MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 5485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015951	GTG	2	6	198515	198520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
3502	NC_015951	AGC	2	6	198555	198560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3503	NC_015951	GCG	2	6	198577	198582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3504	NC_015951	GC	3	6	198618	198623	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
3505	NC_015951	GCG	2	6	198634	198639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3506	NC_015951	CGG	2	6	198649	198654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3507	NC_015951	GTG	2	6	198662	198667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
3508	NC_015951	CAT	2	6	198677	198682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007630
3509	NC_015951	GCCGC	2	10	198732	198741	0 %	0 %	40 %	60 %	345007630
3510	NC_015951	TCG	2	6	198774	198779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3511	NC_015951	GGTC	2	8	198796	198803	0 %	25 %	50 %	25 %	345007630
3512	NC_015951	CGG	2	6	198842	198847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3513	NC_015951	CGG	2	6	198853	198858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3514	NC_015951	AGG	2	6	198867	198872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007630
3515	NC_015951	CAG	2	6	198884	198889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3516	NC_015951	CCGGC	2	10	198910	198919	0 %	0 %	40 %	60 %	345007630
3517	NC_015951	GGGTG	2	10	198940	198949	0 %	20 %	80 %	0 %	345007630
3518	NC_015951	CGC	2	6	199000	199005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
3519	NC_015951	TCG	2	6	199056	199061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3520	NC_015951	TCGGTC	2	12	199119	199130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3521	NC_015951	CAG	2	6	199139	199144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3522	NC_015951	CGGT	2	8	199176	199183	0 %	25 %	50 %	25 %	345007630
3523	NC_015951	GGCA	2	8	199184	199191	25 %	0 %	50 %	25 %	345007630
3524	NC_015951	GCC	2	6	199192	199197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
3525	NC_015951	CG	3	6	199203	199208	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
3526	NC_015951	GCCAC	2	10	199312	199321	20 %	0 %	20 %	60 %	345007630
3527	NC_015951	GGC	2	6	199359	199364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
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3529	NC_015951	CGA	2	6	199487	199492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3530	NC_015951	CAG	2	6	199505	199510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3531	NC_015951	GCC	2	6	199521	199526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
3532	NC_015951	GCC	2	6	199557	199562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
3533	NC_015951	TCGG	2	8	199622	199629	0 %	25 %	50 %	25 %	345007630
3534	NC_015951	CGG	3	9	199627	199635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3535	NC_015951	CAG	2	6	199673	199678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3536	NC_015951	GGCC	2	8	199807	199814	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
3537	NC_015951	CGG	2	6	199921	199926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
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3540	NC_015951	GCA	2	6	200035	200040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3541	NC_015951	GGC	2	6	200083	200088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3542	NC_015951	GCC	2	6	200145	200150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
3543	NC_015951	CGG	2	6	200188	200193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3544	NC_015951	TGG	2	6	200211	200216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
3545	NC_015951	TCC	2	6	200333	200338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
3546	NC_015951	GGTCC	2	10	200375	200384	0 %	20 %	40 %	40 %	345007630
3547	NC_015951	CTG	2	6	200405	200410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3548	NC_015951	TCA	2	6	200419	200424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007630
3549	NC_015951	GCA	2	6	200425	200430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3550	NC_015951	TCC	2	6	200481	200486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
3551	NC_015951	GCG	2	6	200492	200497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3552	NC_015951	GCGTCG	2	12	200505	200516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345007630
3553	NC_015951	CGGCC	2	10	200536	200545	0 %	0 %	40 %	60 %	345007630
3554	NC_015951	GGT	2	6	200553	200558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007630
3555	NC_015951	AGC	2	6	200574	200579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
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3557	NC_015951	CCGG	2	8	200646	200653	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
3558	NC_015951	CCGG	2	8	200656	200663	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
3559	NC_015951	CGG	2	6	200729	200734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3560	NC_015951	CTC	2	6	200759	200764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
3561	NC_015951	AGC	2	6	200766	200771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3562	NC_015951	CGC	2	6	200791	200796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
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3564	NC_015951	TCGC	2	8	200844	200851	0 %	25 %	25 %	50 %	345007630
