MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015947	TGG	2	6	45834	45839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205461
1002	NC_015947	CTG	2	6	45865	45870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205462
1003	NC_015947	GCG	2	6	45871	45876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205462
1004	NC_015947	CTG	2	6	45877	45882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205462
1005	NC_015947	GCG	2	6	45889	45894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205462
1006	NC_015947	GAG	2	6	46039	46044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205462
1007	NC_015947	AGC	3	9	46079	46087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205462
1008	NC_015947	GC	3	6	46147	46152	0 %	0 %	50 %	50 %	344205462
1009	NC_015947	GCT	2	6	46392	46397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205463
1010	NC_015947	GGC	2	6	46398	46403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205463
1011	NC_015947	GCT	2	6	46407	46412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205463
1012	NC_015947	CGC	2	6	46428	46433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205463
1013	NC_015947	GCC	2	6	46452	46457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205463
1014	NC_015947	CGT	2	6	46524	46529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205463
1015	NC_015947	CCA	2	6	46661	46666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205463
1016	NC_015947	TGG	2	6	46676	46681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205463
1017	NC_015947	AAG	2	6	46735	46740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205463
1018	NC_015947	TGCGCC	2	12	46808	46819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205463
1019	NC_015947	CCGG	2	8	46866	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	344205463
1020	NC_015947	CCG	2	6	46883	46888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205463
1021	NC_015947	GCT	2	6	46983	46988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205463
1022	NC_015947	CGG	2	6	46998	47003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205463
1023	NC_015947	CGA	2	6	47064	47069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205463
1024	NC_015947	GCT	2	6	47164	47169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205463
1025	NC_015947	CGG	2	6	47183	47188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205463
1026	NC_015947	GC	4	8	47194	47201	0 %	0 %	50 %	50 %	344205463
1027	NC_015947	ACC	2	6	47318	47323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205464
1028	NC_015947	CGC	2	6	47324	47329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205464
1029	NC_015947	GCC	2	6	47352	47357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205464
1030	NC_015947	GCGCC	2	10	47377	47386	0 %	0 %	40 %	60 %	344205464
1031	NC_015947	GCT	2	6	47422	47427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1032	NC_015947	GC	3	6	47458	47463	0 %	0 %	50 %	50 %	344205464
1033	NC_015947	CTG	3	9	47471	47479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1034	NC_015947	TGC	2	6	47502	47507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1035	NC_015947	TGC	2	6	47535	47540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1036	NC_015947	TGCG	2	8	47556	47563	0 %	25 %	50 %	25 %	344205464
1037	NC_015947	GCC	2	6	47595	47600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205464
1038	NC_015947	TGC	2	6	47601	47606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1039	NC_015947	CGC	2	6	47621	47626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205464
1040	NC_015947	CTG	2	6	47636	47641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1041	NC_015947	CCG	2	6	47649	47654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205464
1042	NC_015947	GCT	2	6	47668	47673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1043	NC_015947	GAC	2	6	47699	47704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1044	NC_015947	GC	3	6	47748	47753	0 %	0 %	50 %	50 %	344205464
1045	NC_015947	GGT	3	9	47782	47790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205464
1046	NC_015947	CGC	2	6	47809	47814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205464
1047	NC_015947	CG	3	6	47868	47873	0 %	0 %	50 %	50 %	344205464
1048	NC_015947	CAC	2	6	47938	47943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205464
1049	NC_015947	TCA	2	6	47955	47960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205464
1050	NC_015947	GC	3	6	47970	47975	0 %	0 %	50 %	50 %	344205464
1051	NC_015947	CTG	2	6	47996	48001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205464
1052	NC_015947	CTGCC	2	10	48020	48029	0 %	20 %	20 %	60 %	344205464
1053	NC_015947	CG	3	6	48041	48046	0 %	0 %	50 %	50 %	344205464
1054	NC_015947	CCA	2	6	48057	48062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205464
1055	NC_015947	GC	3	6	48070	48075	0 %	0 %	50 %	50 %	344205464
1056	NC_015947	TGCA	2	8	48210	48217	25 %	25 %	25 %	25 %	344205465
1057	NC_015947	ACG	2	6	48218	48223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1058	NC_015947	CCTC	2	8	48241	48248	0 %	25 %	0 %	75 %	344205465
1059	NC_015947	GCC	2	6	48319	48324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1060	NC_015947	CAGCCG	2	12	48330	48341	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205465
1061	NC_015947	GC	5	10	48369	48378	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1062	NC_015947	TGC	2	6	48412	48417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1063	NC_015947	GCC	2	6	48421	48426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1064	NC_015947	GACTG	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	344205465
