MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015947	TGA	2	6	121424	121429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205522
3002	NC_015947	TGC	2	6	121472	121477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205522
3003	NC_015947	GC	4	8	121591	121598	0 %	0 %	50 %	50 %	344205522
3004	NC_015947	GGT	2	6	121629	121634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205522
3005	NC_015947	CAG	2	6	121671	121676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205522
3006	NC_015947	GCA	2	6	121678	121683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205522
3007	NC_015947	TCT	2	6	121836	121841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205523
3008	NC_015947	ACC	2	6	121856	121861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205523
3009	NC_015947	CGGC	2	8	121893	121900	0 %	0 %	50 %	50 %	344205523
3010	NC_015947	TTC	2	6	121904	121909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205523
3011	NC_015947	GTC	2	6	122023	122028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205523
3012	NC_015947	GGC	2	6	122098	122103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205523
3013	NC_015947	GCC	2	6	122131	122136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205523
3014	NC_015947	CGGT	2	8	122151	122158	0 %	25 %	50 %	25 %	344205523
3015	NC_015947	GGT	2	6	122191	122196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205523
3016	NC_015947	GGC	2	6	122247	122252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205523
3017	NC_015947	CAT	2	6	122299	122304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205523
3018	NC_015947	GCC	2	6	122356	122361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205523
3019	NC_015947	GGC	2	6	122391	122396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205523
3020	NC_015947	CTG	2	6	122476	122481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205523
3021	NC_015947	CAG	2	6	122482	122487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205523
3022	NC_015947	CTG	2	6	122533	122538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205523
3023	NC_015947	CTG	2	6	122541	122546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205523
3024	NC_015947	CGT	2	6	122568	122573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205523
3025	NC_015947	CGC	2	6	122574	122579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205523
3026	NC_015947	GCCG	2	8	122584	122591	0 %	0 %	50 %	50 %	344205523
3027	NC_015947	GGC	2	6	122611	122616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205523
3028	NC_015947	GAG	2	6	122632	122637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205523
3029	NC_015947	CAG	3	9	122753	122761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3030	NC_015947	CGC	2	6	122762	122767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205524
3031	NC_015947	ACG	2	6	122841	122846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3032	NC_015947	GGC	2	6	122948	122953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205524
3033	NC_015947	TGG	2	6	122959	122964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205524
3034	NC_015947	CGG	4	12	122989	123000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205524
3035	NC_015947	ACG	2	6	123002	123007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3036	NC_015947	CAG	2	6	123017	123022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3037	NC_015947	GCCGAG	2	12	123039	123050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344205524
3038	NC_015947	CCA	2	6	123076	123081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205524
3039	NC_015947	GC	3	6	123140	123145	0 %	0 %	50 %	50 %	344205524
3040	NC_015947	CCA	2	6	123157	123162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205524
3041	NC_015947	GCA	2	6	123163	123168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3042	NC_015947	GAT	2	6	123182	123187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205524
3043	NC_015947	CAC	2	6	123242	123247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205524
3044	NC_015947	ACC	2	6	123255	123260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205524
3045	NC_015947	GGC	2	6	123275	123280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205524
3046	NC_015947	GCA	2	6	123337	123342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3047	NC_015947	CAC	2	6	123362	123367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205524
3048	NC_015947	GAA	2	6	123401	123406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205524
3049	NC_015947	CCAG	2	8	123421	123428	25 %	0 %	25 %	50 %	344205524
3050	NC_015947	CAG	3	9	123497	123505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3051	NC_015947	GTGC	2	8	123532	123539	0 %	25 %	50 %	25 %	344205524
3052	NC_015947	CG	3	6	123541	123546	0 %	0 %	50 %	50 %	344205524
3053	NC_015947	GGAA	2	8	123549	123556	50 %	0 %	50 %	0 %	344205524
3054	NC_015947	CTG	2	6	123581	123586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205524
3055	NC_015947	TCG	2	6	123814	123819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3056	NC_015947	GTG	2	6	123826	123831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205525
3057	NC_015947	AGC	2	6	123835	123840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3058	NC_015947	TCG	2	6	123862	123867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3059	NC_015947	GAA	2	6	123882	123887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205525
3060	NC_015947	TGC	3	9	123949	123957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3061	NC_015947	CCA	2	6	124036	124041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205525
3062	NC_015947	CG	3	6	124063	124068	0 %	0 %	50 %	50 %	344205525
3063	NC_015947	GC	3	6	124079	124084	0 %	0 %	50 %	50 %	344205525
