MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015947	CAG	2	6	594377	594382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205948
14002	NC_015947	GTA	2	6	594392	594397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205948
14003	NC_015947	GAA	3	9	594425	594433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205948
14004	NC_015947	CGG	2	6	594496	594501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205948
14005	NC_015947	GGC	2	6	594503	594508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205948
14006	NC_015947	GGTGC	2	10	594595	594604	0 %	20 %	60 %	20 %	344205948
14007	NC_015947	CAG	2	6	594605	594610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205948
14008	NC_015947	CGA	2	6	594613	594618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205948
14009	NC_015947	GGCGCC	2	12	594620	594631	0 %	0 %	50 %	50 %	344205948
14010	NC_015947	CAG	2	6	594692	594697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205948
14011	NC_015947	CGG	2	6	594769	594774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205948
14012	NC_015947	TGGC	2	8	594870	594877	0 %	25 %	50 %	25 %	344205948
14013	NC_015947	CCG	2	6	594891	594896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205948
14014	NC_015947	CCT	2	6	594928	594933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205948
14015	NC_015947	CA	3	6	594940	594945	50 %	0 %	0 %	50 %	344205948
14016	NC_015947	GGCC	2	8	594982	594989	0 %	0 %	50 %	50 %	344205948
14017	NC_015947	CGT	2	6	595027	595032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205948
14018	NC_015947	GAGC	2	8	595054	595061	25 %	0 %	50 %	25 %	344205948
14019	NC_015947	TTC	2	6	595109	595114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205948
14020	NC_015947	GCA	2	6	595576	595581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205949
14021	NC_015947	CGG	2	6	595591	595596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205949
14022	NC_015947	GCG	2	6	595622	595627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205949
14023	NC_015947	GGT	2	6	595642	595647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205949
14024	NC_015947	GGC	2	6	595673	595678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205949
14025	NC_015947	TG	3	6	595686	595691	0 %	50 %	50 %	0 %	344205949
14026	NC_015947	GCG	2	6	595728	595733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205949
14027	NC_015947	CAA	2	6	595756	595761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205949
14028	NC_015947	TCGGCC	2	12	595779	595790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205949
14029	NC_015947	GCT	2	6	595792	595797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205949
14030	NC_015947	AAG	2	6	595814	595819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205949
14031	NC_015947	CTGG	2	8	595868	595875	0 %	25 %	50 %	25 %	344205949
14032	NC_015947	GC	3	6	595924	595929	0 %	0 %	50 %	50 %	344205949
14033	NC_015947	CGG	2	6	595930	595935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205949
14034	NC_015947	TTC	2	6	595952	595957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205949
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14036	NC_015947	GC	3	6	596044	596049	0 %	0 %	50 %	50 %	344205949
14037	NC_015947	CGA	2	6	596080	596085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205949
14038	NC_015947	CGCA	2	8	596113	596120	25 %	0 %	25 %	50 %	344205949
14039	NC_015947	GTGGAA	2	12	596162	596173	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	344205949
14040	NC_015947	GGT	2	6	596176	596181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205949
14041	NC_015947	CG	3	6	596288	596293	0 %	0 %	50 %	50 %	344205949
14042	NC_015947	GGC	2	6	596330	596335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205950
14043	NC_015947	CGC	2	6	596339	596344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205950
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14045	NC_015947	CGAC	2	8	596476	596483	25 %	0 %	25 %	50 %	344205950
14046	NC_015947	CG	3	6	596535	596540	0 %	0 %	50 %	50 %	344205950
14047	NC_015947	GAT	2	6	596576	596581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205950
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14049	NC_015947	TGG	2	6	596701	596706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205950
14050	NC_015947	GTG	3	9	596721	596729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205950
14051	NC_015947	GGCGTG	2	12	596796	596807	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344205950
14052	NC_015947	CAT	2	6	596816	596821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205950
14053	NC_015947	CTG	3	9	596859	596867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205950
14054	NC_015947	CGA	2	6	596990	596995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205951
14055	NC_015947	CAA	2	6	597011	597016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205951
14056	NC_015947	GCA	2	6	597023	597028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205951
14057	NC_015947	AGT	2	6	597091	597096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205951