1065	NC_015947	ACCAGT	2	12	48445	48456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344205465
1066	NC_015947	TTC	2	6	48519	48524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205465
1067	NC_015947	CGGCG	2	10	48602	48611	0 %	0 %	60 %	40 %	344205465
1068	NC_015947	GCCG	2	8	48650	48657	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1069	NC_015947	ACCG	2	8	48699	48706	25 %	0 %	25 %	50 %	344205465
1070	NC_015947	CG	3	6	48741	48746	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1071	NC_015947	AAGG	2	8	48753	48760	50 %	0 %	50 %	0 %	344205465
1072	NC_015947	CG	3	6	48776	48781	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1073	NC_015947	GGA	2	6	48815	48820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205465
1074	NC_015947	CTA	2	6	48839	48844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205465
1075	NC_015947	CTG	2	6	48891	48896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1076	NC_015947	TGC	2	6	48949	48954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1077	NC_015947	GC	3	6	48970	48975	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1078	NC_015947	CCG	2	6	49049	49054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1079	NC_015947	CATGG	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	344205465
1080	NC_015947	GGC	2	6	49132	49137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205465
1081	NC_015947	GCT	2	6	49139	49144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1082	NC_015947	CG	3	6	49189	49194	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1083	NC_015947	CTG	2	6	49203	49208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1084	NC_015947	GAC	2	6	49239	49244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1085	NC_015947	TGG	2	6	49318	49323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205465
1086	NC_015947	ACA	2	6	49351	49356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205465
1087	NC_015947	GCT	2	6	49403	49408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1088	NC_015947	CCG	2	6	49440	49445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1089	NC_015947	GCC	2	6	49451	49456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1090	NC_015947	AAG	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205465
1091	NC_015947	GGC	2	6	49551	49556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205465
1092	NC_015947	GGT	2	6	49595	49600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205465
1093	NC_015947	AGCC	2	8	49604	49611	25 %	0 %	25 %	50 %	344205465
1094	NC_015947	GC	3	6	49635	49640	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1095	NC_015947	CG	3	6	49665	49670	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1096	NC_015947	GCC	2	6	49685	49690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1097	NC_015947	GCA	2	6	49696	49701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205465
1098	NC_015947	GTG	2	6	49735	49740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205465
1099	NC_015947	CGC	2	6	49780	49785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
1100	NC_015947	CGG	2	6	49786	49791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205465
1101	NC_015947	GC	3	6	49792	49797	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1102	NC_015947	GATC	2	8	50373	50380	25 %	25 %	25 %	25 %	344205466
1103	NC_015947	CGC	2	6	50388	50393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205466
1104	NC_015947	TCT	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205466
1105	NC_015947	TCG	2	6	50508	50513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205466
1106	NC_015947	CTT	2	6	50515	50520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205466
1107	NC_015947	TCG	2	6	50555	50560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205466
1108	NC_015947	CAG	2	6	50569	50574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205466
1109	NC_015947	CGC	2	6	50598	50603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205466
1110	NC_015947	AGCAC	2	10	50625	50634	40 %	0 %	20 %	40 %	344205466
1111	NC_015947	CCA	2	6	50706	50711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205466
1112	NC_015947	GCCAT	2	10	50786	50795	20 %	20 %	20 %	40 %	344205466
1113	NC_015947	GC	3	6	50798	50803	0 %	0 %	50 %	50 %	344205466
1114	NC_015947	CGCCGG	2	12	50826	50837	0 %	0 %	50 %	50 %	344205466
1115	NC_015947	GTC	2	6	50842	50847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205466
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1117	NC_015947	GCA	2	6	50907	50912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205466
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1119	NC_015947	TAG	2	6	50945	50950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205466
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1123	NC_015947	AGT	2	6	51054	51059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205467
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1125	NC_015947	CGG	2	6	51081	51086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205467
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1496	NC_015947	GCG	2	6	64563	64568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205479
1497	NC_015947	CTGCG	2	10	64595	64604	0 %	20 %	40 %	40 %	344205479
1498	NC_015947	CGA	2	6	64690	64695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205479
1499	NC_015947	CGA	2	6	64753	64758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205479
1500	NC_015947	GCC	2	6	64764	64769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205479

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