MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015947	CCG	2	6	549367	549372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205913
13002	NC_015947	GACC	2	8	549430	549437	25 %	0 %	25 %	50 %	344205913
13003	NC_015947	CTG	2	6	549443	549448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205913
13004	NC_015947	GC	3	6	549487	549492	0 %	0 %	50 %	50 %	344205913
13005	NC_015947	CGC	2	6	549520	549525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205913
13006	NC_015947	CAGC	2	8	549539	549546	25 %	0 %	25 %	50 %	344205913
13007	NC_015947	CGG	2	6	549643	549648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205913
13008	NC_015947	GGC	3	9	549686	549694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205913
13009	NC_015947	GCC	2	6	550004	550009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205914
13010	NC_015947	GC	3	6	550044	550049	0 %	0 %	50 %	50 %	344205914
13011	NC_015947	GC	4	8	550099	550106	0 %	0 %	50 %	50 %	344205914
13012	NC_015947	CGG	2	6	550117	550122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205914
13013	NC_015947	GCC	2	6	550142	550147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205914
13014	NC_015947	GGC	2	6	550392	550397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13015	NC_015947	CCG	4	12	550427	550438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13016	NC_015947	CCG	2	6	550445	550450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13017	NC_015947	GCC	2	6	550477	550482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13018	NC_015947	CAG	2	6	550555	550560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13019	NC_015947	TGC	2	6	550595	550600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13020	NC_015947	ACC	2	6	550639	550644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205915
13021	NC_015947	AAC	2	6	550645	550650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205915
13022	NC_015947	CGGC	2	8	550667	550674	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13023	NC_015947	AGA	2	6	550697	550702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205915
13024	NC_015947	CTC	2	6	550714	550719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205915
13025	NC_015947	GCC	3	9	550724	550732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13026	NC_015947	GGT	2	6	550756	550761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205915
13027	NC_015947	TCG	2	6	550775	550780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13028	NC_015947	CGG	2	6	550841	550846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13029	NC_015947	CAT	2	6	550881	550886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205915
13030	NC_015947	CGG	2	6	550917	550922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13031	NC_015947	CGG	2	6	550929	550934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13032	NC_015947	GGC	2	6	550945	550950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13033	NC_015947	TCG	2	6	550973	550978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13034	NC_015947	ACA	2	6	551009	551014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205915
13035	NC_015947	CGG	2	6	551103	551108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13036	NC_015947	GC	4	8	551135	551142	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13037	NC_015947	ACC	2	6	551203	551208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205915
13038	NC_015947	GC	3	6	551219	551224	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13039	NC_015947	CAC	2	6	551274	551279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205915
13040	NC_015947	CGC	2	6	551385	551390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13041	NC_015947	GCA	2	6	551399	551404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13042	NC_015947	TTC	2	6	551410	551415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205915
13043	NC_015947	GTC	2	6	551472	551477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13044	NC_015947	GCT	2	6	551478	551483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13045	NC_015947	CAA	2	6	551490	551495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205915
13046	NC_015947	CG	3	6	551515	551520	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13047	NC_015947	CTT	2	6	551538	551543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205915
13048	NC_015947	CGG	2	6	551550	551555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13049	NC_015947	CAC	2	6	551610	551615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205915
13050	NC_015947	ACTGGG	2	12	551621	551632	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205915
13051	NC_015947	GC	3	6	551650	551655	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13052	NC_015947	AGC	2	6	551656	551661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13053	NC_015947	CGG	2	6	551679	551684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13054	NC_015947	CTG	2	6	551737	551742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13055	NC_015947	CGC	2	6	551756	551761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13056	NC_015947	CGC	2	6	551880	551885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13057	NC_015947	CAA	2	6	551919	551924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205915
13058	NC_015947	GCC	2	6	551998	552003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13059	NC_015947	CCG	3	9	552047	552055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205915
13060	NC_015947	CG	3	6	552054	552059	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13061	NC_015947	ACG	2	6	552071	552076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13062	NC_015947	CTT	2	6	552270	552275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205915
13063	NC_015947	CAA	2	6	552285	552290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205915
13064	NC_015947	GTG	2	6	552331	552336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205915
13065	NC_015947	ACT	2	6	552371	552376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205915
13066	NC_015947	CAA	2	6	552408	552413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205915
13067	NC_015947	GAGC	2	8	552507	552514	25 %	0 %	50 %	25 %	344205915
13068	NC_015947	CGCTG	2	10	552561	552570	0 %	20 %	40 %	40 %	344205915
13069	NC_015947	CGG	2	6	552633	552638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205915
13070	NC_015947	GCA	2	6	552659	552664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205915
13071	NC_015947	CCA	3	9	552695	552703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205915
13072	NC_015947	CTGGA	2	10	552706	552715	20 %	20 %	40 %	20 %	344205915
13073	NC_015947	TAC	2	6	552748	552753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205915
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13075	NC_015947	GCA	2	6	552798	552803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205915
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13078	NC_015947	CG	3	6	552934	552939	0 %	0 %	50 %	50 %	344205915
13079	NC_015947	TCG	2	6	553094	553099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13080	NC_015947	TTC	2	6	553105	553110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205916
