MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015947	CGAC	2	8	508717	508724	25 %	0 %	25 %	50 %	344205870
12002	NC_015947	CTG	2	6	508731	508736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205870
12003	NC_015947	TTC	2	6	508743	508748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205870
12004	NC_015947	CGGC	2	8	508759	508766	0 %	0 %	50 %	50 %	344205870
12005	NC_015947	GGC	2	6	508770	508775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205870
12006	NC_015947	CGC	2	6	508785	508790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205870
12007	NC_015947	GCAT	2	8	508969	508976	25 %	25 %	25 %	25 %	344205871
12008	NC_015947	GTC	2	6	508986	508991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12009	NC_015947	TGG	2	6	509002	509007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205871
12010	NC_015947	TCC	2	6	509038	509043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205871
12011	NC_015947	TGCCGC	2	12	509053	509064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205871
12012	NC_015947	TTC	2	6	509136	509141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205871
12013	NC_015947	CTG	2	6	509142	509147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12014	NC_015947	GCT	2	6	509159	509164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12015	NC_015947	TGGC	2	8	509174	509181	0 %	25 %	50 %	25 %	344205871
12016	NC_015947	TGG	2	6	509242	509247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205871
12017	NC_015947	CTG	2	6	509271	509276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
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12020	NC_015947	CCGA	2	8	509340	509347	25 %	0 %	25 %	50 %	344205871
12021	NC_015947	GCT	2	6	509423	509428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12022	NC_015947	ATG	2	6	509431	509436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205871
12023	NC_015947	GGC	2	6	509468	509473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205871
12024	NC_015947	TGA	2	6	509476	509481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205871
12025	NC_015947	GGCC	2	8	509534	509541	0 %	0 %	50 %	50 %	344205871
12026	NC_015947	CTG	2	6	509640	509645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
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12029	NC_015947	CGC	2	6	509699	509704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205871
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12031	NC_015947	GCA	2	6	509758	509763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205871
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12033	NC_015947	CAT	2	6	509816	509821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205871
12034	NC_015947	TGC	2	6	509827	509832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
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12039	NC_015947	TGG	2	6	509911	509916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205871
12040	NC_015947	CTG	2	6	509958	509963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12041	NC_015947	CGCTG	2	10	509977	509986	0 %	20 %	40 %	40 %	344205871
12042	NC_015947	CTG	2	6	509991	509996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
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12044	NC_015947	CCG	2	6	510005	510010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205871
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12047	NC_015947	GT	3	6	510097	510102	0 %	50 %	50 %	0 %	344205871
12048	NC_015947	GC	3	6	510144	510149	0 %	0 %	50 %	50 %	344205871
12049	NC_015947	CGG	2	6	510172	510177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205871
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12052	NC_015947	CAG	2	6	510330	510335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12053	NC_015947	TGA	2	6	510340	510345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205871
12054	NC_015947	TGC	2	6	510380	510385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
12055	NC_015947	CTG	2	6	510399	510404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205871
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12091	NC_015947	CCTT	2	8	512225	512232	0 %	50 %	0 %	50 %	344205875
12092	NC_015947	GCC	2	6	512305	512310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205875
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12099	NC_015947	TGGGG	2	10	512484	512493	0 %	20 %	80 %	0 %	344205875
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12101	NC_015947	CGG	3	9	512619	512627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205876
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12110	NC_015947	GCG	2	6	512822	512827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205876
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12112	NC_015947	CTG	2	6	512959	512964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205876
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12114	NC_015947	CCT	2	6	513108	513113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205876
12115	NC_015947	TCA	2	6	513123	513128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205876
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12229	NC_015947	GATC	2	8	517814	517821	25 %	25 %	25 %	25 %	344205882
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12237	NC_015947	CG	3	6	518205	518210	0 %	0 %	50 %	50 %	344205883
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12240	NC_015947	CGA	2	6	518279	518284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205883
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12355	NC_015947	ACG	2	6	523525	523530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205888
12356	NC_015947	TCA	3	9	523531	523539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205888
12357	NC_015947	CCG	2	6	523545	523550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205888
12358	NC_015947	CGGG	2	8	523627	523634	0 %	0 %	75 %	25 %	344205888
12359	NC_015947	GTG	2	6	523644	523649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205888
12360	NC_015947	CGGTG	2	10	523694	523703	0 %	20 %	60 %	20 %	344205888
12361	NC_015947	GAAGGG	2	12	523748	523759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205888
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12364	NC_015947	GCC	2	6	523992	523997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205889
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12376	NC_015947	TGC	2	6	524247	524252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205889
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12462	NC_015947	GGCGA	2	10	527952	527961	20 %	0 %	60 %	20 %	344205893
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12464	NC_015947	GCCC	2	8	528085	528092	0 %	0 %	25 %	75 %	344205893
12465	NC_015947	GAA	2	6	528102	528107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205893
12466	NC_015947	GCCCTG	2	12	528120	528131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205893
12467	NC_015947	GCCG	2	8	528149	528156	0 %	0 %	50 %	50 %	344205893
12468	NC_015947	TGG	2	6	528172	528177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205893
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12470	NC_015947	GGT	2	6	528212	528217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205893
12471	NC_015947	GTT	2	6	528227	528232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205893
12472	NC_015947	CATC	2	8	528256	528263	25 %	25 %	0 %	50 %	344205893
12473	NC_015947	GC	3	6	528654	528659	0 %	0 %	50 %	50 %	344205894
12474	NC_015947	AGCGC	2	10	528740	528749	20 %	0 %	40 %	40 %	344205894
12475	NC_015947	CAC	3	9	528789	528797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205894
12476	NC_015947	CGCC	2	8	528887	528894	0 %	0 %	25 %	75 %	344205894
12477	NC_015947	ACC	2	6	528895	528900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205894
12478	NC_015947	CGA	2	6	528911	528916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205894
12479	NC_015947	CG	3	6	528918	528923	0 %	0 %	50 %	50 %	344205894
12480	NC_015947	CAC	2	6	529032	529037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205894
12481	NC_015947	GC	3	6	529041	529046	0 %	0 %	50 %	50 %	344205894
12482	NC_015947	CTG	2	6	529101	529106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205894
12483	NC_015947	CGA	2	6	529133	529138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205894
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12486	NC_015947	TGCG	2	8	529259	529266	0 %	25 %	50 %	25 %	344205894
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12498	NC_015947	CGG	2	6	529749	529754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205895
12499	NC_015947	GAA	2	6	529762	529767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205895
12500	NC_015947	GTCCA	2	10	529769	529778	20 %	20 %	20 %	40 %	344205895

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