MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 4397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015952	CGC	2	6	21409	21414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007741
502	NC_015952	CGC	2	6	21489	21494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
503	NC_015952	GC	3	6	21511	21516	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
504	NC_015952	GAT	3	9	21528	21536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007742
505	NC_015952	CGC	2	6	21549	21554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
506	NC_015952	CG	3	6	21578	21583	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
507	NC_015952	CGC	2	6	21593	21598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
508	NC_015952	CGGCGC	2	12	21605	21616	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
509	NC_015952	GC	3	6	21640	21645	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
510	NC_015952	CGG	2	6	21656	21661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007742
511	NC_015952	GCA	2	6	21683	21688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
512	NC_015952	CCA	2	6	21710	21715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007742
513	NC_015952	ATG	3	9	21733	21741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007742
514	NC_015952	CCG	2	6	21742	21747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
515	NC_015952	CAG	2	6	21777	21782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
516	NC_015952	CCG	2	6	21797	21802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
517	NC_015952	CTT	2	6	21825	21830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007742
518	NC_015952	GCCC	2	8	21840	21847	0 %	0 %	25 %	75 %	345007742
519	NC_015952	TGG	2	6	21866	21871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007742
520	NC_015952	GAC	2	6	21966	21971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
521	NC_015952	GGCG	2	8	21983	21990	0 %	0 %	75 %	25 %	345007742
522	NC_015952	GAC	3	9	22008	22016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
523	NC_015952	CGA	3	9	22028	22036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
524	NC_015952	CAG	2	6	22041	22046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
525	NC_015952	GGC	2	6	22048	22053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007742
526	NC_015952	GGA	2	6	22073	22078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007742
527	NC_015952	GTT	2	6	22199	22204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007742
528	NC_015952	CAT	2	6	22215	22220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007742
529	NC_015952	CGA	2	6	22313	22318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
530	NC_015952	CGG	2	6	22541	22546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007742
531	NC_015952	GTC	2	6	22570	22575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007742
532	NC_015952	GAT	2	6	22626	22631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007742
533	NC_015952	AGTC	2	8	22799	22806	25 %	25 %	25 %	25 %	345007742
534	NC_015952	TCA	2	6	22814	22819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007742
535	NC_015952	GGA	2	6	22847	22852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007742
536	NC_015952	CAG	2	6	22881	22886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
537	NC_015952	GAA	2	6	22908	22913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007742
538	NC_015952	TTG	2	6	22915	22920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007742
539	NC_015952	TCG	2	6	22924	22929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007742
540	NC_015952	GAA	2	6	22962	22967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007742
541	NC_015952	GCT	2	6	22991	22996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007742
542	NC_015952	CCCGCA	2	12	23068	23079	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345007742
543	NC_015952	TGCC	2	8	23099	23106	0 %	25 %	25 %	50 %	345007742
544	NC_015952	AGG	2	6	23107	23112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007742
545	NC_015952	CCA	2	6	23135	23140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007742
546	NC_015952	CGA	2	6	23144	23149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
547	NC_015952	GGC	2	6	23174	23179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007742
548	NC_015952	CGA	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
549	NC_015952	GCC	2	6	23187	23192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
550	NC_015952	GCC	2	6	23265	23270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
551	NC_015952	GTT	2	6	23271	23276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007742
552	NC_015952	GCC	2	6	23286	23291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
553	NC_015952	CGC	2	6	23294	23299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
554	NC_015952	CCA	2	6	23314	23319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007742
555	NC_015952	GCC	2	6	23325	23330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
556	NC_015952	GCC	2	6	23340	23345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
557	NC_015952	CG	3	6	23531	23536	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
558	NC_015952	CG	3	6	23603	23608	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
559	NC_015952	CG	3	6	23675	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
560	NC_015952	CG	3	6	23747	23752	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
561	NC_015952	CCG	2	6	23780	23785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007742
562	NC_015952	CG	3	6	23891	23896	0 %	0 %	50 %	50 %	345007742
563	NC_015952	TGT	2	6	23900	23905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007742