3565	NC_015951	GCG	2	6	200907	200912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
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3581	NC_015951	CAG	2	6	201482	201487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
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3583	NC_015951	GTCCC	2	10	201536	201545	0 %	20 %	20 %	60 %	345007630
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3589	NC_015951	CCGCA	2	10	201695	201704	20 %	0 %	20 %	60 %	345007630
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3592	NC_015951	GCCACG	2	12	201801	201812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007630
3593	NC_015951	CAG	3	9	201821	201829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3594	NC_015951	CCG	2	6	201856	201861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007630
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3596	NC_015951	AGCGC	2	10	201904	201913	20 %	0 %	40 %	40 %	345007630
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3601	NC_015951	CAG	2	6	202100	202105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007630
3602	NC_015951	CGG	2	6	202123	202128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007630
3603	NC_015951	CCA	2	6	202141	202146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007630
3604	NC_015951	GCCG	2	8	202166	202173	0 %	0 %	50 %	50 %	345007630
3605	NC_015951	TCC	2	6	202178	202183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007630
3606	NC_015951	CGTT	2	8	202512	202519	0 %	50 %	25 %	25 %	345007631
3607	NC_015951	CCG	2	6	202551	202556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
3608	NC_015951	GTC	2	6	202571	202576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
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3611	NC_015951	GCG	2	6	202905	202910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007631
3612	NC_015951	CGC	2	6	202927	202932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
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3616	NC_015951	CCT	2	6	203263	203268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007631
3617	NC_015951	ACG	2	6	203280	203285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007631
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3621	NC_015951	TCG	2	6	203382	203387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007631
3622	NC_015951	GCCC	2	8	203391	203398	0 %	0 %	25 %	75 %	345007631
3623	NC_015951	GCC	2	6	203420	203425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007631
3624	NC_015951	TAC	2	6	203429	203434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007631
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3742	NC_015951	GCG	2	6	209507	209512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007638
3743	NC_015951	TGGC	2	8	209697	209704	0 %	25 %	50 %	25 %	345007638
3744	NC_015951	GTCGG	2	10	210300	210309	0 %	20 %	60 %	20 %	345007639
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3751	NC_015951	CGG	2	6	210502	210507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007639
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3759	NC_015951	GCCG	2	8	210963	210970	0 %	0 %	50 %	50 %	345007640
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3776	NC_015951	TGCC	2	8	211609	211616	0 %	25 %	25 %	50 %	345007640
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3855	NC_015951	G	6	6	214548	214553	0 %	0 %	100 %	0 %	345007641
3856	NC_015951	GAT	2	6	214555	214560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007641
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3858	NC_015951	GTC	3	9	214621	214629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007641
3859	NC_015951	TTCG	2	8	214726	214733	0 %	50 %	25 %	25 %	345007641
3860	NC_015951	CGG	2	6	214776	214781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007641
3861	NC_015951	GCC	2	6	214786	214791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007641
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3985	NC_015951	GGCC	2	8	219587	219594	0 %	0 %	50 %	50 %	345007644
3986	NC_015951	GGC	2	6	219596	219601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007644
3987	NC_015951	CGGCCG	2	12	219628	219639	0 %	0 %	50 %	50 %	345007644
3988	NC_015951	ATC	2	6	219663	219668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007644
3989	NC_015951	GTG	3	9	219683	219691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007645
3990	NC_015951	GAG	2	6	219712	219717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007645
3991	NC_015951	CGC	2	6	219777	219782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007645
3992	NC_015951	ACG	3	9	219860	219868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007645
3993	NC_015951	CGG	2	6	219939	219944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007645
3994	NC_015951	CTG	2	6	219946	219951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007645
3995	NC_015951	ATGG	2	8	219952	219959	25 %	25 %	50 %	0 %	345007645
3996	NC_015951	AGC	2	6	220025	220030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007645
3997	NC_015951	CGGGG	2	10	220144	220153	0 %	0 %	80 %	20 %	345007645
3998	NC_015951	GGT	2	6	220218	220223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007645
3999	NC_015951	GCG	2	6	220268	220273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007645
4000	NC_015951	CGG	2	6	220377	220382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007645

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