MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 4397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015952	CCT	2	6	41975	41980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007760
1002	NC_015952	CG	3	6	42010	42015	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1003	NC_015952	CGAC	2	8	42035	42042	25 %	0 %	25 %	50 %	345007760
1004	NC_015952	CGG	2	6	42084	42089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007760
1005	NC_015952	TCC	2	6	42094	42099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007760
1006	NC_015952	CCGG	2	8	42113	42120	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1007	NC_015952	CAC	2	6	42184	42189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007760
1008	NC_015952	CGA	2	6	42192	42197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007760
1009	NC_015952	CGG	2	6	42223	42228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007760
1010	NC_015952	GCC	2	6	42239	42244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007760
1011	NC_015952	CG	3	6	42295	42300	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1012	NC_015952	GAG	2	6	42316	42321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007760
1013	NC_015952	CATC	2	8	42341	42348	25 %	25 %	0 %	50 %	345007760
1014	NC_015952	CAC	2	6	42387	42392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007760
1015	NC_015952	GCCGG	2	10	42470	42479	0 %	0 %	60 %	40 %	345007760
1016	NC_015952	CG	3	6	42489	42494	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1017	NC_015952	GCTCC	2	10	42512	42521	0 %	20 %	20 %	60 %	345007760
1018	NC_015952	TCG	2	6	42562	42567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007760
1019	NC_015952	CGC	3	9	42736	42744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007761
1020	NC_015952	CAC	2	6	42764	42769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007761
1021	NC_015952	CGC	2	6	42841	42846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007761
1022	NC_015952	CG	3	6	42931	42936	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
1023	NC_015952	CAAC	2	8	42953	42960	50 %	0 %	0 %	50 %	345007761
1024	NC_015952	GTG	2	6	42965	42970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007761
1025	NC_015952	CCT	2	6	42988	42993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007761
1026	NC_015952	GT	3	6	43033	43038	0 %	50 %	50 %	0 %	345007761
1027	NC_015952	GC	3	6	43149	43154	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
1028	NC_015952	CGC	2	6	43187	43192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007761
1029	NC_015952	CAAGCG	2	12	43253	43264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1030	NC_015952	CGG	2	6	43265	43270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007761
1031	NC_015952	TGC	3	9	43306	43314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1032	NC_015952	GCG	2	6	43370	43375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007761
1033	NC_015952	GAA	2	6	43391	43396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007761
1034	NC_015952	GAC	2	6	43448	43453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1035	NC_015952	CCGG	2	8	43554	43561	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
1036	NC_015952	GTGGA	2	10	43580	43589	20 %	20 %	60 %	0 %	345007761
1037	NC_015952	CGT	2	6	43669	43674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1038	NC_015952	GCA	2	6	43678	43683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1039	NC_015952	GAG	2	6	43727	43732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007761
1040	NC_015952	CTG	2	6	43760	43765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1041	NC_015952	CCA	2	6	43950	43955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007762
1042	NC_015952	GCCA	2	8	43993	44000	25 %	0 %	25 %	50 %	345007762
1043	NC_015952	GGC	2	6	44021	44026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007762
1044	NC_015952	CCG	2	6	44050	44055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007762
1045	NC_015952	GCC	2	6	44059	44064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007762
1046	NC_015952	GCC	2	6	44068	44073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007762
1047	NC_015952	TGA	2	6	44111	44116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007762
1048	NC_015952	CGG	2	6	44124	44129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007762
1049	NC_015952	GCT	2	6	44136	44141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007762
1050	NC_015952	GCT	2	6	44144	44149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007762
1051	NC_015952	GGT	2	6	44169	44174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007762
1052	NC_015952	CG	3	6	44290	44295	0 %	0 %	50 %	50 %	345007763
1053	NC_015952	GTGC	2	8	44308	44315	0 %	25 %	50 %	25 %	345007763
1054	NC_015952	GTA	2	6	44356	44361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007763
1055	NC_015952	GCC	2	6	44407	44412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007763
1056	NC_015952	TGG	2	6	44463	44468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007763
1057	NC_015952	CGG	2	6	44490	44495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007764
1058	NC_015952	G	6	6	44508	44513	0 %	0 %	100 %	0 %	345007764
1059	NC_015952	AG	3	6	44524	44529	50 %	0 %	50 %	0 %	345007764
1060	NC_015952	GC	3	6	44547	44552	0 %	0 %	50 %	50 %	345007764
1061	NC_015952	GTTC	2	8	44626	44633	0 %	50 %	25 %	25 %	345007764
1062	NC_015952	CTC	2	6	44639	44644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007764
1063	NC_015952	CGCGC	2	10	44696	44705	0 %	0 %	40 %	60 %	345007764
1064	NC_015952	CTT	2	6	44835	44840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007765
1065	NC_015952	TGT	2	6	44852	44857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007765
1066	NC_015952	TTCACC	2	12	44863	44874	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345007765