3064	NC_015947	TCC	2	6	124101	124106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205525
3065	NC_015947	TTC	2	6	124125	124130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205525
3066	NC_015947	TTC	2	6	124146	124151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205525
3067	NC_015947	CTT	2	6	124193	124198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205525
3068	NC_015947	GAA	2	6	124212	124217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205525
3069	NC_015947	GCG	2	6	124218	124223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205525
3070	NC_015947	GCG	2	6	124231	124236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205525
3071	NC_015947	ACG	2	6	124243	124248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3072	NC_015947	GGC	2	6	124281	124286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205525
3073	NC_015947	GCC	2	6	124298	124303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205525
3074	NC_015947	GAAGTG	2	12	124365	124376	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	344205525
3075	NC_015947	CAC	2	6	124380	124385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205525
3076	NC_015947	CCG	2	6	124396	124401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205525
3077	NC_015947	CGA	2	6	124448	124453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3078	NC_015947	CTG	2	6	124455	124460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3079	NC_015947	TCG	2	6	124531	124536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3080	NC_015947	GGC	2	6	124581	124586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205525
3081	NC_015947	CGG	2	6	124613	124618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205525
3082	NC_015947	CGG	2	6	124646	124651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205525
3083	NC_015947	CGT	2	6	124774	124779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205525
3084	NC_015947	GC	3	6	124809	124814	0 %	0 %	50 %	50 %	344205525
3085	NC_015947	GATCC	2	10	124836	124845	20 %	20 %	20 %	40 %	344205525
3086	NC_015947	TGA	2	6	124873	124878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205525
3087	NC_015947	GGCC	2	8	124880	124887	0 %	0 %	50 %	50 %	344205525
3088	NC_015947	GCC	2	6	124949	124954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205525
3089	NC_015947	GAA	2	6	124956	124961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205525
3090	NC_015947	TGA	2	6	125050	125055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205525
3091	NC_015947	CG	3	6	125112	125117	0 %	0 %	50 %	50 %	344205525
3092	NC_015947	CCAC	2	8	125119	125126	25 %	0 %	0 %	75 %	344205525
3093	NC_015947	TAC	2	6	125145	125150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205525
3094	NC_015947	CAT	2	6	125500	125505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205526
3095	NC_015947	CGA	2	6	125521	125526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205526
3096	NC_015947	CGT	2	6	125635	125640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205526
3097	NC_015947	CAAGAT	2	12	125653	125664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344205526
3098	NC_015947	CGA	2	6	125680	125685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205526
3099	NC_015947	GTC	2	6	125716	125721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205526
3100	NC_015947	GGCA	2	8	125722	125729	25 %	0 %	50 %	25 %	344205526
3101	NC_015947	CATCCG	2	12	125779	125790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344205526
3102	NC_015947	TGC	2	6	125901	125906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3103	NC_015947	GC	3	6	125910	125915	0 %	0 %	50 %	50 %	344205527
3104	NC_015947	GGC	2	6	125917	125922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205527
3105	NC_015947	TGCCCA	2	12	125941	125952	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344205527
3106	NC_015947	CGAG	2	8	125973	125980	25 %	0 %	50 %	25 %	344205527
3107	NC_015947	GCC	3	9	126047	126055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205527
3108	NC_015947	CTG	2	6	126095	126100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3109	NC_015947	TGC	2	6	126102	126107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3110	NC_015947	TGG	2	6	126111	126116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205527
3111	NC_015947	CGG	2	6	126139	126144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205527
3112	NC_015947	GAA	2	6	126157	126162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205527
3113	NC_015947	TGG	2	6	126189	126194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205527
3114	NC_015947	TGC	3	9	126207	126215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3115	NC_015947	TTC	2	6	126263	126268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205527
3116	NC_015947	GTTC	2	8	126270	126277	0 %	50 %	25 %	25 %	344205527
3117	NC_015947	TCG	2	6	126357	126362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3118	NC_015947	CAC	2	6	126388	126393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205527
3119	NC_015947	TCG	2	6	126402	126407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3120	NC_015947	CG	3	6	126434	126439	0 %	0 %	50 %	50 %	344205527
3121	NC_015947	TGC	2	6	126441	126446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3122	NC_015947	GCG	2	6	126504	126509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205527
3123	NC_015947	CGAT	2	8	126531	126538	25 %	25 %	25 %	25 %	344205527
3124	NC_015947	TGGC	2	8	126576	126583	0 %	25 %	50 %	25 %	344205527
3125	NC_015947	TGG	2	6	126585	126590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205527
3126	NC_015947	TCG	2	6	126600	126605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
3127	NC_015947	TGC	2	6	126675	126680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
