MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015947	TGC	3	9	676802	676810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16002	NC_015947	AGC	2	6	676811	676816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16003	NC_015947	GCC	2	6	676856	676861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206012
16004	NC_015947	GC	3	6	676896	676901	0 %	0 %	50 %	50 %	344206012
16005	NC_015947	GTC	2	6	676921	676926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16006	NC_015947	CG	3	6	676995	677000	0 %	0 %	50 %	50 %	344206012
16007	NC_015947	GGC	2	6	677077	677082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206012
16008	NC_015947	GC	3	6	677134	677139	0 %	0 %	50 %	50 %	344206012
16009	NC_015947	GGC	2	6	677236	677241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206012
16010	NC_015947	CGC	2	6	677380	677385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206012
16011	NC_015947	CGT	2	6	677388	677393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16012	NC_015947	CAG	2	6	677398	677403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16013	NC_015947	CAG	2	6	677464	677469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16014	NC_015947	CAGC	2	8	677475	677482	25 %	0 %	25 %	50 %	344206012
16015	NC_015947	CAG	2	6	677494	677499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206012
16016	NC_015947	CCGA	2	8	677687	677694	25 %	0 %	25 %	50 %	344206013
16017	NC_015947	CAC	2	6	677731	677736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206013
16018	NC_015947	GCC	2	6	677764	677769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206013
16019	NC_015947	GTT	2	6	677797	677802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344206013
16020	NC_015947	GCC	2	6	677803	677808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206013
16021	NC_015947	AGCC	2	8	677817	677824	25 %	0 %	25 %	50 %	344206013
16022	NC_015947	ACGC	2	8	677911	677918	25 %	0 %	25 %	50 %	344206013
16023	NC_015947	GCA	2	6	677960	677965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206013
16024	NC_015947	CGG	2	6	677967	677972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206013
16025	NC_015947	CGGT	2	8	677984	677991	0 %	25 %	50 %	25 %	344206013
16026	NC_015947	GTC	2	6	678157	678162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206013
16027	NC_015947	GTC	2	6	678172	678177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206013
16028	NC_015947	CAG	2	6	678256	678261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206013
16029	NC_015947	GGC	2	6	678262	678267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206013
16030	NC_015947	ATC	2	6	678826	678831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344206014
16031	NC_015947	CGG	2	6	678867	678872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206014
16032	NC_015947	CAG	2	6	678981	678986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206014
16033	NC_015947	TCA	2	6	679055	679060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344206014
16034	NC_015947	GC	3	6	679068	679073	0 %	0 %	50 %	50 %	344206014
16035	NC_015947	CGAC	2	8	679082	679089	25 %	0 %	25 %	50 %	344206014
16036	NC_015947	CGG	2	6	679095	679100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206014
16037	NC_015947	TCCA	2	8	679144	679151	25 %	25 %	0 %	50 %	344206014
16038	NC_015947	CGC	2	6	679182	679187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206014
16039	NC_015947	AAG	2	6	679216	679221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344206014
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16043	NC_015947	TCG	2	6	679498	679503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206015
16044	NC_015947	GCC	2	6	679542	679547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206015
16045	NC_015947	TGCC	2	8	679605	679612	0 %	25 %	25 %	50 %	344206015
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16050	NC_015947	GCG	2	6	679840	679845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206015
16051	NC_015947	TGG	2	6	679921	679926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206015
16052	NC_015947	GCA	2	6	679945	679950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206015
16053	NC_015947	GC	3	6	679953	679958	0 %	0 %	50 %	50 %	344206015
16054	NC_015947	CG	4	8	679979	679986	0 %	0 %	50 %	50 %	344206015
16055	NC_015947	CTG	2	6	680220	680225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206015
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16058	NC_015947	GC	3	6	680270	680275	0 %	0 %	50 %	50 %	344206015
16059	NC_015947	TGG	2	6	680302	680307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206015
16060	NC_015947	CG	3	6	680320	680325	0 %	0 %	50 %	50 %	344206015
16061	NC_015947	CTG	2	6	680337	680342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206015
16062	NC_015947	CAG	2	6	680355	680360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206015
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16119	NC_015947	CCA	2	6	682975	682980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206019
16120	NC_015947	GGC	2	6	683004	683009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206019
16121	NC_015947	CGC	2	6	683017	683022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344206019
16122	NC_015947	CAC	2	6	683053	683058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206019
16123	NC_015947	AAC	2	6	683153	683158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344206019
16124	NC_015947	ACC	2	6	683163	683168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206019
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16130	NC_015947	CTG	2	6	683451	683456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206020
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16135	NC_015947	GTT	2	6	683574	683579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344206020
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16227	NC_015947	A	6	6	688242	688247	100 %	0 %	0 %	0 %	344206022
16228	NC_015947	CG	3	6	688311	688316	0 %	0 %	50 %	50 %	344206022
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16236	NC_015947	GGC	2	6	688585	688590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206022
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16238	NC_015947	TCA	2	6	688679	688684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344206022
16239	NC_015947	TCG	2	6	688765	688770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206022
16240	NC_015947	GCG	2	6	688859	688864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206022
16241	NC_015947	TGG	2	6	689021	689026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
16242	NC_015947	GAA	2	6	689031	689036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344206022
16243	NC_015947	GATCGA	2	12	689079	689090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344206022
16244	NC_015947	TGG	2	6	689117	689122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206022
16245	NC_015947	CG	3	6	689125	689130	0 %	0 %	50 %	50 %	344206022
16246	NC_015947	G	6	6	689133	689138	0 %	0 %	100 %	0 %	344206022
16247	NC_015947	GAT	2	6	689230	689235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344206022
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16253	NC_015947	GCA	2	6	689474	689479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206022
16254	NC_015947	TGT	2	6	689493	689498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344206022
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16261	NC_015947	CGT	2	6	689816	689821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206022
16262	NC_015947	GC	3	6	689864	689869	0 %	0 %	50 %	50 %	344206022
16263	NC_015947	GCAGCT	2	12	689883	689894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344206022
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16265	NC_015947	GTGG	2	8	690223	690230	0 %	25 %	75 %	0 %	344206022
16266	NC_015947	CTG	2	6	690501	690506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
16267	NC_015947	TCC	2	6	690524	690529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344206023
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16272	NC_015947	TGC	2	6	690715	690720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206023
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16341	NC_015947	GCATCG	2	12	693272	693283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344206024
16342	NC_015947	GGCC	2	8	693300	693307	0 %	0 %	50 %	50 %	344206024
16343	NC_015947	CAG	2	6	693379	693384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344206024
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16345	NC_015947	GCCGGT	2	12	693445	693456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344206024
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16354	NC_015947	CGG	2	6	693726	693731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206024
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16476	NC_015947	CAC	2	6	698288	698293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206029
16477	NC_015947	ACC	2	6	698294	698299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344206029
16478	NC_015947	GGT	2	6	698302	698307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344206029
16479	NC_015947	GTC	2	6	698311	698316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344206029
16480	NC_015947	TCACC	2	10	698364	698373	20 %	20 %	0 %	60 %	344206029
16481	NC_015947	TTG	2	6	698414	698419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344206029
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16484	NC_015947	CGG	2	6	698552	698557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206029
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16497	NC_015947	CGG	2	6	699471	699476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206030
16498	NC_015947	GCCA	2	8	699541	699548	25 %	0 %	25 %	50 %	344206030
16499	NC_015947	CGG	2	6	699573	699578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344206030
16500	NC_015947	GC	3	6	699612	699617	0 %	0 %	50 %	50 %	344206030

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