14058	NC_015947	CTG	2	6	597131	597136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205951
14059	NC_015947	GCG	2	6	597140	597145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205951
14060	NC_015947	CGC	2	6	597171	597176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205951
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14064	NC_015947	CCAG	2	8	597329	597336	25 %	0 %	25 %	50 %	344205951
14065	NC_015947	GAT	2	6	597414	597419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205951
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14067	NC_015947	ATC	2	6	597522	597527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205951
14068	NC_015947	CAG	2	6	597537	597542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205951
14069	NC_015947	GCGG	2	8	597562	597569	0 %	0 %	75 %	25 %	344205951
14070	NC_015947	GCGTC	2	10	597590	597599	0 %	20 %	40 %	40 %	344205951
14071	NC_015947	CAGCA	2	10	597633	597642	40 %	0 %	20 %	40 %	344205951
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14085	NC_015947	TGC	2	6	598216	598221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205951
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14087	NC_015947	CGT	2	6	598258	598263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205951
14088	NC_015947	GCCA	2	8	598318	598325	25 %	0 %	25 %	50 %	344205951
14089	NC_015947	CTG	2	6	598326	598331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205951
14090	NC_015947	AGT	3	9	598367	598375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205951
14091	NC_015947	CGT	2	6	598556	598561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205951
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14100	NC_015947	GCTG	3	12	599027	599038	0 %	25 %	50 %	25 %	344205952
14101	NC_015947	GCCGAC	2	12	599041	599052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205952
14102	NC_015947	CGC	2	6	599129	599134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205952
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14106	NC_015947	GGT	3	9	599293	599301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205952
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14108	NC_015947	TCGCT	2	10	599357	599366	0 %	40 %	20 %	40 %	344205952
14109	NC_015947	GC	3	6	599380	599385	0 %	0 %	50 %	50 %	344205952
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14119	NC_015947	CCG	2	6	599743	599748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205953
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14227	NC_015947	GC	3	6	603986	603991	0 %	0 %	50 %	50 %	344205957
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14230	NC_015947	GCT	2	6	604113	604118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205957
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14235	NC_015947	CGGC	2	8	604241	604248	0 %	0 %	50 %	50 %	344205957
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14477	NC_015947	CGG	2	6	614825	614830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
14478	NC_015947	TGG	2	6	614833	614838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205968
14479	NC_015947	CGGC	2	8	614888	614895	0 %	0 %	50 %	50 %	344205968
14480	NC_015947	GGC	2	6	614936	614941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
14481	NC_015947	CGGA	2	8	614999	615006	25 %	0 %	50 %	25 %	344205968
14482	NC_015947	CCG	2	6	615038	615043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205968
14483	NC_015947	CAC	4	12	615045	615056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205968
14484	NC_015947	CGA	2	6	615089	615094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14485	NC_015947	GCC	2	6	615147	615152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205968
14486	NC_015947	CAG	2	6	615288	615293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14487	NC_015947	TCG	2	6	615325	615330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14488	NC_015947	CGT	2	6	615350	615355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14489	NC_015947	AGT	2	6	615404	615409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205968
14490	NC_015947	CGG	2	6	615411	615416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
14491	NC_015947	CGG	2	6	615449	615454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
14492	NC_015947	TGGCC	2	10	615458	615467	0 %	20 %	40 %	40 %	344205968
14493	NC_015947	CGT	2	6	615485	615490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14494	NC_015947	TCG	2	6	615523	615528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14495	NC_015947	CTT	3	9	615531	615539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205968
14496	NC_015947	AGC	2	6	615564	615569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205968
14497	NC_015947	CGG	2	6	615575	615580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205968
14498	NC_015947	GC	3	6	615650	615655	0 %	0 %	50 %	50 %	344205968
14499	NC_015947	GCGG	2	8	615657	615664	0 %	0 %	75 %	25 %	344205968
14500	NC_015947	GC	4	8	615677	615684	0 %	0 %	50 %	50 %	344205968

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