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13084	NC_015947	GGC	2	6	553187	553192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205916
13085	NC_015947	GCG	2	6	553200	553205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205916
13086	NC_015947	CCG	2	6	553213	553218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205916
13087	NC_015947	TGG	2	6	553282	553287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205916
13088	NC_015947	GCC	2	6	553357	553362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205916
13089	NC_015947	GCT	2	6	553364	553369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13090	NC_015947	CG	3	6	553400	553405	0 %	0 %	50 %	50 %	344205916
13091	NC_015947	CAG	2	6	553422	553427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13092	NC_015947	GCG	2	6	553464	553469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205916
13093	NC_015947	GGT	3	9	553481	553489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205916
13094	NC_015947	GCG	2	6	553536	553541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205916
13095	NC_015947	CTA	2	6	553553	553558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205916
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13098	NC_015947	GCA	2	6	553598	553603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13099	NC_015947	GGT	2	6	553607	553612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205916
13100	NC_015947	GCC	2	6	553653	553658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205916
13101	NC_015947	ACCA	2	8	553743	553750	50 %	0 %	0 %	50 %	344205916
13102	NC_015947	CTGG	2	8	553775	553782	0 %	25 %	50 %	25 %	344205916
13103	NC_015947	CAG	2	6	553791	553796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13104	NC_015947	CCA	2	6	553823	553828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205916
13105	NC_015947	CTA	2	6	553880	553885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205916
13106	NC_015947	CGG	2	6	553927	553932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205916
13107	NC_015947	CGT	2	6	553933	553938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13108	NC_015947	CAA	2	6	553946	553951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205916
13109	NC_015947	TAC	2	6	554001	554006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205916
13110	NC_015947	CG	3	6	554101	554106	0 %	0 %	50 %	50 %	344205916
13111	NC_015947	CTG	2	6	554133	554138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205916
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13113	NC_015947	TTC	2	6	554238	554243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205916
13114	NC_015947	GC	3	6	554248	554253	0 %	0 %	50 %	50 %	344205916
13115	NC_015947	CAG	2	6	554268	554273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205916
13116	NC_015947	CGC	2	6	554322	554327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205916
13117	NC_015947	CTG	2	6	554328	554333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205916
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13119	NC_015947	TGC	2	6	554344	554349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205916
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13233	NC_015947	CG	3	6	560543	560548	0 %	0 %	50 %	50 %	344205920
13234	NC_015947	CA	3	6	560638	560643	50 %	0 %	0 %	50 %	344205920
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13238	NC_015947	TGG	2	6	560752	560757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205920
13239	NC_015947	CGAT	2	8	560794	560801	25 %	25 %	25 %	25 %	344205920
13240	NC_015947	GGC	2	6	560969	560974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205920
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13247	NC_015947	GTA	2	6	561225	561230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205920
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13251	NC_015947	CGG	2	6	561493	561498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205920
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13336	NC_015947	CG	4	8	565158	565165	0 %	0 %	50 %	50 %	344205924
13337	NC_015947	CTG	2	6	565198	565203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205924
13338	NC_015947	AGCC	2	8	565209	565216	25 %	0 %	25 %	50 %	344205924
13339	NC_015947	CGC	2	6	565224	565229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205924
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13343	NC_015947	GCC	2	6	565306	565311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205924
13344	NC_015947	CAG	3	9	565372	565380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205924
13345	NC_015947	GCC	2	6	565390	565395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205924
13346	NC_015947	CAG	2	6	565396	565401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205924
13347	NC_015947	CGC	2	6	565404	565409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205924
13348	NC_015947	AGCTG	2	10	565428	565437	20 %	20 %	40 %	20 %	344205924
13349	NC_015947	CGC	2	6	565512	565517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205924
13350	NC_015947	AAG	2	6	565588	565593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205924
13351	NC_015947	GCC	2	6	565595	565600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205924
13352	NC_015947	AAG	2	6	565714	565719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205924
13353	NC_015947	GC	3	6	565735	565740	0 %	0 %	50 %	50 %	344205924
13354	NC_015947	TCA	2	6	565751	565756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205924
13355	NC_015947	GCA	2	6	565955	565960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205925
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13357	NC_015947	AAC	2	6	566034	566039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205925
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13477	NC_015947	CTG	2	6	571153	571158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
13478	NC_015947	TC	3	6	571316	571321	0 %	50 %	0 %	50 %	344205931
13479	NC_015947	GAT	2	6	571414	571419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205931
13480	NC_015947	TGGT	2	8	571449	571456	0 %	50 %	50 %	0 %	344205931
13481	NC_015947	ATCC	2	8	571495	571502	25 %	25 %	0 %	50 %	344205931
13482	NC_015947	GCT	2	6	571503	571508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
13483	NC_015947	GCG	2	6	571550	571555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205931
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13485	NC_015947	ATG	2	6	571586	571591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205931
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13489	NC_015947	CTG	2	6	571669	571674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
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13491	NC_015947	TCG	2	6	571700	571705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205931
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13500	NC_015947	GCAG	2	8	571961	571968	25 %	0 %	50 %	25 %	344205932

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