564	NC_015952	TCC	2	6	23986	23991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007742
565	NC_015952	CGA	2	6	24011	24016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007742
566	NC_015952	GTC	2	6	24052	24057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007742
567	NC_015952	TGGC	2	8	24126	24133	0 %	25 %	50 %	25 %	345007743
568	NC_015952	CCG	2	6	24157	24162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007743
569	NC_015952	GCG	2	6	24188	24193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007743
570	NC_015952	CTGGTC	2	12	24250	24261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007743
571	NC_015952	CCT	2	6	24279	24284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007743
572	NC_015952	GCT	2	6	24292	24297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007743
573	NC_015952	CGGC	2	8	24312	24319	0 %	0 %	50 %	50 %	345007743
574	NC_015952	CTG	2	6	24325	24330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007743
575	NC_015952	GGC	2	6	24382	24387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007743
576	NC_015952	CGTCCT	2	12	24390	24401	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345007743
577	NC_015952	GCT	2	6	24453	24458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007743
578	NC_015952	AGG	3	9	24480	24488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007743
579	NC_015952	TCA	2	6	24498	24503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007743
580	NC_015952	GCC	2	6	24516	24521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007743
581	NC_015952	ACC	2	6	24624	24629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007743
582	NC_015952	CAG	2	6	24691	24696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007743
583	NC_015952	GTC	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007743
584	NC_015952	CAG	2	6	24763	24768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007743
585	NC_015952	GCG	2	6	24785	24790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007743
586	NC_015952	GCC	2	6	24806	24811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007743
587	NC_015952	GGAAG	2	10	24849	24858	40 %	0 %	60 %	0 %	345007743
588	NC_015952	GC	3	6	24879	24884	0 %	0 %	50 %	50 %	345007744
589	NC_015952	CGG	2	6	24928	24933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007744
590	NC_015952	TCT	2	6	24950	24955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007744
591	NC_015952	GCC	2	6	24984	24989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007744
592	NC_015952	CTC	2	6	25032	25037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007744
593	NC_015952	TCA	2	6	25088	25093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007744
594	NC_015952	TCG	2	6	25102	25107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007744
595	NC_015952	TCC	2	6	25108	25113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007744
596	NC_015952	CGT	3	9	25145	25153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007744
597	NC_015952	GAGG	2	8	25158	25165	25 %	0 %	75 %	0 %	345007744
598	NC_015952	CCA	2	6	25178	25183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007744
599	NC_015952	GCC	2	6	25194	25199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007744
600	NC_015952	CTT	2	6	25236	25241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007744
601	NC_015952	CGGG	2	8	25244	25251	0 %	0 %	75 %	25 %	345007744
602	NC_015952	TCC	2	6	25272	25277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007744
603	NC_015952	CAG	2	6	25408	25413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007745
604	NC_015952	CGG	2	6	25436	25441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007745
605	NC_015952	GCG	2	6	25511	25516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007745
606	NC_015952	GCC	2	6	25525	25530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007745
607	NC_015952	GCA	2	6	25557	25562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007745
608	NC_015952	CGA	2	6	25565	25570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007745
609	NC_015952	TCCGCG	2	12	25585	25596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345007745
610	NC_015952	CG	3	6	25619	25624	0 %	0 %	50 %	50 %	345007745
611	NC_015952	GCC	2	6	25640	25645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007745
612	NC_015952	GCA	2	6	25673	25678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007745
613	NC_015952	CCA	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007745
614	NC_015952	ACC	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007745
615	NC_015952	C	6	6	25729	25734	0 %	0 %	0 %	100 %	345007745
616	NC_015952	ACC	2	6	25741	25746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007745
617	NC_015952	CTG	2	6	25773	25778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007745
618	NC_015952	TCG	2	6	25825	25830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007745
619	NC_015952	TGC	2	6	25870	25875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007745
620	NC_015952	CCT	2	6	25895	25900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007745
621	NC_015952	GCA	2	6	25902	25907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007745
622	NC_015952	GCA	2	6	25968	25973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007745
623	NC_015952	CCGG	2	8	25982	25989	0 %	0 %	50 %	50 %	345007745
624	NC_015952	CGG	2	6	26064	26069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007745
625	NC_015952	CCA	2	6	26108	26113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007745
626	NC_015952	CGC	2	6	26120	26125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007745
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