MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 188705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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130002	NC_015953	AGC	2	6	5143211	5143216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130003	NC_015953	AG	3	6	5143219	5143224	50 %	0 %	50 %	0 %	345002160
130004	NC_015953	GAT	2	6	5143251	5143256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002160
130005	NC_015953	TCG	2	6	5143295	5143300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130006	NC_015953	CGG	2	6	5143325	5143330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002160
130007	NC_015953	GCC	2	6	5143339	5143344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130008	NC_015953	GTG	2	6	5143365	5143370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002160
130009	NC_015953	CCCGGC	2	12	5143379	5143390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130010	NC_015953	CGGG	2	8	5143410	5143417	0 %	0 %	75 %	25 %	345002160
130011	NC_015953	TAC	2	6	5143420	5143425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002160
130012	NC_015953	CTG	2	6	5143455	5143460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130013	NC_015953	TTC	2	6	5143471	5143476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345002160
130014	NC_015953	CTG	2	6	5143516	5143521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130015	NC_015953	GC	3	6	5143536	5143541	0 %	0 %	50 %	50 %	345002160
130016	NC_015953	CCG	2	6	5143556	5143561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130017	NC_015953	CCA	2	6	5143562	5143567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002160
130018	NC_015953	GCC	2	6	5143596	5143601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
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130020	NC_015953	GCC	2	6	5143621	5143626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130021	NC_015953	CG	3	6	5143683	5143688	0 %	0 %	50 %	50 %	345002160
130022	NC_015953	GGC	2	6	5143692	5143697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002160
130023	NC_015953	CGC	2	6	5143705	5143710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130024	NC_015953	CTC	2	6	5143798	5143803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002160
130025	NC_015953	CGA	2	6	5143827	5143832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130026	NC_015953	CGC	2	6	5143834	5143839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130027	NC_015953	ATC	2	6	5143888	5143893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002160
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130030	NC_015953	CCG	2	6	5143998	5144003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002160
130031	NC_015953	GGA	2	6	5144034	5144039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002160
130032	NC_015953	CGA	2	6	5144040	5144045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130033	NC_015953	TCACGG	2	12	5144111	5144122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345002160
130034	NC_015953	ACG	2	6	5144141	5144146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002160
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130036	NC_015953	GGA	2	6	5144175	5144180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002160
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130038	NC_015953	CGACC	2	10	5144289	5144298	20 %	0 %	20 %	60 %	345002160
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130040	NC_015953	GCG	2	6	5144315	5144320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002160
130041	NC_015953	GGC	2	6	5144323	5144328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002160
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130044	NC_015953	CCCTCG	2	12	5144507	5144518	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345002161
130045	NC_015953	CGA	2	6	5144520	5144525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002161
130046	NC_015953	CGT	2	6	5144532	5144537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002161
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130049	NC_015953	CGT	2	6	5144646	5144651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002161
130050	NC_015953	GCC	2	6	5144689	5144694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002161
130051	NC_015953	GAG	2	6	5144824	5144829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002161
130052	NC_015953	CCG	2	6	5144837	5144842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002161
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130054	NC_015953	CGG	2	6	5144928	5144933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002161
130055	NC_015953	TCG	2	6	5144972	5144977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002161
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130112	NC_015953	GAC	3	9	5147029	5147037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002162
130113	NC_015953	GTC	2	6	5147068	5147073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002162
130114	NC_015953	GGC	2	6	5147132	5147137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002162
130115	NC_015953	CG	3	6	5147158	5147163	0 %	0 %	50 %	50 %	345002162
130116	NC_015953	AGC	2	6	5147180	5147185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002162
130117	NC_015953	CGC	2	6	5147188	5147193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002162
130118	NC_015953	CACC	2	8	5147259	5147266	25 %	0 %	0 %	75 %	345002162
130119	NC_015953	CGC	2	6	5147332	5147337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002162
