NC_015953	CCA	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997655
109	NC_015953	CAG	2	6	5155	5160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
110	NC_015953	GCG	2	6	5176	5181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
111	NC_015953	GCA	2	6	5228	5233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
112	NC_015953	GCG	2	6	5234	5239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
113	NC_015953	CGCC	2	8	5240	5247	0 %	0 %	25 %	75 %	344997655
114	NC_015953	GAG	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
115	NC_015953	GGA	2	6	5326	5331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
116	NC_015953	GGA	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
117	NC_015953	GGC	2	6	5359	5364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997655
118	NC_015953	AGG	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
119	NC_015953	GCC	2	6	5423	5428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
120	NC_015953	GC	3	6	5446	5451	0 %	0 %	50 %	50 %	344997655
121	NC_015953	CGTGGC	2	12	5461	5472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344997655
122	NC_015953	GGA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
123	NC_015953	GCA	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
124	NC_015953	GCTC	2	8	5518	5525	0 %	25 %	25 %	50 %	344997655
125	NC_015953	CCGG	2	8	5543	5550	0 %	0 %	50 %	50 %	344997655
126	NC_015953	CGA	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
127	NC_015953	ACCGA	2	10	5637	5646	40 %	0 %	20 %	40 %	344997655
128	NC_015953	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997655
129	NC_015953	CTC	2	6	5697	5702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997655
130	NC_015953	CGA	3	9	5726	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
131	NC_015953	TCT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344997655
132	NC_015953	ACG	2	6	5761	5766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
133	NC_015953	GGA	2	6	5778	5783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997655
134	NC_015953	CCG	2	6	5794	5799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997655
135	NC_015953	GAC	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
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137	NC_015953	CGA	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997655
138	NC_015953	CTGG	2	8	6007	6014	0 %	25 %	50 %	25 %	344997655
139	NC_015953	GGCT	2	8	6058	6065	0 %	25 %	50 %	25 %	344997655
140	NC_015953	TCG	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997656
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142	NC_015953	CTGG	2	8	6471	6478	0 %	25 %	50 %	25 %	344997656
143	NC_015953	GCC	2	6	6483	6488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997656
144	NC_015953	GACC	2	8	6507	6514	25 %	0 %	25 %	50 %	344997656
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155	NC_015953	CG	3	6	7197	7202	0 %	0 %	50 %	50 %	344997656
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164	NC_015953	GTG	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997656
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250	NC_015953	CGGTG	2	10	10519	10528	0 %	20 %	60 %	20 %	344997657
251	NC_015953	CGA	2	6	10537	10542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997657
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253	NC_015953	GCCA	2	8	10644	10651	25 %	0 %	25 %	50 %	344997657
254	NC_015953	GTT	2	6	10670	10675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344997657
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258	NC_015953	CAT	2	6	10739	10744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997657
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260	NC_015953	CGG	2	6	10843	10848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997657
261	NC_015953	GT	3	6	10905	10910	0 %	50 %	50 %	0 %	344997657
262	NC_015953	CCGC	2	8	10942	10949	0 %	0 %	25 %	75 %	344997657
263	NC_015953	CGGG	2	8	10974	10981	0 %	0 %	75 %	25 %	344997657
264	NC_015953	CGG	2	6	11002	11007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997657
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380	NC_015953	CCG	2	6	17039	17044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997662
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383	NC_015953	GGCGA	2	10	17098	17107	20 %	0 %	60 %	20 %	344997662
384	NC_015953	GCA	2	6	17115	17120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997662
385	NC_015953	CGA	2	6	17124	17129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997662
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387	NC_015953	GGCA	2	8	17209	17216	25 %	0 %	50 %	25 %	344997662
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500	NC_015953	CGCT	2	8	23722	23729	0 %	25 %	25 %	50 %	344997668

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