MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 188705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
132501	NC_015953	GTC	2	6	5240160	5240165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002242
132502	NC_015953	GTG	2	6	5240167	5240172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002242
132503	NC_015953	GGA	2	6	5240217	5240222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002242
132504	NC_015953	CGA	2	6	5240258	5240263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002242
132505	NC_015953	CGC	2	6	5240271	5240276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002242
132506	NC_015953	CAT	2	6	5240289	5240294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002242
132507	NC_015953	GAC	2	6	5240647	5240652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132508	NC_015953	CG	3	6	5240658	5240663	0 %	0 %	50 %	50 %	345002243
132509	NC_015953	TCA	2	6	5240664	5240669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002243
132510	NC_015953	GCC	2	6	5240699	5240704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002243
132511	NC_015953	GCA	2	6	5240772	5240777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132512	NC_015953	CGT	2	6	5240842	5240847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132513	NC_015953	GCC	2	6	5240861	5240866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002243
132514	NC_015953	GCT	3	9	5240875	5240883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132515	NC_015953	TCG	4	12	5240958	5240969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132516	NC_015953	CGA	2	6	5241034	5241039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132517	NC_015953	CCA	2	6	5241046	5241051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002243
132518	NC_015953	CGT	2	6	5241067	5241072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132519	NC_015953	ACC	2	6	5241074	5241079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002243
132520	NC_015953	GCC	2	6	5241101	5241106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002243
132521	NC_015953	CGG	2	6	5241121	5241126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002243
132522	NC_015953	GTC	2	6	5241143	5241148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132523	NC_015953	GTTCC	2	10	5241193	5241202	0 %	40 %	20 %	40 %	345002243
132524	NC_015953	CCGA	2	8	5241209	5241216	25 %	0 %	25 %	50 %	345002243
132525	NC_015953	GTC	2	6	5241221	5241226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132526	NC_015953	AAC	2	6	5241267	5241272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002243
132527	NC_015953	CGG	2	6	5241327	5241332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002243
132528	NC_015953	GC	3	6	5241349	5241354	0 %	0 %	50 %	50 %	345002243
132529	NC_015953	GCCG	2	8	5241356	5241363	0 %	0 %	50 %	50 %	345002243
132530	NC_015953	CGA	2	6	5241373	5241378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132531	NC_015953	GGT	2	6	5241385	5241390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002243
132532	NC_015953	CGA	2	6	5241397	5241402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132533	NC_015953	AC	3	6	5241418	5241423	50 %	0 %	0 %	50 %	345002243
132534	NC_015953	CCG	2	6	5241428	5241433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002243
132535	NC_015953	ACC	2	6	5241437	5241442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002243
132536	NC_015953	CG	3	6	5241454	5241459	0 %	0 %	50 %	50 %	345002243
132537	NC_015953	GGC	3	9	5241472	5241480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002243
132538	NC_015953	CTG	2	6	5241485	5241490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132539	NC_015953	CGCC	2	8	5241493	5241500	0 %	0 %	25 %	75 %	345002243
132540	NC_015953	CGG	2	6	5241502	5241507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002243
132541	NC_015953	CCCCA	2	10	5241513	5241522	20 %	0 %	0 %	80 %	345002243
132542	NC_015953	TGC	2	6	5241534	5241539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002243
132543	NC_015953	GGT	2	6	5241809	5241814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002244
132544	NC_015953	CGC	2	6	5241821	5241826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002244
132545	NC_015953	CAA	2	6	5241854	5241859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002244
132546	NC_015953	GCG	2	6	5241865	5241870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002244
132547	NC_015953	CGGA	2	8	5241904	5241911	25 %	0 %	50 %	25 %	345002244
132548	NC_015953	AAC	2	6	5241921	5241926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002244
132549	NC_015953	TGA	2	6	5241997	5242002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002244
132550	NC_015953	TGGC	2	8	5242038	5242045	0 %	25 %	50 %	25 %	345002244
132551	NC_015953	GGA	2	6	5242061	5242066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002244
132552	NC_015953	CGA	2	6	5242094	5242099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002244
132553	NC_015953	CCG	3	9	5242132	5242140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002244
132554	NC_015953	AAG	2	6	5242167	5242172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345002244
132555	NC_015953	CAACGG	2	12	5242184	5242195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002244
132556	NC_015953	ACG	2	6	5242204	5242209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002244
132557	NC_015953	AAG	2	6	5242227	5242232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345002244
132558	NC_015953	GTC	2	6	5242233	5242238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002244
132559	NC_015953	ATC	2	6	5242278	5242283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002244
132560	NC_015953	CGT	2	6	5242292	5242297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002244
132561	NC_015953	ACC	3	9	5242398	5242406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002244
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132563	NC_015953	ACA	2	6	5242477	5242482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002244