130120	NC_015953	GCC	2	6	5147372	5147377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002162
130121	NC_015953	GTCC	2	8	5147466	5147473	0 %	25 %	25 %	50 %	345002162
130122	NC_015953	CGC	2	6	5147480	5147485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002162
130123	NC_015953	CCGC	2	8	5147495	5147502	0 %	0 %	25 %	75 %	345002162
130124	NC_015953	GCCG	2	8	5147504	5147511	0 %	0 %	50 %	50 %	345002162
130125	NC_015953	CGT	2	6	5147515	5147520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002162
130126	NC_015953	TCC	2	6	5147531	5147536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002162
130127	NC_015953	CGAAG	2	10	5147721	5147730	40 %	0 %	40 %	20 %	345002163
130128	NC_015953	AG	3	6	5147729	5147734	50 %	0 %	50 %	0 %	345002163
130129	NC_015953	CGGG	2	8	5147737	5147744	0 %	0 %	75 %	25 %	345002163
130130	NC_015953	GCC	2	6	5147749	5147754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002163
130131	NC_015953	CGT	2	6	5147816	5147821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002163
130132	NC_015953	CG	3	6	5147836	5147841	0 %	0 %	50 %	50 %	345002163
130133	NC_015953	GAC	2	6	5147896	5147901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002163
130134	NC_015953	CGGC	2	8	5147925	5147932	0 %	0 %	50 %	50 %	345002163
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130138	NC_015953	CCG	2	6	5148093	5148098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002163
130139	NC_015953	GCA	2	6	5148107	5148112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002163
130140	NC_015953	CAC	2	6	5148120	5148125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002163
130141	NC_015953	CCGG	2	8	5148216	5148223	0 %	0 %	50 %	50 %	345002163
130142	NC_015953	CCGCG	2	10	5148231	5148240	0 %	0 %	40 %	60 %	345002163
130143	NC_015953	CAC	2	6	5148261	5148266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002163
130144	NC_015953	GGT	2	6	5148282	5148287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002163
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130149	NC_015953	GTC	2	6	5148505	5148510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002163
130150	NC_015953	CGG	2	6	5148527	5148532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002163
130151	NC_015953	ACG	2	6	5148547	5148552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002163
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130181	NC_015953	GTC	2	6	5149970	5149975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002164
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130185	NC_015953	CGA	2	6	5150107	5150112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002164
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130210	NC_015953	CG	3	6	5151057	5151062	0 %	0 %	50 %	50 %	345002165
130211	NC_015953	GGCGCT	2	12	5151078	5151089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345002165
130212	NC_015953	GCC	2	6	5151094	5151099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002165
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130214	NC_015953	ATG	2	6	5151516	5151521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002166
130215	NC_015953	G	6	6	5151521	5151526	0 %	0 %	100 %	0 %	345002166
130216	NC_015953	AGC	2	6	5151550	5151555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002166
130217	NC_015953	GCA	2	6	5151565	5151570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002166
130218	NC_015953	GCGGCA	2	12	5151573	5151584	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345002166
130219	NC_015953	GTT	2	6	5151632	5151637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345002166
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130223	NC_015953	TGC	2	6	5151721	5151726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002166
130224	NC_015953	CGC	2	6	5151742	5151747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002166
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130331	NC_015953	CCG	2	6	5156147	5156152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002170
130332	NC_015953	GATC	2	8	5156162	5156169	25 %	25 %	25 %	25 %	345002170
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130336	NC_015953	CGC	2	6	5156235	5156240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002170
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130338	NC_015953	CCG	2	6	5156283	5156288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002170
130339	NC_015953	GTCG	2	8	5156313	5156320	0 %	25 %	50 %	25 %	345002170
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130448	NC_015953	GCGT	2	8	5162097	5162104	0 %	25 %	50 %	25 %	345002177
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130452	NC_015953	GCC	2	6	5162277	5162282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002177
130453	NC_015953	CGGCC	2	10	5162284	5162293	0 %	0 %	40 %	60 %	345002177
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130457	NC_015953	GCC	2	6	5162351	5162356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002177
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130482	NC_015953	CGA	2	6	5163422	5163427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002178
130483	NC_015953	CGA	2	6	5163455	5163460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002178
130484	NC_015953	TCG	2	6	5163475	5163480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002178
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130487	NC_015953	CGA	2	6	5163641	5163646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002179
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