MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 4397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015952	GCC	2	6	151187	151192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007912
3502	NC_015952	GCA	2	6	151206	151211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007912
3503	NC_015952	TCC	2	6	151222	151227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007912
3504	NC_015952	ACCT	2	8	151229	151236	25 %	25 %	0 %	50 %	345007912
3505	NC_015952	CCA	2	6	151240	151245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007912
3506	NC_015952	CCG	2	6	151263	151268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007912
3507	NC_015952	CG	3	6	151281	151286	0 %	0 %	50 %	50 %	345007912
3508	NC_015952	CGC	2	6	151297	151302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007912
3509	NC_015952	GCT	2	6	151306	151311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007912
3510	NC_015952	CTGC	2	8	151318	151325	0 %	25 %	25 %	50 %	345007912
3511	NC_015952	GACG	2	8	151342	151349	25 %	0 %	50 %	25 %	345007912
3512	NC_015952	GAC	2	6	151413	151418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007912
3513	NC_015952	CG	3	6	151469	151474	0 %	0 %	50 %	50 %	345007913
3514	NC_015952	GCT	2	6	151520	151525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3515	NC_015952	CAC	2	6	151593	151598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007913
3516	NC_015952	TCA	2	6	151600	151605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007913
3517	NC_015952	CCG	2	6	151624	151629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3518	NC_015952	CAC	2	6	151682	151687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007913
3519	NC_015952	GCA	2	6	151708	151713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3520	NC_015952	TCG	2	6	151747	151752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3521	NC_015952	TGC	2	6	151789	151794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3522	NC_015952	GCT	2	6	151796	151801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3523	NC_015952	CGC	2	6	151821	151826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3524	NC_015952	CCG	2	6	151828	151833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3525	NC_015952	CGG	2	6	151865	151870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007913
3526	NC_015952	GTG	2	6	151917	151922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007913
3527	NC_015952	CGG	3	9	152078	152086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007913
3528	NC_015952	CCG	3	9	152200	152208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3529	NC_015952	CTGC	2	8	152228	152235	0 %	25 %	25 %	50 %	345007913
3530	NC_015952	ATC	3	9	152340	152348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007913
3531	NC_015952	CCG	2	6	152378	152383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3532	NC_015952	CTC	2	6	152388	152393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007913
3533	NC_015952	GGCCGA	2	12	152420	152431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007913
3534	NC_015952	CAC	2	6	152444	152449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007913
3535	NC_015952	ATC	2	6	152451	152456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007913
3536	NC_015952	TCCG	2	8	152460	152467	0 %	25 %	25 %	50 %	345007913
3537	NC_015952	CAT	2	6	152564	152569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007913
3538	NC_015952	TCG	2	6	152602	152607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3539	NC_015952	AACGGG	2	12	152629	152640	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007913
3540	NC_015952	GCC	2	6	152662	152667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3541	NC_015952	TCG	2	6	152704	152709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3542	NC_015952	CGCC	2	8	152771	152778	0 %	0 %	25 %	75 %	345007913
3543	NC_015952	CGGCGA	2	12	152780	152791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007913
3544	NC_015952	TCA	3	9	152800	152808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007913
3545	NC_015952	CCA	2	6	152813	152818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007913
3546	NC_015952	ACCC	2	8	152840	152847	25 %	0 %	0 %	75 %	345007913
3547	NC_015952	CCG	2	6	153011	153016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007913
3548	NC_015952	TTC	2	6	153151	153156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007913
3549	NC_015952	AGC	3	9	153193	153201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007913
3550	NC_015952	GAG	2	6	153225	153230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007913
3551	NC_015952	CCTCC	2	10	153277	153286	0 %	20 %	0 %	80 %	345007914
3552	NC_015952	CGC	2	6	153307	153312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3553	NC_015952	GCGCCG	2	12	153354	153365	0 %	0 %	50 %	50 %	345007914
3554	NC_015952	TGA	2	6	153387	153392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007914
3555	NC_015952	GGAT	2	8	153431	153438	25 %	25 %	50 %	0 %	345007914
3556	NC_015952	CGC	3	9	153514	153522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3557	NC_015952	CCG	2	6	153556	153561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3558	NC_015952	GTG	2	6	153620	153625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007914
3559	NC_015952	CATC	2	8	153681	153688	25 %	25 %	0 %	50 %	345007914
3560	NC_015952	CCA	2	6	153754	153759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007914
3561	NC_015952	ACC	2	6	153773	153778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007914
3562	NC_015952	CGC	2	6	153820	153825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3563	NC_015952	TGA	2	6	153834	153839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007914
3564	NC_015952	CCG	2	6	153840	153845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3565	NC_015952	GCC	2	6	153857	153862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3566	NC_015952	CCG	2	6	153883	153888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3567	NC_015952	CCG	2	6	153931	153936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3568	NC_015952	CGA	2	6	153944	153949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007914
3569	NC_015952	GCC	2	6	153971	153976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007914
3570	NC_015952	CCT	2	6	154003	154008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007914
3571	NC_015952	CGTAG	2	10	154018	154027	20 %	20 %	40 %	20 %	345007914
3572	NC_015952	TCGG	2	8	154085	154092	0 %	25 %	50 %	25 %	345007915
3573	NC_015952	CGT	2	6	154096	154101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007915
3574	NC_015952	ATGA	2	8	154109	154116	50 %	25 %	25 %	0 %	345007915
3575	NC_015952	CCGG	2	8	154117	154124	0 %	0 %	50 %	50 %	345007915
3576	NC_015952	CG	3	6	154136	154141	0 %	0 %	50 %	50 %	345007915