132564	NC_015953	GCG	2	6	5242485	5242490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002244
132565	NC_015953	AGC	2	6	5242549	5242554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002244
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132567	NC_015953	GTC	2	6	5242683	5242688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002244
132568	NC_015953	CCG	2	6	5242765	5242770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002244
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132570	NC_015953	GCG	3	9	5242867	5242875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002244
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132572	NC_015953	CGGC	2	8	5242924	5242931	0 %	0 %	50 %	50 %	345002244
132573	NC_015953	CAT	2	6	5242958	5242963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002244
132574	NC_015953	ACA	2	6	5242969	5242974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002244
132575	NC_015953	ACG	2	6	5243032	5243037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002244
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132577	NC_015953	CAT	2	6	5243111	5243116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002244
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132581	NC_015953	TCC	2	6	5243257	5243262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002244
132582	NC_015953	AGA	2	6	5243263	5243268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345002244
132583	NC_015953	GCC	3	9	5243301	5243309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002244
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132585	NC_015953	TGGG	2	8	5243340	5243347	0 %	25 %	75 %	0 %	345002244
132586	NC_015953	CCGA	2	8	5243352	5243359	25 %	0 %	25 %	50 %	345002244
132587	NC_015953	GCA	2	6	5243381	5243386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002244
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132590	NC_015953	CG	3	6	5243481	5243486	0 %	0 %	50 %	50 %	345002245
132591	NC_015953	GTG	2	6	5243500	5243505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002245
132592	NC_015953	GC	4	8	5243512	5243519	0 %	0 %	50 %	50 %	345002245
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132594	NC_015953	GAC	2	6	5243596	5243601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002245
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132596	NC_015953	TGG	2	6	5243639	5243644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002245
132597	NC_015953	GCT	2	6	5243679	5243684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002245
132598	NC_015953	CGG	2	6	5243732	5243737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002245
132599	NC_015953	CGTA	2	8	5243764	5243771	25 %	25 %	25 %	25 %	345002245
132600	NC_015953	ACC	2	6	5243840	5243845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002245
132601	NC_015953	CGGG	2	8	5243872	5243879	0 %	0 %	75 %	25 %	345002245
132602	NC_015953	GAA	2	6	5243901	5243906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345002245
132603	NC_015953	GGC	2	6	5243910	5243915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002245
132604	NC_015953	CTG	2	6	5243917	5243922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002245
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132606	NC_015953	CAGCGC	2	12	5243989	5244000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345002245
132607	NC_015953	CG	5	10	5244009	5244018	0 %	0 %	50 %	50 %	345002245
132608	NC_015953	CGA	2	6	5244048	5244053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002245
132609	NC_015953	CTG	2	6	5244100	5244105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002245
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132611	NC_015953	ACC	2	6	5244184	5244189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002245
132612	NC_015953	GCCG	2	8	5244202	5244209	0 %	0 %	50 %	50 %	345002245
132613	NC_015953	TCG	2	6	5244212	5244217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002245
132614	NC_015953	CCGGAC	2	12	5244289	5244300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345002245
132615	NC_015953	CGA	2	6	5244309	5244314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002245
132616	NC_015953	GGC	2	6	5244315	5244320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002245
132617	NC_015953	AGG	2	6	5244323	5244328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002245
132618	NC_015953	GCG	2	6	5244338	5244343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002245
132619	NC_015953	GCC	2	6	5244345	5244350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002245
132620	NC_015953	GCCG	2	8	5244366	5244373	0 %	0 %	50 %	50 %	345002245
132621	NC_015953	GCC	2	6	5244429	5244434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002245
132622	NC_015953	CGG	2	6	5244450	5244455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002245
132623	NC_015953	CTG	2	6	5244468	5244473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002245
132624	NC_015953	CCGAGG	3	18	5244488	5244505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345002245
132625	NC_015953	AGG	2	6	5244530	5244535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002245
132626	NC_015953	GAAGT	2	10	5244540	5244549	40 %	20 %	40 %	0 %	345002245
132627	NC_015953	TCC	2	6	5244553	5244558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002246
132628	NC_015953	TGA	2	6	5244652	5244657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002246
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132630	NC_015953	ACT	2	6	5244754	5244759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002246
132631	NC_015953	CTT	2	6	5244800	5244805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345002246
132632	NC_015953	TCG	2	6	5244859	5244864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002246
132633	NC_015953	CAC	2	6	5244869	5244874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002246