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3129	NC_015947	CCG	3	9	126714	126722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205527
3130	NC_015947	GCT	2	6	126773	126778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
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3132	NC_015947	GCC	2	6	126839	126844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205527
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3134	NC_015947	ATC	3	9	126911	126919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205527
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3137	NC_015947	TCG	2	6	127026	127031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
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3139	NC_015947	GGT	2	6	127117	127122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205527
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3142	NC_015947	CTG	2	6	127172	127177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205527
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3145	NC_015947	GCT	2	6	127529	127534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205528
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3147	NC_015947	CG	3	6	127607	127612	0 %	0 %	50 %	50 %	344205528
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3151	NC_015947	GCCGGG	2	12	127779	127790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205528
3152	NC_015947	TGC	3	9	127894	127902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205528
3153	NC_015947	CAC	2	6	127910	127915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205528
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3157	NC_015947	CGC	2	6	128132	128137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205528
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3161	NC_015947	GCT	3	9	128213	128221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205528
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3225	NC_015947	CGA	2	6	131497	131502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205533
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3227	NC_015947	CG	4	8	131605	131612	0 %	0 %	50 %	50 %	344205533
3228	NC_015947	CTG	2	6	131669	131674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205533
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3231	NC_015947	GAG	2	6	131702	131707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205533
3232	NC_015947	CGA	3	9	131759	131767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205534
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3234	NC_015947	GCT	2	6	131882	131887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205534
3235	NC_015947	CGA	2	6	131912	131917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205534
3236	NC_015947	TGC	2	6	131926	131931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205534
3237	NC_015947	GGT	3	9	131966	131974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205534
3238	NC_015947	GC	3	6	132025	132030	0 %	0 %	50 %	50 %	344205534
3239	NC_015947	TGGCGC	2	12	132070	132081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205534
3240	NC_015947	TGC	2	6	132088	132093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205534
3241	NC_015947	CGG	2	6	132094	132099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205534
3242	NC_015947	CGC	2	6	132128	132133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205534
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3245	NC_015947	GC	4	8	132185	132192	0 %	0 %	50 %	50 %	344205534
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3354	NC_015947	GCCTGG	2	12	136689	136700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205538
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3480	NC_015947	TGA	2	6	141379	141384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205544
3481	NC_015947	GGT	3	9	141398	141406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205544
3482	NC_015947	TGG	2	6	141496	141501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205544
3483	NC_015947	GGT	2	6	141521	141526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205544
3484	NC_015947	CCG	2	6	141559	141564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205544
3485	NC_015947	GAA	2	6	141575	141580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205544
3486	NC_015947	CGG	2	6	141611	141616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205544
3487	NC_015947	GCA	2	6	141629	141634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205544
3488	NC_015947	GCC	2	6	141811	141816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205545
3489	NC_015947	CTGAAC	2	12	141922	141933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344205545
3490	NC_015947	CAG	2	6	141934	141939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205545
3491	NC_015947	GTG	2	6	141970	141975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205545
3492	NC_015947	TCGA	2	8	142075	142082	25 %	25 %	25 %	25 %	344205545
3493	NC_015947	TGC	2	6	142085	142090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205545
3494	NC_015947	CGG	2	6	142158	142163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205545
3495	NC_015947	TTC	2	6	142174	142179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205545
3496	NC_015947	GCGCCA	2	12	142221	142232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205545
3497	NC_015947	GCTG	2	8	142254	142261	0 %	25 %	50 %	25 %	344205545
3498	NC_015947	GCACG	2	10	142380	142389	20 %	0 %	40 %	40 %	344205546
3499	NC_015947	CCA	2	6	142501	142506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205546
3500	NC_015947	CGG	2	6	142519	142524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205546

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