3577	NC_015952	CTC	2	6	154151	154156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007915
3578	NC_015952	GTG	2	6	154187	154192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007915
3579	NC_015952	TTC	3	9	154313	154321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007915
3580	NC_015952	CCTG	2	8	154336	154343	0 %	25 %	25 %	50 %	345007915
3581	NC_015952	CGC	2	6	154366	154371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007915
3582	NC_015952	CG	3	6	154480	154485	0 %	0 %	50 %	50 %	345007915
3583	NC_015952	CGT	2	6	154516	154521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007915
3584	NC_015952	GAT	2	6	154522	154527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007915
3585	NC_015952	CCG	2	6	154528	154533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007915
3586	NC_015952	ACG	2	6	154542	154547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007915
3587	NC_015952	CCG	2	6	154548	154553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007915
3588	NC_015952	CCA	2	6	154657	154662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007915
3589	NC_015952	CGAC	2	8	154668	154675	25 %	0 %	25 %	50 %	345007915
3590	NC_015952	TGGC	2	8	154724	154731	0 %	25 %	50 %	25 %	345007915
3591	NC_015952	CCG	3	9	154732	154740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007915
3592	NC_015952	CGC	2	6	154747	154752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007915
3593	NC_015952	CTCG	2	8	154828	154835	0 %	25 %	25 %	50 %	345007915
3594	NC_015952	AGG	2	6	154845	154850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007915
3595	NC_015952	GAC	2	6	154859	154864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007915
3596	NC_015952	ATC	2	6	155009	155014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007916
3597	NC_015952	TCA	2	6	155049	155054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007916
3598	NC_015952	CTTC	2	8	155110	155117	0 %	50 %	0 %	50 %	345007916
3599	NC_015952	CGG	3	9	155119	155127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007916
3600	NC_015952	GCG	2	6	155161	155166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007916
3601	NC_015952	CGA	2	6	155254	155259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007916
3602	NC_015952	ATC	2	6	155285	155290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007916
3603	NC_015952	GCG	2	6	155325	155330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007916
3604	NC_015952	G	6	6	155715	155720	0 %	0 %	100 %	0 %	345007917
3605	NC_015952	TCCG	2	8	155733	155740	0 %	25 %	25 %	50 %	345007917
3606	NC_015952	CG	3	6	155785	155790	0 %	0 %	50 %	50 %	345007917
3607	NC_015952	AAC	2	6	155800	155805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007917
3608	NC_015952	GTT	2	6	155808	155813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007917
3609	NC_015952	GTG	2	6	155824	155829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007917
3610	NC_015952	CCA	2	6	155907	155912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007917
3611	NC_015952	CG	3	6	155939	155944	0 %	0 %	50 %	50 %	345007917
3612	NC_015952	CGA	3	9	155955	155963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007917
3613	NC_015952	CGA	2	6	155997	156002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007917
3614	NC_015952	ACG	2	6	156005	156010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007917
3615	NC_015952	CAT	2	6	156018	156023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007917
3616	NC_015952	ACC	2	6	156059	156064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007917
3617	NC_015952	GCC	2	6	156103	156108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007917
3618	NC_015952	GGC	2	6	156246	156251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007917
3619	NC_015952	ACC	2	6	156271	156276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007917
3620	NC_015952	CTGGT	2	10	156350	156359	0 %	40 %	40 %	20 %	345007917
3621	NC_015952	GGC	2	6	156374	156379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007917
3622	NC_015952	CGC	2	6	156395	156400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007917
3623	NC_015952	CGG	2	6	156429	156434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007917
3624	NC_015952	TCTG	2	8	156440	156447	0 %	50 %	25 %	25 %	345007917
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3626	NC_015952	CG	3	6	156694	156699	0 %	0 %	50 %	50 %	345007918
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3740	NC_015952	GTCGGG	2	12	161476	161487	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345007922
3741	NC_015952	GC	3	6	161505	161510	0 %	0 %	50 %	50 %	345007922
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3743	NC_015952	CGG	2	6	161607	161612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007922
3744	NC_015952	GAC	2	6	161641	161646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007922
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3746	NC_015952	CT	3	6	161681	161686	0 %	50 %	0 %	50 %	345007922
3747	NC_015952	CCAG	2	8	161687	161694	25 %	0 %	25 %	50 %	345007922
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3983	NC_015952	GC	3	6	172652	172657	0 %	0 %	50 %	50 %	345007939
3984	NC_015952	GCG	2	6	172704	172709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007939
3985	NC_015952	ATG	2	6	172710	172715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007939
3986	NC_015952	GCG	2	6	172739	172744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007939
3987	NC_015952	GGC	2	6	172763	172768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007939
3988	NC_015952	GGC	2	6	172789	172794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007939
3989	NC_015952	GTC	2	6	172803	172808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007939
3990	NC_015952	AGG	2	6	172821	172826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007939
3991	NC_015952	TGCC	2	8	172861	172868	0 %	25 %	25 %	50 %	345007939
3992	NC_015952	CGG	2	6	172876	172881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007939
3993	NC_015952	GGT	2	6	172940	172945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007940
3994	NC_015952	CGT	2	6	173031	173036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007940
3995	NC_015952	CGA	2	6	173064	173069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007940
3996	NC_015952	GTCGAG	2	12	173080	173091	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007940
3997	NC_015952	GGC	2	6	173119	173124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007940
3998	NC_015952	GC	3	6	173123	173128	0 %	0 %	50 %	50 %	345007940
3999	NC_015952	GAT	2	6	173158	173163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007940
4000	NC_015952	TGA	2	6	173169	173174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007940

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