1067	NC_015952	CG	3	6	44891	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
1068	NC_015952	CGG	2	6	44908	44913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007765
1069	NC_015952	CGT	2	6	44925	44930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1070	NC_015952	CGA	2	6	44939	44944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1071	NC_015952	CTTC	2	8	44957	44964	0 %	50 %	0 %	50 %	345007765
1072	NC_015952	AGG	2	6	44980	44985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007765
1073	NC_015952	TTC	2	6	45004	45009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007765
1074	NC_015952	TCC	2	6	45055	45060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007765
1075	NC_015952	CTC	3	9	45078	45086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007765
1076	NC_015952	TCG	3	9	45106	45114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1077	NC_015952	CTT	2	6	45138	45143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007765
1078	NC_015952	TCA	2	6	45170	45175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007765
1079	NC_015952	CTT	2	6	45207	45212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007765
1080	NC_015952	CTT	3	9	45252	45260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007765
1081	NC_015952	CG	3	6	45262	45267	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
1082	NC_015952	CGA	2	6	45305	45310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1083	NC_015952	GAC	2	6	45351	45356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1084	NC_015952	CGC	2	6	45359	45364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007765
1085	NC_015952	CCGG	2	8	45365	45372	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
1086	NC_015952	CCGG	2	8	45391	45398	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
1087	NC_015952	G	6	6	45397	45402	0 %	0 %	100 %	0 %	345007765
1088	NC_015952	CGA	3	9	45404	45412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007765
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1090	NC_015952	CGT	3	9	45443	45451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1091	NC_015952	GGA	2	6	45507	45512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007765
1092	NC_015952	CGA	2	6	45566	45571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1093	NC_015952	CG	3	6	45607	45612	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
1094	NC_015952	GC	3	6	45614	45619	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
1095	NC_015952	CGC	2	6	45632	45637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007765
1096	NC_015952	TC	3	6	45641	45646	0 %	50 %	0 %	50 %	345007765
1097	NC_015952	TCC	3	9	45655	45663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007765
1098	NC_015952	CCT	2	6	45668	45673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007765
1099	NC_015952	CCG	2	6	45677	45682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007765
1100	NC_015952	TCC	2	6	45694	45699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007765
1101	NC_015952	TCG	2	6	45703	45708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007765
1102	NC_015952	CCGGC	2	10	45710	45719	0 %	0 %	40 %	60 %	345007765
1103	NC_015952	AGG	2	6	45748	45753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007765
1104	NC_015952	CGG	2	6	45767	45772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007765
1105	NC_015952	CCT	2	6	45776	45781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007765
1106	NC_015952	CCG	2	6	45784	45789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007765
1107	NC_015952	TCT	2	6	45803	45808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007765
1108	NC_015952	GGT	2	6	45882	45887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007766
1109	NC_015952	AGA	2	6	45960	45965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007766
1110	NC_015952	GCCAT	2	10	46082	46091	20 %	20 %	20 %	40 %	345007766
1111	NC_015952	GCC	2	6	46108	46113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007766
1112	NC_015952	ATC	2	6	46136	46141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007766
1113	NC_015952	GAG	2	6	46147	46152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007766
1114	NC_015952	GAC	2	6	46187	46192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007766
1115	NC_015952	GGC	2	6	46245	46250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007766
1116	NC_015952	TGA	2	6	46260	46265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007766
1117	NC_015952	C	6	6	46276	46281	0 %	0 %	0 %	100 %	345007766
1118	NC_015952	GGC	2	6	46282	46287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007766
1119	NC_015952	GGA	2	6	46311	46316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007766
1120	NC_015952	GGCAGC	2	12	46363	46374	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007766
1121	NC_015952	AGG	2	6	46438	46443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007767
1122	NC_015952	GTC	2	6	46458	46463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007767
1123	NC_015952	GC	3	6	46564	46569	0 %	0 %	50 %	50 %	345007767
1124	NC_015952	GGC	2	6	46574	46579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007767
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1126	NC_015952	GCC	2	6	46673	46678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007767
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1252	NC_015952	GCT	2	6	51885	51890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007773
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1371	NC_015952	GACG	2	8	57840	57847	25 %	0 %	50 %	25 %	345007776
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1375	NC_015952	CGGAGG	2	12	58004	58015	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345007776
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