MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 4397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015952	GGC	3	9	83076	83084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
2002	NC_015952	GGC	2	6	83112	83117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
2003	NC_015952	GCG	2	6	83126	83131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
2004	NC_015952	GCT	2	6	83132	83137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007800
2005	NC_015952	GCCC	2	8	83163	83170	0 %	0 %	25 %	75 %	345007800
2006	NC_015952	GC	3	6	83217	83222	0 %	0 %	50 %	50 %	345007800
2007	NC_015952	CGC	2	6	83265	83270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007800
2008	NC_015952	ATC	2	6	83281	83286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007800
2009	NC_015952	CCGGC	2	10	83312	83321	0 %	0 %	40 %	60 %	345007800
2010	NC_015952	GC	3	6	83342	83347	0 %	0 %	50 %	50 %	345007800
2011	NC_015952	TGG	2	6	83354	83359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007800
2012	NC_015952	GGCG	2	8	83448	83455	0 %	0 %	75 %	25 %	345007800
2013	NC_015952	CGG	2	6	83471	83476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
2014	NC_015952	TC	3	6	83485	83490	0 %	50 %	0 %	50 %	345007800
2015	NC_015952	GC	3	6	83521	83526	0 %	0 %	50 %	50 %	345007800
2016	NC_015952	GCG	2	6	83551	83556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
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2021	NC_015952	AGG	3	9	83633	83641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007800
2022	NC_015952	CGG	2	6	83678	83683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
2023	NC_015952	GTG	2	6	83685	83690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007800
2024	NC_015952	CCG	2	6	83722	83727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007800
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2034	NC_015952	GGGTGC	2	12	84056	84067	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345007800
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2043	NC_015952	GGC	2	6	84312	84317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007800
2044	NC_015952	CAGGG	2	10	84438	84447	20 %	0 %	60 %	20 %	345007801
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2046	NC_015952	CTG	2	6	84485	84490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007801
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2052	NC_015952	CGAGAT	2	12	85136	85147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007802
2053	NC_015952	CGC	2	6	85169	85174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007802
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2058	NC_015952	GCC	2	6	85440	85445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007802
2059	NC_015952	AGA	2	6	85456	85461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007802
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2063	NC_015952	GC	3	6	85517	85522	0 %	0 %	50 %	50 %	345007802
2064	NC_015952	GCG	2	6	85579	85584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007802
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2090	NC_015952	CGA	2	6	86683	86688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007804
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2096	NC_015952	GC	3	6	86862	86867	0 %	0 %	50 %	50 %	345007804
2097	NC_015952	CCG	2	6	86960	86965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007804
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2109	NC_015952	GCCGG	2	10	87412	87421	0 %	0 %	60 %	40 %	345007805
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2112	NC_015952	CGG	2	6	87458	87463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007805
2113	NC_015952	TCG	2	6	87684	87689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007806
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2118	NC_015952	CCG	2	6	87951	87956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007806
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2121	NC_015952	GGGA	2	8	88413	88420	25 %	0 %	75 %	0 %	345007807
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2372	NC_015952	CG	3	6	99356	99361	0 %	0 %	50 %	50 %	345007823
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2374	NC_015952	TGA	2	6	99391	99396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007823
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2376	NC_015952	CGC	2	6	99474	99479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007823
2377	NC_015952	GGA	2	6	99485	99490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007823
2378	NC_015952	CGGCC	2	10	99507	99516	0 %	0 %	40 %	60 %	345007824
2379	NC_015952	GGC	2	6	99519	99524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007824
2380	NC_015952	GGT	2	6	99619	99624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007824
2381	NC_015952	GGC	2	6	99659	99664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007824
2382	NC_015952	GGC	2	6	99688	99693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007824
2383	NC_015952	CCA	2	6	99715	99720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007824
2384	NC_015952	CAGGAG	2	12	99725	99736	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007824
2385	NC_015952	GCA	2	6	99756	99761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007825
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2389	NC_015952	CCGG	2	8	99873	99880	0 %	0 %	50 %	50 %	345007825
2390	NC_015952	AGC	2	6	100117	100122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007826
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2397	NC_015952	GCCG	2	8	100357	100364	0 %	0 %	50 %	50 %	345007826
2398	NC_015952	GC	3	6	100395	100400	0 %	0 %	50 %	50 %	345007826
2399	NC_015952	CACCGT	2	12	100497	100508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007826
2400	NC_015952	CCT	2	6	100536	100541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007826
2401	NC_015952	CGG	2	6	100551	100556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007826
2402	NC_015952	GAA	2	6	100581	100586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007826
2403	NC_015952	GCC	2	6	100657	100662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007827
2404	NC_015952	GCG	2	6	100663	100668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007827
2405	NC_015952	GCC	2	6	100672	100677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007827
2406	NC_015952	TG	3	6	100678	100683	0 %	50 %	50 %	0 %	345007827
2407	NC_015952	GC	3	6	100702	100707	0 %	0 %	50 %	50 %	345007827
2408	NC_015952	GACG	2	8	100711	100718	25 %	0 %	50 %	25 %	345007827
2409	NC_015952	GGA	2	6	100728	100733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007827
2410	NC_015952	CCG	2	6	100772	100777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007827
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2412	NC_015952	CTT	2	6	100850	100855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007827
2413	NC_015952	TGA	2	6	101203	101208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007828
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2418	NC_015952	CTA	2	6	101365	101370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007828
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2439	NC_015952	CCT	2	6	102842	102847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007830
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2449	NC_015952	ACC	2	6	103396	103401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007830
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2452	NC_015952	G	7	7	103518	103524	0 %	0 %	100 %	0 %	345007830
2453	NC_015952	CGG	2	6	103628	103633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007830
2454	NC_015952	GTC	2	6	103647	103652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007830
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2466	NC_015952	TGG	2	6	104359	104364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007831
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2484	NC_015952	CTG	2	6	104988	104993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007833
2485	NC_015952	TCT	2	6	104995	105000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007833
2486	NC_015952	CTG	2	6	105009	105014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007833
2487	NC_015952	GCA	2	6	105027	105032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007833
2488	NC_015952	CTG	2	6	105143	105148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007834
2489	NC_015952	GGA	2	6	105151	105156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007834
2490	NC_015952	CCGG	2	8	105163	105170	0 %	0 %	50 %	50 %	345007834
2491	NC_015952	CCCTGC	3	18	105174	105191	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345007834
2492	NC_015952	CGCCC	2	10	105202	105211	0 %	0 %	20 %	80 %	345007834
2493	NC_015952	GAC	2	6	105305	105310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007834
2494	NC_015952	TGGG	2	8	105326	105333	0 %	25 %	75 %	0 %	345007834
2495	NC_015952	CTGGAC	2	12	105365	105376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007834
2496	NC_015952	TCAC	2	8	105426	105433	25 %	25 %	0 %	50 %	345007834
2497	NC_015952	CGACAT	2	12	105490	105501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007834
2498	NC_015952	CGC	2	6	105524	105529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007834
2499	NC_015952	ACC	2	6	105568	105573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007834
2500	NC_015952	ACC	3	9	105577	105585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007835

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