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132635	NC_015953	GGC	2	6	5244922	5244927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002246
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132637	NC_015953	CTG	2	6	5244948	5244953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002246
132638	NC_015953	CAC	2	6	5244959	5244964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002246
132639	NC_015953	CTGG	2	8	5244989	5244996	0 %	25 %	50 %	25 %	345002246
132640	NC_015953	CATCGC	2	12	5245001	5245012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345002246
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132642	NC_015953	ATG	2	6	5245182	5245187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002246
132643	NC_015953	TCC	2	6	5245197	5245202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002246
132644	NC_015953	TGG	2	6	5245216	5245221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002246
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132648	NC_015953	CTG	2	6	5245338	5245343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002246
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132697	NC_015953	CCTGGC	2	12	5246817	5246828	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345002248
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132699	NC_015953	ACTC	2	8	5246891	5246898	25 %	25 %	0 %	50 %	345002248
132700	NC_015953	CAGC	2	8	5246919	5246926	25 %	0 %	25 %	50 %	345002248
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132702	NC_015953	GCGG	2	8	5246961	5246968	0 %	0 %	75 %	25 %	345002248
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132710	NC_015953	CGT	2	6	5247207	5247212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002248
132711	NC_015953	TCA	2	6	5247215	5247220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002248
132712	NC_015953	GCT	2	6	5247234	5247239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002248
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132714	NC_015953	TCG	2	6	5247284	5247289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002248
132715	NC_015953	GGCG	2	8	5247294	5247301	0 %	0 %	75 %	25 %	345002248
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132717	NC_015953	CGC	2	6	5247379	5247384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002248
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132719	NC_015953	CTG	2	6	5247537	5247542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002248
132720	NC_015953	CGCC	2	8	5247554	5247561	0 %	0 %	25 %	75 %	345002248
132721	NC_015953	GCA	2	6	5247634	5247639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002249
132722	NC_015953	CCG	2	6	5247670	5247675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002249
132723	NC_015953	CCT	2	6	5247697	5247702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002249
132724	NC_015953	GGA	2	6	5247728	5247733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002249
132725	NC_015953	ACC	2	6	5247823	5247828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002249
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132841	NC_015953	CGG	3	9	5252236	5252244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002251
132842	NC_015953	GAT	2	6	5252284	5252289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002251
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132845	NC_015953	CGA	2	6	5252385	5252390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002251
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132847	NC_015953	GCCG	2	8	5252417	5252424	0 %	0 %	50 %	50 %	345002251
132848	NC_015953	CTGCGT	2	12	5252506	5252517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002251
132849	NC_015953	CGA	2	6	5252524	5252529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002251
132850	NC_015953	TCA	2	6	5252595	5252600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002251
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132934	NC_015953	TGCGG	2	10	5255195	5255204	0 %	20 %	60 %	20 %	345002252
132935	NC_015953	CGG	2	6	5255314	5255319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002252
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132938	NC_015953	CTG	2	6	5255348	5255353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002252
132939	NC_015953	GCTCG	2	10	5255365	5255374	0 %	20 %	40 %	40 %	345002252
132940	NC_015953	CGG	3	9	5255407	5255415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002252
132941	NC_015953	GCG	2	6	5255436	5255441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002252
132942	NC_015953	CTC	2	6	5255482	5255487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002252
132943	NC_015953	G	6	6	5255495	5255500	0 %	0 %	100 %	0 %	345002252
132944	NC_015953	CGG	3	9	5255515	5255523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002252
132945	NC_015953	GGC	3	9	5255531	5255539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002252
132946	NC_015953	CGG	3	9	5255548	5255556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002252
132947	NC_015953	AGAT	2	8	5255671	5255678	50 %	25 %	25 %	0 %	345002253
132948	NC_015953	GTCT	2	8	5255682	5255689	0 %	50 %	25 %	25 %	345002253
132949	NC_015953	ACG	2	6	5255692	5255697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002253
132950	NC_015953	CGC	2	6	5255713	5255718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002253
132951	NC_015953	GAA	2	6	5255739	5255744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345002253
132952	NC_015953	CAG	2	6	5255814	5255819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002253
132953	NC_015953	TGT	2	6	5255843	5255848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345002253
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132983	NC_015953	TCG	2	6	5257166	5257171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002254
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132991	NC_015953	CTC	2	6	5257315	5257320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002254
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